111 年 國立成功大學細胞生物與解剖研究所《細胞生物學》
第 一、名詞解釋 題40 分
以細胞生物學觀點解釋以下名詞。任選10題作答,超過10題不計分。
- Ribosome
- Apoptosis
- Chaperone protein
- Chromatin
- DNA methylation
- Induced pluripotent stem cell (iPSC)
- Glycolysis
- Small interfering RNA (siRNA)
- Metastasis
- Autophagy
- Restriction nuclease
- Synapse
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本部分為名詞解釋題,總共列出12個詞彙,考生需從中任選10題作答,每題4分,總計40分。此處僅列出題幹,無標準答案。考生需依據細胞生物學的知識,對每個詞彙進行精確且具體的解釋。
以下提供幾個範例的解釋方向:
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Ribosome: 核糖體是細胞質中負責蛋白質合成的細胞器,由核糖體RNA (rRNA) 和蛋白質組成,分為大、小次單元。它能讀取mRNA上的遺傳密碼,並將胺基酸組合成多肽鏈。
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Apoptosis: 細胞凋亡是一種程序性細胞死亡,是維持組織穩態的重要生理過程。它涉及一系列細胞內事件,包括細胞收縮、染色質凝集、DNA斷裂,最終形成凋亡小體,被吞噬細胞清除,避免引起發炎反應。
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Chaperone protein: 輔助因子蛋白(或稱分子伴侶)是一類在細胞內協助其他蛋白質正確摺疊、組裝、運輸和降解的蛋白質。它們可以防止蛋白質在合成或壓力條件下發生錯誤摺疊,維持蛋白質的結構和功能。
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Chromatin: 染色質是位於真核細胞核內,由DNA與組蛋白(histone)等蛋白質緊密纏繞形成的複合物。它是染色體的主要組成成分,負責將極長的DNA分子壓縮,並在基因表現調控中扮演重要角色。
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DNA methylation: DNA甲基化是表觀遺傳調控的一種機制,指在DNA分子上,特別是胞嘧啶(cytosine)的第五個碳原子上,添加一個甲基基團(-CH3)。它通常發生在CpG dinucleotides,並與基因沉默有關。
第 二、問答題 1 題15 分
Mitosis is a process in which a eukaryotic cell undergoes chromosome replication and cell division, giving rise to two genetically identical daughter cells. What exactly happens during mitosis? Your answers must include all the various phases for chromosome duplication, separation, and division of the cell. (15%)
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此題考查細胞分裂中的「有絲分裂」(Mitosis)過程,要求考生詳細說明其各個階段的事件,特別是染色體的複製、分離與細胞的分裂。
有絲分裂是真核細胞進行無性生殖或生長、修復的方式,其結果是產生兩個與母細胞遺傳物質完全相同的子細胞。這個過程主要包含下列幾個階段:
1. 間期 (Interphase)
雖然間期不是有絲分裂本身,但它是細胞準備進入分裂的必要階段,包含三個時期:
- G1期 (Gap 1):細胞生長,合成蛋白質和RNA,為DNA複製做準備。
- S期 (Synthesis):DNA複製的時期。在S期結束時,每個染色體都包含兩個緊密結合的姊妹染色分體(sister chromatids)。
- G2期 (Gap 2):細胞繼續生長,合成紡錘體所需的蛋白質,並檢查DNA複製的準確性。
2. 有絲分裂期 (M phase)
有絲分裂期又可細分為核分裂(Mitosis)和細胞質分裂(Cytokinesis)。核分裂包含以下階段:
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前期 (Prophase):
- 染色質開始縮集,變得越來越短、粗,最終形成肉眼可見的染色體。
- 每個染色體由兩個姊妹染色分體組成,透過著絲點(centromere)連接。
- 核仁(nucleolus)消失。
- 中心體(centrosome)開始向細胞兩極移動,並形成紡錘絲(spindle fibers),構成紡錘體(mitotic spindle)。
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前中期 (Prometaphase):
- 核膜(nuclear envelope)破裂,細胞質與核內的染色體混合。
- 紡錘絲開始附著在染色體著絲點上的動原體(kinetochore)上。
- 染色體開始在細胞中央移動。
第 二、問答題 2 題15 分
The shape and internal organization of a eukaryotic cell are maintained by filamentous proteins generally called the cytoskeleton. These specialized proteins are important for numerous cell behaviors as well. What are the main components of the cytoskeleton? Your answers must include both the structure and function of microfilaments, intermediate filaments, and microtubules. (15%)
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此題考查真核細胞的細胞骨架(Cytoskeleton)系統。考生需要闡述細胞骨架的主要組成成分,並詳細說明微絲(microfilaments)、中間絲(intermediate filaments)和微管(microtubules)的結構與功能。
細胞骨架是細胞質中一個動態的、由蛋白質纖維組成的網絡,它提供細胞結構支撐,維持細胞形態,並參與細胞運動、物質運輸、細胞分裂等重要過程。細胞骨架主要由三種蛋白質纖維構成:
1. 微絲 (Microfilaments)
- 結構: 主要由肌動蛋白(actin)單體聚合而成,形成雙股螺旋結構。微絲通常較細(直徑約7奈米),具有極性(-端和+端),可以在+端快速聚合,在-端快速解聚,使其具有動態不穩定性。
- 功能:
- 維持細胞形狀: 在細胞皮質(cortex)形成網絡,支撐細胞膜,維持細胞形態。
- 細胞運動: 參與細胞爬行運動(如變形蟲運動)、肌肉收縮(與肌球蛋白協同作用)。
- 細胞質流動 (Cytoplasmic streaming):在植物細胞和某些大型動物細胞中,協助胞器在細胞質中移動。
- 細胞分裂: 在動物細胞中,形成收縮環,參與細胞質分裂。
- 細胞內運輸: 協助胞器在細胞質中的移動。
2. 中間絲 (Intermediate Filaments)
- 結構: 由多種蛋白質(如角蛋白Keratin、波形蛋白Vimentin、神經絲Neurofilaments、核纖層Lamins等)構成,結構比微絲和微管更為粗大(直徑約8-12奈米),且結構穩定,無極性。它們通常形成堅韌的繩索狀結構,相互纏繞。
- 功能:
- 機械強度: 提供細胞和組織卓越的機械強度和抵抗拉伸的能力,防止細胞被拉扯破裂。
第 二、問答題 3 題15 分
Many substances are transferred across the cell membrane by specialized transport proteins, which provide critical cross-membrane passageways other than diffusion. What are membrane transport proteins? Your answers must be focused on the principle, structure, and mechanism of both transporters and channels. (15%)
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此題考查細胞膜上的「膜運輸蛋白」(Membrane Transport Proteins)。考生需要定義膜運輸蛋白,並著重闡述其結構、原理及通道蛋白(channels)與載體蛋白(transporters)兩大類型的作用機制。
膜運輸蛋白是嵌入或附著於細胞膜上的蛋白質,負責調控物質進出細胞的過程。它們提供了除了單純擴散(simple diffusion)之外,更具選擇性和效率的跨膜運輸途徑。膜運輸蛋白主要分為兩大類:離子通道(Ion Channels)和載體蛋白(Transporters)。
1. 膜運輸蛋白的結構與原理
- 結構: 大部分膜運輸蛋白是整合性膜蛋白(integral membrane proteins),它們具有疏水性的跨膜結構域,能夠嵌入脂質雙層。許多運輸蛋白由多個跨膜α螺旋構成,形成一個孔道或一個能夠改變構象的結構。
- 原理: 運輸蛋白的作用原理是基於物質的濃度梯度或電化學梯度(對於離子),或藉助能量(ATP水解或另一種物質的梯度)來推動物質跨膜。它們提供了一個水性的通道或一個能夠結合特定溶質的位點,從而實現跨膜運輸。
2. 離子通道 (Ion Channels)
- 結構: 通常由數個跨膜蛋白質亞基組成,圍繞中央形成一個親水性的離子通道。這些通道具有選擇性,只允許特定大小和電荷的離子通過。
- 原理與機制:
- 擴散性運輸 (Facilitated diffusion):離子通道允許離子順著其電化學梯度快速通過膜,無需消耗額外能量。
- 門控機制 (Gating):大多數離子通道具有門(gate),可以打開或關閉,調節離子的通過。門控的類型包括:
- 電壓門控 (Voltage-gated):對膜電位的變化敏感,如神經細胞的鈉離子通道。
- 配體門控 (Ligand-gated):需要與特定分子(配體)結合後才能打開,如神經遞質受體。
- 機械門控 (Mechanically-gated):對機械力(如拉伸)敏感。
第 二、問答題 4 題15 分
COVID-19 is caused by the infection of a coronavirus, whose genetic code RNA can be accurately detected by real time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). What is RT-PCR? Please focus your answers on the principle of this nuclear technology and its differences from the regular PCR. (15%)
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好的,這題是關於「即時反轉錄聚合酶鏈式反應 (RT-PCR)」的原理及其與一般 PCR 的差異。這題主要考驗你對分子生物學中核酸檢測技術的理解,特別是 RNA 的偵測與放大。
解題過程
什麼是 RT-PCR?
RT-PCR (Real-time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction) 是一種結合了反轉錄 (Reverse Transcription, RT) 和即時聚合酶鏈式反應 (Real-time PCR, qPCR) 的分子生物學技術。它的主要目的是偵測和定量 RNA 分子,特別是當目標 RNA 的量非常少時。
RT-PCR 的原理:
RT-PCR 的原理可以分為兩個主要步驟:
- 反轉錄 (Reverse Transcription, RT):
- 為什麼要反轉錄? PCR 技術是針對 DNA 設計的,它能夠將特定的 DNA 片段進行指數級的放大。然而,COVID-19 的病原體是冠狀病毒,其遺傳物質是 RNA。因此,在進行 PCR 放大之前,必須將 RNA 轉化為 DNA。
- 如何進行? 這個步驟利用一種稱為「反轉錄酶 (Reverse Transcriptase)」的酵素。反轉錄酶是一種從 RNA 模板合成互補 DNA (complementary DNA, cDNA) 的酵素。
- 具體過程:
- 首先,需要一個引子 (primer) 來結合到目標 RNA 分子上。引子可以是隨機引子 (random primers)、寡聚(dT)引子 (oligo(dT) primers) 或特異性引子 (gene-specific primers)。
- 反轉錄酶以引子為起始點,利用 RNA 分子作為模板,合成一條與 RNA 互補的 DNA 鏈,這條 DNA 鏈稱為 cDNA。
- 如果使用寡聚(dT)引子,它會結合到 RNA 的 poly(A) 尾上,合成所有 mRNA 的 cDNA。