114 年 國立臺灣海洋大學食品科學系碩士班生物科技組《微生物學》

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第 1 題2 分

I. Choose one appropriate answer for each of the following questions (2% each, total 20%)

  1. Which of the following cannot be autoclaved?
    a) Glass
    b) Sodium chloride solution
    c) Pipette tips
    d) Vaccines

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本題考驗高壓滅菌(Autoclaving)的適用性。高壓滅菌是利用高溫高壓(通常為 121°C,15 psi)來殺滅微生物,常用於滅菌實驗器材、培養基等。然而,某些物質在高溫高壓下可能會發生變性、分解或爆炸,因此不適用高壓滅菌。

(a) 玻璃(Glass):玻璃製品通常能耐高溫高壓,是高壓滅菌的常用滅菌對象。
(b) 氯化鈉溶液(Sodium chloride solution):高濃度的鹽溶液本身也具有一定的抑菌效果,且其化學性質穩定,耐高溫高壓,可透過高壓滅菌來滅菌。

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第 2 題2 分

  1. Food are preserved with all of the following except
    a) Sodium nitrate.
    b) Sodium propionate.
    c) Potassium sorbate.
    d) Bisphenols.

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本題考驗食品保存的常見方法和使用的化學抑菌劑。食品保存的目的是抑制或殺滅微生物的生長,延長食品的保質期。

(a) 硝酸鈉(Sodium nitrate):常作為亞硝酸鹽的前驅物,在醃製肉製品(如火腿、香腸)中,可以抑制肉毒桿菌(Clostridium botulinum)的生長,同時也提供肉製品的粉紅色澤和特殊風味。
(b) 丙酸鈉(Sodium propionate):是一種常見的食品防腐劑,尤其對黴菌和酵母菌有較好的抑制效果,常用於麵包、糕點等烘焙食品。

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第 3 題2 分

  1. Which of the following statement is false?
    a) DNA polymerase joins nucleotides in one direction only.
    b) The leading strand of DNA is made continuously.
    c) The lagging strand of DNA is started by a DNA primer.
    d) DNA replication proceeds in two directions around the bacterial chromosome.

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核心觀念

本題考查細菌 DNA 複製的基本機制,包括:

  1. DNA polymerase 的合成方向。
  2. leading strand 與 lagging strand 的合成方式。
  3. DNA primer 的種類。
  4. 細菌環狀染色體的複製方向。

DNA polymerase 只能將新的核苷酸接到既有核酸鏈的 3′3'-OH 端,因此新 DNA 鏈一律以:

5′→3′5' \rightarrow 3'

方向合成。DNA 複製開始時,需要由 primase 合成一小段 RNA primer,提供 DNA polymerase 所需的 3′3'-OH 端。

解題方法

判斷各選項是否符合 DNA 複製的三項基本原則:

  • DNA polymerase 只能進行 5′→3′5' \rightarrow 3' 合成。
  • leading strand 可配合複製叉前進而連續合成。
  • lagging strand 必須分段合成,且每一段都由 RNA primer 啟動。
  • 細菌環狀染色體通常由單一複製起點開始,形成兩個複製叉,向相反方向進行。

其中最容易混淆的是 primer 的種類:DNA 複製所需的 primer 是 RNA primer,不是 DNA primer。

選項分析

a) DNA polymerase joins nucleotides in one direction only.

此敘述正確。

DNA polymerase 只能將新核苷酸接到正在延長之 DNA 鏈的 3′3'-OH 端,因此新鏈的合成方向固定為:

5′→3′5' \rightarrow 3'

DNA polymerase 無法直接以 3′→5′3' \rightarrow 5' 方向合成 DNA。

b) The leading strand of DNA is made continuously.

此敘述正確。

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第 4 題2 分

  1. The value of cDNA in recombinant DNA is that
    a) It lacks exons.
    b) It lacks introns.
    c) It's really RNA.
    d) None of the above.

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本題考驗 cDNA(complementary DNA,互補 DNA)在基因工程中的價值。cDNA 是通過逆轉錄酶(reverse transcriptase)以 mRNA 為模板合成的 DNA。

mRNA 是由基因轉錄而來,但經過剪接(splicing)過程,去除了內含子(introns),只保留了外顯子(exons)。因此,mRNA 攜帶的是基因的蛋白質編碼序列。

cDNA 的特點:

  1. 缺乏內含子(introns):由於 mRNA 中沒有內含子,因此以 mRNA 為模板合成的 cDNA 也就不含有內含子。
  2. 僅包含外顯子(exons):cDNA 包含的是 mRNA 中所有的外顯子序列,這些序列直接編碼蛋白質。
  3. 是 DNA 形式:cDNA 是 DNA 分子,具有 DNA 的穩定性,可以被插入到載體中進行複製、表達等。

在基因工程中,使用 cDNA 的主要優勢是:

  • 簡化基因結構:當需要在大腸桿菌等原核生物中表達真核生物的基因時,由於原核生物缺乏剪接機制,無法去除內含子,直接使用基因組 DNA(gDNA)會導致無法產生功能性蛋白質。
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第 5 題2 分

  1. Which of the organism naturally possesses the Ti?
    a) Thermus aquaticus
    b) Agrobacterium tumefaciens
    c) Saccharomyces cerevisiae
    d) Bacillus thuringiensis

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本題考驗對植物病原菌 Agrobacterium tumefaciens 及其獨特能力的理解。Ti 質體(Tumor-inducing plasmid)是該菌株攜帶的一個重要質體。

Agrobacterium tumefaciens(根癌農桿菌)是一種土壤細菌,以其能夠誘導植物產生腫瘤(根癌)的能力而聞名。這種能力源於它攜帶的 Ti 質體。Ti 質體包含 T-DNA(transfer DNA)區域,該區域可以在特定條件下轉移到植物細胞的基因組中,並整合到植物 DNA 中。T-DNA 中含有誘導植物細胞不受控制生長(形成腫瘤)和合成異常代謝物(如類鴉片酸,opines)的基因。

Agrobacterium tumefaciens 的 Ti 質體是植物基因工程中常用的載體,因為它可以將外源基因高效地整合到植物基因組中。

分析選項:
a) Thermus aquaticus:這是一種耐高溫的細菌,是 Taq 聚合酶的來源,與 Ti 質體無關。

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第 6 題2 分

  1. If two organisms have similar rRNA sequences, you can conclude that
    a) They live in the same place.
    b) They evolved from a common ancestor.
    c) They will have different G-C ratios.
    d) They will both ferment lactose.

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本題考驗分子演化學和系統發生學的基本原理,特別是 rRNA 在分類學上的應用。

rRNA(核糖體 RNA)在所有生物體中都普遍存在,並且在細胞功能上高度保守。然而,在 rRNA 的序列中,也存在著隨時間演化的變異。這些變異的速率相對較慢且穩定,因此 rRNA 序列的相似性可以反映生物體之間的親緣關係。

如果兩個生物體具有相似的 rRNA 序列,這意味著它們在演化歷史上分歧的時間相對較近,或者它們在該序列上經歷的突變較少。這最直接的推論是它們擁有一個共同的祖先,並且在演化上是近親。

分析選項:
a) They live in the same place. (牠們生活在同一個地方) - 生物體的地理分佈受多種因素影響(如棲息地、食物來源、氣候等),僅憑 rRNA 序列相似性無法推斷其地理位置。
b) They evolved from a common ancestor. (牠們演化自一個共同的祖先) - rRNA 序列的相似性是衡量親緣關係的指標,相似的序列通常意味著較近的共同演化歷史,因此可以推斷它們演化自一個共同的祖先。這是最直接且合理的結論。

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第 7 題2 分

  1. A species can best be defined as
    a) A taxon composed of families.
    b) A taxon belonging to a genus.
    c) A taxon comprised of classes.
    d) The most specific taxon.

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本題考驗生物分類學中的「物種」(species)定義。在生物分類學中,物種是基本的分類單位,也是最基礎的分類等級。

生物分類學的等級結構通常是:界(Kingdom)、門(Phylum/Division)、綱(Class)、目(Order)、科(Family)、屬(Genus)、種(Species)。在這個層級結構中,種是最小、最基礎的分類單位,所有更高級別的分類單元(如屬、科、綱等)都是由更低級別的單位組成的。

分析選項:
a) A taxon composed of families. (由科組成的分類單元) - 科(Family)是由屬(Genus)組成的,而屬是由種(Species)組成的。所以,一個「由科組成的分類單元」指的是「目」(Order)。
b) A taxon belonging to a genus. (屬於某個屬的分類單元) - 這是對「種」的正確描述。一個物種是屬於一個特定的屬。
c) A taxon comprised of classes. (由綱組成的分類單元) - 綱(Class)是由目(Order)組成的,目是由科(Family)組成的,科是由屬(Genus)組成的,屬是由種(Species)組成的。所以,一個「由綱組成的分類單元」指的是「界」(Kingdom)或「門」(Phylum/Division)。
d) The most specific taxon. (最基礎的分類單元) - 這也是對「種」的正確描述。

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第 8 題2 分

  1. Latent viruses are present in cells as
    a) Capsids.
    b) Enzymes.
    c) Proviruses.
    d) None of the above.

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本題考驗對潛伏性病毒(Latent viruses)在宿主細胞內存在的形式的理解。潛伏性病毒是指那些能夠在宿主細胞內長期存在,但通常不引起明顯症狀的病毒。在適當的條件下,它們可以重新活化並進入複製週期。

潛伏性病毒在宿主細胞內主要以兩種形式存在:

  1. 原病毒(Provirus):對於某些 RNA 病毒(如反轉錄病毒)或 DNA 病毒,它們的遺傳物質會整合到宿主細胞的染色體 DNA 中,成為宿主基因組的一部分。這種整合形式的病毒基因組被稱為原病毒。原病毒可以隨著宿主細胞的分裂而傳遞給子代細胞。
  2. 潛伏性病毒顆粒(Latent viral particles):對於某些 DNA 病毒(如疱疹病毒),它們可以以獨立的 DNA 分子形式存在於細胞核中,不整合到宿主染色體,但也不進行複製或僅進行極少量的複製,處於不活躍狀態。

題目問的是「Latent viruses are present in cells as」,需要找出病毒潛伏狀態下的存在形式。

分析選項:
a) Capsids. (衣殼) - 衣殼是病毒顆粒的蛋白質外殼,包含病毒的遺傳物質。

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第 9 題2 分

  1. Which of the following is most likely to be bactericidal?
    a) Membrane filtration
    b) Ionizing radiation
    c) Lyophilization
    d) Deep-freezing

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本題考驗不同滅菌或抑菌方法的原理和效果。Bactericidal 指的是殺滅細菌的行為,而 bacteriostatic 則是抑制細菌生長。題目要求選出「most likely to be bactericidal」(最可能殺滅細菌的)。

a) 膜過濾(Membrane filtration):這是一種物理方法,通過具有特定孔徑的濾膜,將細菌等微生物從液體或氣體中去除。它是一種「去除」微生物的方法,而不是「殺滅」微生物。過濾後的濾膜上保留了細菌,但細菌本身可能仍然存活。
b) 電離輻射(Ionizing radiation):例如伽馬射線(γ-rays)或電子束(electron beams)。電離輻射具有很高的能量,可以破壞微生物的 DNA,細胞膜和其他重要分子,導致其死亡。這是一種有效的殺滅微生物的方法,常被用於滅菌。
c) 凍乾(Lyophilization):也稱為冷凍乾燥。這是一種通過冷凍後在真空下昇華冰晶來去除水分的方法。凍乾可以顯著降低水分活度,抑制微生物的生長,但並非所有微生物都能被完全殺滅。許多細菌孢子或耐旱微生物可以在凍乾後存活,並在重新獲得水分後恢復活性。

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第 10 題2 分

  1. The DNA probe, 3'-GGCTTA, will hybridize with which of the following?
    a) 5'-CCGUUA
    b) 5'-GGCTTA
    c) 3'-CCGAAT
    d) 5'-CCGAAT

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核心觀念

DNA 雙股核酸以「互補鹼基配對」及「反向平行」方式形成雙股:

  • AA 與 TT 配對
  • GG 與 CC 配對

題目給出的 DNA probe 為:

3′−GGCTTA−5′3'-GGCTTA-5'

其互補股必須按照反向平行方向排列,因此應為:

5′−CCGAAT−3′5'-CCGAAT-3'

所以關鍵不只是找互補序列,也要確認兩股的 5′5' 與 3′3' 方向相反。

解題方法

逐一依照鹼基配對規則排列:

Probe互補鹼基
3′−G3'-GC−5′C-5'
3′−G3'-GC−5′C-5'
3′−C3'-CG−5′G-5'
3′−T3'-TA−5′A-5'
3′−T3'-TA−5′A-5'
3′−A3'-AT−5′T-5'

若將互補股依正常書寫方向由 5′5' 端寫到 3′3' 端,即為:

5′−CCGAAT−3′5'-CCGAAT-3'

因此正確選項為 d。

選項分析

a) 5′−CCGUUA5'-CCGUUA

錯誤。雖然其方向為 5′5' 到 3′3',但序列並非 probe 的完整互補序列:

  • GG 應與 CC 配對
  • CC 應與 GG 配對
  • TT 應與 AA 配對
  • DNA 中的 TT 不應以此序列中的 UU 取代
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第 II-(1) 題6 分

What are the roles of promoter, terminator, and mRNA in transcription?

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核心觀念

轉錄是以 DNA 的一股作為模板,由 RNA 聚合酶合成 RNA 的過程。RNA 聚合酶沿 DNA 模板股讀取方向為 3′→5′3' \to 5',並以 5′→3′5' \to 3' 方向合成 RNA。

  • 啟動子(promoter):位於基因轉錄起始點上游的 DNA 序列,是 RNA 聚合酶及相關轉錄因子辨識、結合並啟動轉錄的位置。啟動子也參與決定轉錄起始位置與方向。
  • 終止子(terminator):使 RNA 聚合酶停止轉錄並釋出新生 RNA 的 DNA 序列。細菌中可透過 RNA 形成髮夾結構並促使轉錄終止,或由 Rho 蛋白參與終止;真核生物的轉錄終止機制則依 RNA 聚合酶種類而異。
  • 信使 RNA(mRNA):轉錄產物之一,攜帶由 DNA 複製而來的遺傳訊息。在蛋白質合成時,核糖體讀取 mRNA 的密碼子,以此作為合成多肽的模板。

解題方法

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第 II-(2) 題6 分

How does lysogenic cycle of phage differ from its lytic cycle?

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核心觀念

本題考查噬菌體感染細菌後的兩種增殖途徑:溶原循環(lysogenic cycle)與溶菌循環(lytic cycle)。關鍵在於噬菌體基因體進入宿主後,是先以潛伏狀態與宿主共存,還是立即大量複製並破壞宿主細胞。

解題方法

比較兩種循環時,可依序看三件事:噬菌體基因體的狀態、是否立即製造新噬菌體,以及宿主細胞的命運。

比較項目溶原循環溶菌循環
基因體狀態噬菌體基因體整合進細菌染色體,或以其他方式在細胞內維持;整合於染色體中的噬菌體基因體稱為前噬菌體(prophage)噬菌體基因體立即表現並進行複製
新噬菌體產生潛伏期間通常不大量製造完整噬菌體製造噬菌體核酸與蛋白質,組裝成新的噬菌體
宿主細胞命運細菌存活並分裂,前噬菌體可隨宿主染色體一同複製、傳給子細胞新噬菌體釋出時,通常使細菌細胞裂解死亡
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第 II-(3) 題8 分

PCR is a useful method for carrying out DNA recombination. What is PCR? Try to point out the meanings or effects of each individual temperature.

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核心觀念

PCR(聚合酶連鎖反應,polymerase chain reaction)是在試管中,利用耐熱型 DNA 聚合酶與兩條引子,反覆複製特定 DNA 片段的方法。反應液通常含有模板 DNA、正向與反向引子、dNTP、DNA 聚合酶及適當的緩衝液;溫度循環則依序完成 DNA 變性、引子退火與 DNA 延伸。理想狀況下,每循環使目標片段數量約增為兩倍,經 nn 個循環後可近似表示為 2n2^n 倍增,但實際反應會受效率與試劑耗減影響。美國國家醫學圖書館 PCR 說明

PCR 主要用途是擴增 DNA,本身不等同於 DNA 重組;在 DNA 重組實驗中,可利用帶有同源重疊序列的引子,透過重疊延伸 PCR(overlap-extension PCR)將不同 DNA 片段接合,或引入指定突變。此題主要考查 PCR 的原理,以及各階段溫度對反應的作用。

解題方法:依溫度循環順序說明

典型 PCR 會在熱循環儀中重複以下三個步驟。實際溫度與時間須依聚合酶種類、引子序列及模板特性調整。

階段常用溫度作用
初始變性約 9494–98∘C98^\circ\mathrm{C}使雙股 DNA 分開;也可協助活化部分熱啟動型聚合酶。
變性(denaturation)約 9494–98∘C98^\circ\mathrm{C}每循環使雙股 DNA 解離成單股,讓引子能接觸互補序列。
退火(annealing)常約 5050–65∘C65^\circ\mathrm{C}降溫使引子與模板上的互補序列配對。溫度依引子的熔解溫度 TmT_m 設定,常以略低於 TmT_m 作為起始條件,再視結果最佳化。
延伸(extension)常約 72∘C72^\circ\mathrm{C}耐熱 DNA 聚合酶由引子末端開始,依模板序列加入 dNTP,合成新 DNA 鏈。
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第 II-(4) 題10 分

Please describe five different ways to insert the heterogeneous DNA into cells.

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核心觀念

本題考查將外源(異源)DNA送入受體細胞的方式。外源 DNA 進入細胞後,可能以染色體外 DNA 形式存在,也可能整合進宿主染色體;是否能表現,還取決於 DNA 是否含有適合該宿主的啟動子、複製起點及其他調控序列。

題目未限定細胞種類,因此以下列出五種常見的基因導入方法,涵蓋細菌與真核細胞。

解題方法:五種導入方式

  1. 化學轉形/轉染(chemical transformation/transfection)
    對細菌,可用氯化鈣等化學處理使細胞暫時具有攝取質體 DNA 的能力,再以熱休克促進 DNA 進入細胞,此法稱為化學轉形。對真核細胞,可用磷酸鈣沉澱或脂質體包覆 DNA,使細胞攝取 DNA,此類操作常稱為轉染。

  2. 電穿孔(electroporation)
    將細胞與外源 DNA 混合後施加短暫電場,使細胞膜短時間形成孔洞,DNA 因而進入細胞。電穿孔可用於細菌、酵母及多種動植物細胞;電場條件須配合細胞種類調整,以兼顧導入效率與細胞存活率。

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第 第二部分-(1) 題15 分

Please define microorganisms and describe the characteristics of different types of microorganisms.

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核心觀念

本題考查「微生物」的定義,以及不同類群在細胞構造、遺傳物質、繁殖方式與營養型態上的差異。微生物是體型微小、通常需藉助顯微鏡觀察的生物或感染性因子;「微生物」是依研究與觀察尺度形成的分類概念,並非單一的分類階層。

多數微生物由單一細胞構成,也包含部分微小的多細胞生物。病毒沒有細胞構造,須在宿主細胞內複製,嚴格而言不屬於細胞生物;但在微生物學中仍常與微生物一併研究。

解題方法

作答時先界定「微生物」的範圍,再依主要類群逐項比較。每一類至少交代其細胞型態、重要構造及繁殖或生存方式,並特別區分原核生物、真核生物與非細胞性因子。

不同類型微生物的特徵

類群細胞與構造主要特徵及繁殖方式
細菌原核生物,沒有膜狀細胞核及膜狀胞器;通常具有細胞膜與細胞壁,細胞壁主要含肽聚醣常見形態有球菌、桿菌與螺旋菌;多以二分裂繁殖。代謝多樣,可為異營或自營、需氧或厭氧,也有兼性厭氧菌。部分種類能形成內生孢子以耐受不利環境。
古菌原核生物,沒有膜狀細胞核;細胞膜脂質及細胞壁組成與細菌不同,通常不含肽聚醣形態與部分生理特徵可類似細菌,但在分子與生化特性上形成獨立類群。許多古菌能生活於高溫、高鹽、酸性或缺氧環境;甲烷生成作用只見於古菌。
真菌真核生物,具有細胞核及膜狀胞器;細胞壁主要含幾丁質包括酵母菌、黴菌及大型真菌。酵母菌多為單細胞,可出芽或分裂;黴菌由菌絲構成,常以孢子繁殖。
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第 第二部分-(2) 題5 分

Please outline the steps involved in the Gram staining procedure and explain its underlying principle.

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核心觀念

革蘭氏染色(Gram stain)是鑑別染色法,利用細菌細胞壁結構差異,觀察細胞在脫色步驟後能否保留結晶紫—碘複合物。染色結果可初步分為革蘭氏陽性菌與革蘭氏陰性菌。標準流程包含初染、媒染、脫色及複染四個步驟。美國微生物學會染色流程

解題方法與操作步驟

答題時依序交代製備抹片、四個染色步驟及觀察結果,並說明脫色是決定染色結果的關鍵步驟。

  1. 製備抹片與固定:將菌液薄薄塗在玻片上,風乾後以熱固定,使細菌附著於玻片。避免抹片過厚,否則染色與脫色不均。
  2. 初染:以結晶紫(crystal violet)覆蓋抹片,再以水沖洗。此時革蘭氏陽性菌與陰性菌都呈紫色。
  3. 媒染:加入革蘭氏碘液(Gram’s iodine),再以水沖洗。碘作為媒染劑,與結晶紫形成較大的結晶紫—碘複合物。
  4. 脫色:以乙醇、丙酮或其混合液短暫處理,隨即以水沖洗停止脫色。脫色時間須控制得當,是全程最關鍵的一步。
  5. 複染:以番紅(safranin)染色,再以水沖洗並吸乾玻片。以油鏡觀察:紫色細菌判為革蘭氏陽性,粉紅或紅色細菌判為革蘭氏陰性。
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第 第二部分-(3) 題5 分

Please differentiate between homofermentative and heterofermentative lactic acid fermentation.

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核心觀念

本題要比較乳酸菌將葡萄糖發酵時的代謝途徑、主要終產物與能量產率。判別重點是:葡萄糖主要走哪一條代謝途徑,以及碳最後分配到哪些產物。

  • 同型乳酸發酵(homofermentative):主要以糖解作用的 EMP 途徑分解葡萄糖,乳酸是幾乎唯一的主要發酵終產物。
  • 異型乳酸發酵(heterofermentative):主要經由磷酸戊糖-磷酸酮解酶途徑分解葡萄糖,除乳酸外,也產生乙醇及二氧化碳。

「同型」和「異型」指的是發酵產物的種類,不是菌體形態或是否只產生單一代謝物。參考資料指出,同型乳酸菌主要經 EMP 途徑產生乳酸;異型乳酸菌則經磷酸酮解酶途徑產生多種產物。NCBI《Medical Microbiology》、威斯康辛大學乳酸菌教材

解題方法

作答時依序比較「途徑、產物、ATP 淨產量」,並用每莫耳葡萄糖的總反應式呈現差異。

同型乳酸發酵

葡萄糖經 EMP 途徑形成兩分子丙酮酸,再由乳酸脫氫酶將丙酮酸還原成乳酸;此反應同時氧化 NADH,回收 NAD⁺,讓糖解作用可以持續進行。

葡萄糖+2ADP+2Pi→2乳酸+2ATP+2H2O\text{葡萄糖} + 2\text{ADP} + 2\text{P}_{i} \rightarrow 2\text{乳酸} + 2\text{ATP} + 2\text{H}_{2}\text{O}

每莫耳葡萄糖的淨產量為 2 莫耳乳酸與 2 莫耳 ATP。

異型乳酸發酵

葡萄糖經磷酸戊糖-磷酸酮解酶途徑分解,產生的碳流分別形成乳酸、乙醇及二氧化碳;乙醇形成過程可消耗 NADH,協助再生 NAD⁺。

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第 第二部分-(4) 題5 分

Please list the essential factors required for bacterial growth.

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核心觀念

細菌生長是指細胞合成細胞成分並分裂,使族群數量增加。要支持生長,培養環境須同時提供足夠的營養與能量,並維持該菌種可生長的物理、化學條件。不同細菌的需求不同,因此「必需因子」是指符合特定菌種需求的因子,不代表所有細菌都需要同一種碳源或氧氣。OpenStax:微生物生長需求

解題方法

可把題目拆成兩部分回答:細菌需要哪些物質作為營養與代謝來源,以及環境需維持哪些適合生長的條件。

  1. 營養與代謝所需物質

    • 水分:提供代謝反應與物質運輸所需的環境;重點是可利用水分。
    • 碳源與能量來源:碳用於合成細胞有機物;能量用於生合成、運輸及維持細胞功能。異營菌可利用有機物,自營菌可利用二氧化碳作為碳源;能量可來自化學反應,也可由光取得。
    • 主要元素:碳、氫、氧、氮、磷、硫,常以 CHONPS 表示。氮、磷、硫分別用於胺基酸與核酸、核酸與磷脂、含硫胺基酸等細胞成分。
    • 礦物質與微量元素:如鉀、鎂、鈣、鐵,以及鋅、錳、銅、鉬等;常作為酵素輔因子或細胞結構成分。
    • 生長因子:某些細菌無法自行合成特定物質,需由環境提供,例如維生素、胺基酸、嘌呤或嘧啶。
  2. 適合生長的環境條件

    • 溫度:須落在該菌的最低與最高生長溫度之間,且最適溫度下生長最快。
    • 酸鹼值(pH):須符合該菌的耐受範圍;多數常見細菌偏好接近中性的環境。
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第 第二部分-(5) 題5 分

Please describe the methods used to measure bacterial growth.

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核心觀念

細菌生長是指細胞數目或細胞物質增加。測量細菌生長的方法,可依測量對象分成三類:

  1. 細胞數目:直接計數細胞,或計算能形成菌落的活菌數。
  2. 細胞量:測量菌體濁度、乾重或體積。
  3. 代謝活性:測量細胞消耗養分或產生代謝物的速率,間接推估生長。

若要描繪生長曲線,需在培養期間定時取樣,並以相同方法測量各時間點的細菌量。

解題方法:依測量原理分類

一、活菌計數法

將菌液連續稀釋後,取已知體積塗布或混入培養基,培養後計算菌落數。一般假設一個菌落由一個可繁殖的細胞或細胞團形成,因此結果以菌落形成單位表示為 CFU/mL。

計算公式為:

CFU/mL=菌落數×稀釋倍數接種體積(mL)\text{CFU/mL} = \frac{\text{菌落數}\times\text{稀釋倍數}}{\text{接種體積(mL)}}

例如,將原菌液稀釋至 10−510^{-5},取 0.1 mL0.1\ \text{mL} 塗布後得到 80 個菌落:

CFU/mL=80×1050.1=8.0×107\text{CFU/mL} = \frac{80\times10^{5}}{0.1} = 8.0\times10^{7}

常見操作包括平板塗布法與平板混入法。此法可反映能在指定培養條件下繁殖的細菌數;但無法計入不可培養的活菌,細胞成團時也會低估細胞總數。

**最可能數法(MPN)**將不同稀釋度的菌液接種至多管培養基,依陽性管數查統計表推估活菌數,適合菌數較低或樣本不易直接計數的情況。

膜過濾法將一定體積的液體通過濾膜,使細菌留在膜上,再把濾膜放置於培養基培養並計算菌落,適合低菌數的大體積樣本。

二、直接細胞計數法

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第 第二部分-(6) 題5 分

Please compare chemically defined media and complex media, highlighting their differences.

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核心觀念

本題考查培養基的分類,關鍵在於培養基中各成分的化學組成是否明確。

  • 化學成分確定培養基(chemically defined medium):每種成分的化學身分與添加量都已知,可明確列出培養基的組成。
  • 複合培養基(complex medium):含有酵母抽出物、蛋白腖、肉類抽出物等成分;這些原料由多種物質組成,確切的化學成分與比例無法逐一確定。

解題方法

比較兩類培養基時,先抓住「成分是否確定」這個分類標準,再延伸比較其用途、優點與限制。判斷時不可只看培養基是否含有豐富營養,也要看每種成分的實際化學組成是否已知。

比較項目化學成分確定培養基複合培養基
組成每種化學成分及其添加量明確含複雜的生物來源原料,確切組成不完全明確
常見成分特定糖類、無機鹽、胺基酸、維生素等蛋白腖、酵母抽出物、肉類抽出物等
可重現性高,容易控制各成分的濃度較低,原料批次差異可能造成組成變動
主要用途研究特定營養需求、代謝與基因調控一般培養、菌種維持,或培養營養需求較複雜的微生物
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第 第二部分-(7) 題5 分

What are the purposes of using selective media and differential media in microbiology?

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核心觀念

本題考查培養基如何協助分離與辨認微生物:

  • 選擇性培養基(selective medium):加入特定抑制物,抑制某些微生物生長,讓目標微生物較容易生長或被分離。用途是篩選、分離特定類群。
  • 鑑別性培養基(differential medium):加入特定基質與指示劑,依微生物的代謝或生化特性產生可觀察的差異,例如菌落顏色或培養基顏色改變。用途是區分不同微生物。

選擇性描述「哪些微生物能生長」,鑑別性描述「生長後呈現什麼差異」。兩種功能可以同時存在於同一培養基。

解題方法

先抓住題目中的兩個目的:一是控制微生物的生長範圍,二是觀察微生物之間的表型差異。答題時分別說明培養基的作用,再各舉一例即可。

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第 第二部分-(8) 題5 分

Please describe the phases of the bacterial growth curve.

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核心觀念

這題考查細菌在封閉式培養中的典型生長曲線。培養基中的營養物質逐漸耗盡,代謝廢物逐漸累積,因此細菌族群會依序經歷四個時期:遲滯期、對數期、穩定期、衰亡期。

生長曲線通常以培養時間為橫軸、活菌數的對數為縱軸。曲線呈現的是整個族群的變化,不代表每個細菌都以相同速度生長。

解題方法

作答時依照生長曲線的時間順序,說明各期的細胞數變化、生理狀態與主要成因,即可完整描述。

1. 遲滯期(lag phase)

細菌進入新培養環境後,先調整生理狀態以適應新的營養與環境條件。細胞會合成所需的酵素、核酸及其他細胞成分,為後續分裂做準備。

此時活菌數通常沒有明顯增加,但細胞仍有代謝活動。遲滯期長短會受菌種、接種菌齡、接種量,以及新舊培養環境差異影響。

2. 對數期(log phase 或 exponential phase)

細菌以接近固定的世代時間快速分裂,族群數呈指數增加。若每個世代細胞數加倍,則經過 nn 個世代後:

N=N02nN=N_0 2^n

其中 N0N_0 為起始細胞數,NN 為培養後的細胞數。對數期的細胞生理狀態較一致,常用於研究細菌的生理特性、抗菌劑作用及生長速率。

若已知培養時間 tt,世代數可由下式求得:

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