109 年 國立高雄大學生命科學系碩士班《生物化學》

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第 1 題

  1. Which of the following statements is true?
    (A) Xylose is a tetrose.
    (B) D-galactose and D-glucose are epimeric at C-4.
    (C) The anomer of α\alpha-D-glucopyranose is α\alpha-L-glucopyranose.
    (D) Sucrose is a reducing sugar.
    (E) Mild oxidation of β\beta-D-glucopyranose with alkaline Cu(II)\text{Cu(II)} (Fehling's solution) produces D-glucuronic acid.

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本題主要在測試學生對醣類基本結構、命名規則、異構物關係以及氧化還原性質的了解。

各選項分析:

(A) 葡萄糖、果糖、半乳糖都是六碳醣(hexose)。木糖(Xylose)是五碳醣(pentose)。因此 (A) 錯誤。
(B) D-葡萄糖和 D-半乳糖在 C-4 位置的構型不同,它們是差向異構物(epimer)。因此 (B) 正確。
(C) α\alpha-D-glucopyranose 和 α\alpha-L-glucopyranose 是對映異構物(enantiomers),而不是異頭物(anomers)。異頭物是指環狀單醣在形成異頭碳(anomeric carbon)時,由於碳的構型不同而產生的兩種異構物,例如 α\alpha-D-glucopyranose 和 β\beta-D-glucopyranose。因此 (C) 錯誤。
(D) 蔗糖(Sucrose)是由葡萄糖的 C-1 和果糖的 C-2 透過醣苷鍵連接而成,此鍵涉及到兩個單醣的異頭碳,因此蔗糖沒有游離的異頭碳,是非還原醣。因此 (D) 錯誤。
(E) 葡萄糖的溫和氧化(如使用 Fehling's solution)會氧化異頭碳(C-1),生成羧基,得到葡萄糖酸(glucuronic acid)。

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第 2 題

  1. Which of the following statements is not true?
    (A) Monitoring changes in the amount of glycosylated hemoglobin is an especially useful means of assessing the effectiveness of treatments for diabetes mellitus.
    (B) Dolichol phosphate is the mediator of N-linked glycoproteins which acquired the initial sugars in the golgi.
    (C) Glycosaminoglycans are acidic (anionic), through the presence of either sulfate or carboxylate groups.
    (D) Chitin is a homopolymer of acetylgalactosamine with β\beta (1→4) linkages.
    (E) The most common linkages between sugar residues in disaccharides, oligosaccharides and polysaccharides is absent 1→ 5.

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核心觀念

本題考查醣類生物化學,包括:

  • 糖化血紅素(glycosylated hemoglobin, HbA1c)與糖尿病控制。
  • N-linked glycoprotein 的醣鏈合成與 dolichol phosphate。
  • Glycosaminoglycans(GAGs)的帶電性。
  • Chitin 的單體與鍵結形式。
  • 醣類之間常見的糖苷鍵。

解題方法

逐一核對各選項與標準定義。單醣聚合物的判斷重點是:

  1. 單體是哪一種胺基糖。
  2. 糖苷鍵連接的位置,例如 β(1→4)\beta(1\rightarrow4)。
  3. 合成位置與功能是否正確,例如 N-linked glycosylation 的醣鏈先在內質網組裝,再於高基氏體修飾。

選項分析

(A) 正確

糖化血紅素 HbA1c 是血紅素胺基端的胺基與葡萄糖發生非酵素性糖化所形成,比例可反映紅血球壽命期間、約 2~3 個月的平均血糖狀況。

因此,追蹤 HbA1c 的變化,可以評估糖尿病治療是否有效。此敘述正確。

(B) 錯誤

Dolichol phosphate 是 N-linked glycoprotein 醣鏈合成的重要脂質載體,但初始醣鏈不是在高基氏體(Golgi)開始取得。

正確流程如下:

  1. Dolichol phosphate 位於內質網膜上。
  2. 醣類先逐步接到 dolichol phosphate 上,形成 dolichol-linked oligosaccharide。
  3. 醣鏈翻轉至內質網腔面。
  4. 完整的寡醣鏈一次轉移至蛋白質的天門冬醯胺(Asn)殘基。
  5. 蛋白質進入高基氏體後,再進行修剪與進一步醣基化。

所以,若依題目字面「initial sugars acquired in the Golgi」判斷,B 的合成位置錯誤。

(C) 正確

Glycosaminoglycans 是帶負電的酸性多醣,負電性主要來自:

  • 硫酸基(−SO3−-\mathrm{SO_3^-})。
  • 羧酸鹽基(−COO−-\mathrm{COO^-})。

例如 heparin、heparan sulfate 含有大量硫酸基;hyaluronan 則主要依靠羧酸鹽基帶負電。因此此敘述正確。

(D) 錯誤

Chitin 並不是 acetylgalactosamine 的同聚物,而是:

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第 3 題

  1. Which of the following statements is not true?
    (A) Most naturally occurring fatty acids contain an even number of carbon atoms.
    (B) If double bonds are present (unsaturation), they are usually cis form.
    (C) The 90% spermaceti oil is a mixture of triacylglycerols and waxes containing an abundance of saturated fatty acids.
    (D) Waxes are formed by esterification of fatty acids and long-chain alcohols, which can serve energy stores and water repellents.
    (E) The major composition of olive oil is C16 and C18 unsaturated fatty acids.

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核心觀念

本題考查脂肪酸與蠟類脂質的基本特性,包括:

  • 天然脂肪酸的碳鏈長度與雙鍵構型。
  • 蠟的化學組成與生理功能。
  • 精子鯨蠟(spermaceti)與橄欖油的主要成分。

蠟(waxes)是由長鏈脂肪酸與長鏈一元醇酯化形成的酯類:

長鏈脂肪酸+長鏈醇→蠟酯+H2O\text{長鏈脂肪酸}+\text{長鏈醇} \rightarrow \text{蠟酯}+\mathrm{H_2O}

蠟與三酸甘油酯(triacylglycerols, TAGs)不同:TAG 是甘油與三分子脂肪酸形成的酯,而蠟則是脂肪酸與長鏈醇形成的酯。

解題方法

題目問「not true」,因此逐一檢查各選項是否符合脂質的基本知識。判斷重點如下:

  1. 天然脂肪酸通常具有偶數碳。
  2. 天然不飽和脂肪酸的雙鍵通常為 cis 型。
  3. 蠟的組成應以脂肪酸與長鏈醇形成的蠟酯為主,不應將 TAG 視為蠟的主要組成。
  4. 橄欖油主要含有 C16C_{16} 與 C18C_{18} 脂肪酸,其中以不飽和脂肪酸為主。

選項分析

(A) Most naturally occurring fatty acids contain an even number of carbon atoms.

正確。

天然脂肪酸多由乙醯輔酶 A(acetyl-CoA)以兩個碳為單位逐步延長而形成,因此碳鏈通常含有偶數個碳原子,例如:

  • 棕櫚酸(palmitic acid):C16:0C_{16:0}
  • 硬脂酸(stearic acid):C18:0C_{18:0}
  • 油酸(oleic acid):C18:1C_{18:1}

雖然自然界也存在少量奇數碳脂肪酸,但不是主要形式。

(B) If double bonds are present (unsaturation), they are usually cis form.

正確。

天然不飽和脂肪酸的雙鍵通常為 cis 型。cis 雙鍵會使脂肪酸碳鏈產生彎曲,降低分子排列的緊密程度,因而降低熔點並增加膜的流動性。

例如油酸的結構為:

C18:1 cis-Δ9C_{18:1}\ cis\text{-}\Delta^9

相較之下,反式(trans)脂肪酸的碳鏈較為直線,物理性質更接近飽和脂肪酸;天然脂質中的 trans 雙鍵比例通常較低。

**(C) The 90% spermaceti oil is a mixture of triacylglycerols and waxes containing an abundance of satura

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第 4 題

  1. Which of the following statements is not true?
    (1) The lipids of archaeal membranes do not contain a carboxylic acid ester, but instead have an ether link to the glycerol.
    (2) A suspension of triacylglycerols and glycerophospholipids is most likely to form a liposome.
    (3) If a bacterium such as E. coli is shifted from a warmer growth temperature to a cooler growth temperature, it compensates by adding more unsaturated fatty acids into its membranes.
    (4) Human B blood type is determined by the expression of a-1,3-N-galactosylaminyltransferase.
    (5) Phosphatidylserine is exclusively in the inner leaflet of the plasma membrane of the human erythrocyte membrane and is wildly used in apoptosis detection.
    (A) 1 and 3
    (B) 2 and 4
    (C) 3 and 5
    (D) only 4
    (E) only 5

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核心觀念

本題考查膜脂質的結構與功能,重點包括:

  1. 古生菌膜脂質的醚鍵。
  2. 三酸甘油酯與甘油磷脂形成膜結構的能力。
  3. 細菌對溫度變化的膜流動性調節。
  4. ABO 血型抗原的醣基轉移酶。
  5. 磷脂醯絲胺酸(phosphatidylserine, PS)的膜不對稱分布與細胞凋亡偵測。

題目要求找出「不正確」的敘述。

解題方法

逐項核對各敘述所涉及的生化定義,特別注意:

  • 膜脂質中的酯鍵與醚鍵差異。
  • 能否形成脂雙層。
  • ABO 血型所連接的末端醣種類。
  • PS 在正常細胞與凋亡細胞中的位置變化。

選項分析

(1)正確

古生菌膜脂質通常由異戊二烯衍生的疏水鏈與甘油骨架構成,疏水鏈和甘油之間以醚鍵連接:

glycerol-O-alkyl\text{glycerol-O-alkyl}

相較之下,細菌與真核生物的常見膜脂質多以脂肪酸和甘油形成酯鍵:

glycerol-O-C(=O)-R\text{glycerol-O-C(=O)-R}

因此,古生菌膜脂質不含典型的脂肪酸羧酸酯鍵,而以醚鍵連接疏水鏈,此敘述正確。

(2)正確

三酸甘油酯(triacylglycerol, TAG)是中性脂質,主要作為能量儲存形式,無法自行形成穩定的脂雙層。

甘油磷脂具有:

  • 親水性的磷酸基團;
  • 疏水性的脂肪酸鏈;
  • 明顯的兩親性。

在水溶液中,甘油磷脂會自發排列形成脂雙層,並封閉成脂質體(liposome)。因此,含有甘油磷脂的懸浮系統最容易形成脂質體;TAG則多半形成疏水性的油滴或被包埋於脂質結構中。

故此敘述在考試所要求的主要膜脂質判斷下為正確。

(3)正確

細菌會進行「恆定黏度適應」(homeoviscous adaptation)。

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第 5 題

  1. Once acetylcholine binds to its receptor in the postsynaptic membrane, the membrane first becomes to open ____ channel, resulting in a depolarization. Then, followed by an outward flow of ____ resulting in a hyperpolarization.
    (A) Ca2+\text{Ca}^{2+}, Cl−\text{Cl}^{-}
    (B) K+\text{K}^{+}, Cl−\text{Cl}^{-}
    (C) Na+\text{Na}^{+}, Ca2+\text{Ca}^{2+}
    (D) Na+\text{Na}^{+}, K+\text{K}^{+}
    (E) Na+\text{Na}^{+}, Cl−\text{Cl}^{-}

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本題主要測試學生對神經傳導過程中,乙醯膽鹼(acetylcholine, ACh)受體結合後引起的離子通道變化及膜電位改變的理解。

解題步驟:

  1. 乙醯膽鹼受體與離子通道: 乙醯膽鹼結合的受體通常是離子通道偶聯受體(ligand-gated ion channels)。在神經肌肉接頭(neuromuscular junction)或某些神經元突觸,乙醯膽鹼受體是離子通道。
  2. 興奮性突觸後電位(EPSP): 當乙醯膽鹼結合受體後,通常會打開一個允許陽離子(特別是 Na+\text{Na}^{+},有時也包括 Ca2+\text{Ca}^{2+})流入細胞的通道。陽離子內流導致細胞膜內側正電性增加,稱為去極化(depolarization),這會使膜電位朝向閾值移動,是興奮性突觸後電位(EPSP)的產生。
  3. 抑制性突觸後電位(IPSP): 抑制性神經傳導則通常涉及 Cl−\text{Cl}^{-} 的內流或 K+\text{K}^{+} 的外流,這會使膜電位變得更負,稱為超極化(hyperpolarization),或使膜電位更難達到閾值。

題目敘述分析:

  • 「the membrane first becomes to open ____ channel, resulting in a depolarization.」:去極化是由陽離子內流引起的。最常見的是 Na+\text{Na}^{+} 內流。
  • 「Then, followed by an outward flow of ____ resulting in a hyperpolarization.」:超極化是由負離子內流或陽離子外流引起的。題目描述的是「outward flow」,這通常是指陽離子 K+\text{K}^{+} 的外流,因為細胞內 K+\text{K}^{+} 濃度高於細胞外, K+\text{K}^{+} 傾向於外流,這會使細胞膜內側負電性增加。

綜合以上分析:

  • 第一個空格(引起去極化)最可能填入 Na+\text{Na}^{+}。
  • 第二個空格(引起超極化)最可能填入 K+\text{K}^{+}。
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第 6 題

  1. The equivalent of ____ high-energy phosphates and ____ water molecules are consumed per mole of glucose synthesized by gluconeogenesis.
    (A) 6, 6
    (B) 6, 11
    (C) 11, 6
    (D) 4, 11
    (E) 4, 11

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核心觀念

本題考查每合成 1 mol 葡萄糖時,糖質新生作用(gluconeogenesis)的總能量消耗與水分子消耗量。

由 2 mol 丙酮酸(pyruvate)合成 1 mol 葡萄糖,必須繞過糖解作用中不可逆的三個步驟。其中需要能量的反應共有:

  • 丙酮酸羧化酶:消耗 2 ATP
  • 磷酸烯醇丙酮酸羧激酶:消耗 2 GTP
  • 磷酸甘油酸激酶逆反應:消耗 2 ATP

因此:

4 ATP+2 GTP=64\ \mathrm{ATP}+2\ \mathrm{GTP}=6

ATP 與 GTP 都含有可水解的高能磷酸鍵,因此合計消耗 6 個高能磷酸鍵當量。

解題方法

糖質新生作用由 2 mol 丙酮酸合成 1 mol 葡萄糖,其完整總反應可寫成:

2 pyruvate+4 ATP+2 GTP+2 NADH+6 H2O→glucose+4 ADP+2 GDP+6 Pi+2 NAD+2\ \mathrm{pyruvate} +4\ \mathrm{ATP} +2\ \mathrm{GTP} +2\ \mathrm{NADH} +6\ \mathrm{H_2O} \rightarrow \mathrm{glucose} +4\ \mathrm{ADP} +2\ \mathrm{GDP} +6\ \mathrm{P_i} +2\ \mathrm{NAD^+}

由此直接得到:

  • 高能磷酸鍵當量:4+2=64+2=6
  • 消耗水分子:66
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第 7 題

  1. The metabolism of propionic acid (propionate) derived from odd-chain fatty acid degradation require
    1.biotin, 2. cobalamin, 3. niacin, 4. pyridoxine, 5. riboflavin, 6. thiamine.
    (A) 1 and 2
    (B) 2 and 3
    (C) 3 and 4
    (D) 4 and 5
    (E) 5 and 6

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本題測試學生對奇數碳鏈脂肪酸代謝的了解,特別是丙酸(propionic acid)代謝過程中所需的輔酶。

奇數碳鏈脂肪酸代謝:
奇數碳鏈脂肪酸(odd-chain fatty acids)在進行 β\beta-氧化時,最終會產生一個含有奇數碳原子的中間產物,即丙酸(propionic acid)。丙酸接著進入三羧酸循環(TCA cycle)的代謝途徑。

丙酸的代謝途徑:
丙酸的代謝分為三個步驟:

  1. 活化: 丙酸被CoA連接酶(CoA ligase)活化,消耗 ATP,生成丙醯輔酶A(propionyl-CoA)。此步驟需要生物素(biotin)作為輔酶,因為丙酸羧化酶(propionyl-CoA carboxylase)負責將 CO2\text{CO}_2 轉移到丙酸上。
    Propionate + ATP\text{ATP} + CO2\text{CO}_2 → Propionyl-CoA + ADP\text{ADP} + Pi\text{Pi}
    此反應催化劑為 丙酸羧化酶 (Propionyl-CoA carboxylase),輔酶為 生物素 (biotin)。

  2. 甲基丙二醯輔酶A(Methylmalonyl-CoA)的形成: 丙醯輔酶A 異構化酶(propionyl-CoA mutase)催化丙醯輔酶A 轉化為甲基丙二醯輔酶A(methylmalonyl-CoA)。此步驟需要維生素 B12\text{B}_{12}(cobalamin)作為輔酶。
    Propionyl-CoA → Methylmalonyl-CoA

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第 8 題

  1. (A) Maltose, (B) Lactose, (C) Sucrose, (D) Trehalose, (E) Cellobiose is available primarily as an artificial sweetener, derived from starch.

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本題測試學生對常見雙醣結構、來源及其在食品工業中應用的了解。

各選項分析:

(A) 麥芽糖 (Maltose):由兩分子葡萄糖組成,透過 α\alpha-(1→4) 醣苷鍵連接。它是澱粉(starch)部分水解的產物,在啤酒釀造等過程中重要。麥芽糖甜度低於蔗糖,但可作為甜味劑。
(B) 乳糖 (Lactose):由葡萄糖和半乳糖組成,透過 β\beta-(1→4) 醣苷鍵連接。是牛奶中的主要醣類,甜度低。
(C) 蔗糖 (Sucrose):由葡萄糖和果糖組成,透過 α\alpha-(1→2) 醣苷鍵連接。是食糖的主要成分,甜度最高,廣泛作為甜味劑。蔗糖可以通過酶法從甜菜或甘蔗中提取,也可以通過化學方法合成。
(D) 海藻糖 (Trehalose):由兩分子葡萄糖組成,透過 α\alpha,α\alpha-(1→1) 醣苷鍵連接。在昆蟲、酵母、植物等中存在,甜度約為蔗糖的 45%。海藻糖可以從澱粉酶促轉化(enzymatic conversion of starch)獲得,或通過酵母發酵生產。
(E) 纖維二醣 (Cellobiose):由兩分子葡萄糖組成,透過 β\beta-(1→4) 醣苷鍵連接。是纖維素(cellulose)部分水解的產物。纖維素不易水解,纖維二醣的甜度較低,通常不作為主要甜味劑。

人工甜味劑的定義與來源:
人工甜味劑(artificial sweetener)是指在不提供顯著熱量的情況下,提供比蔗糖更強甜味的物質。常見的人工甜味劑包括阿斯巴甜(aspartame)、糖精(saccharin)、三氯蔗糖(sucralose)等。

題目問哪個是「人工甜味劑」,並且「derived from starch」。
這裡的敘述可能存在誤解。題目問的是「which of the following... is available primarily as an artificial sweetener, derived from starch.」
這句話可以理解為:以下哪個選項,主要作為人工甜味劑,並且可以從澱粉中獲得。

  • 從澱粉中獲得: 麥芽糖 (A) 和海藻糖 (D) 可以通過酶法水解澱粉獲得。
  • 作為甜味劑: 麥芽糖、蔗糖、海藻糖、乳糖、纖維二醣都具有甜味,但甜度不同。蔗糖是標準甜味劑。麥芽糖和海藻糖也可用作甜味劑。
  • 人工甜味劑: 通常是指非醣類或結構與天然醣類差異很大的高強度甜味劑。

重新解讀題目:
題目問的是「哪個是「人工甜味劑」,並且「來自澱粉」。
然而,選項 A, B, C, D, E 都是天然存在的雙醣,它們本身並不是「人工甜味劑」。
「人工甜味劑」通常指非醣類的化學合成物。

可能性一:題目問的是「天然甜味劑」或「糖類甜味劑」
如果題目是問哪個是「甜味劑」並且「來自澱粉」,那麼麥芽糖 (A) 和海藻糖 (D) 比較符合。

可能性二:題目將「人造甜味劑」的定義誤用,或者指「可以從澱粉轉化而來的,具有甜味的物質」
如果我們將「artificial sweetener」理解為「可以被利用作為商業甜味劑」,並且「derived from starch」,那麼:

  • 麥芽糖 (A) 是澱粉水解產物,甜度低於蔗糖,但可用作甜味劑。
  • 海藻糖 (D) 可以通過酶法從澱粉轉化,甜度約為蔗糖的一半。

可能性三:題目將「人造甜味劑」與「來自澱粉」的兩個條件分開理解,或者其中一個條件是關鍵。
如果關鍵是「來自澱粉」,那麼 A 和 D 是首選。
如果關鍵是「人工甜味劑」,那麼選項 A-E 都不符合。

再仔細看題目敘述: "(A) Maltose, (B) Lactose, (C) Sucrose, (D) Trehalose, (E) Cellobiose is available primarily as an artificial sweetener, derived from starch."
這句話的結構是:[列表] is available primarily as an artificial sweetener, derived from starch.
這表示,在列出的選項中,有一個是「主要作為人工甜味劑」,並且「來自澱粉」。

這個題目設計似乎有問題,因為 A-E 都是天然雙醣,不是人工甜味劑。
但如果我們必須選擇一個最接近的,考慮「來自澱粉」和「可用作甜味劑」這兩個條件。

  • 麥芽糖 (A):來自澱粉(澱粉水解),甜度較低,可用作甜味劑。
  • 海藻糖 (D):可以從澱粉酶促轉化得到,甜度約為蔗糖的一半,可用作甜味劑。
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第 9 題

  1. Which of the following enzymes can catalyze hydrogen peroxide into water?
  2. catalase, 2. oxidase, 3. oxygenase, 4. peroxidase, 5. superoxide dismutase.
    (A) Only 1
    (B) only 5
    (C) 1 and 5
    (D) 1 and 4
    (E) 4 and 5

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本題測試學生對幾種氧化還原酶的了解,特別是它們與過氧化氫(hydrogen peroxide, H2O2\text{H}_2\text{O}_2)的關係。

酶的功能分析:

  1. 過氧化氫酶 (Catalase): 催化過氧化氫分解為水和氧氣。
    2H2O2→2H2O+O22\text{H}_2\text{O}_2 \rightarrow 2\text{H}_2\text{O} + \text{O}_2
    此酶可以將 H2O2\text{H}_2\text{O}_2 轉化為水。

  2. 氧化酶 (Oxidase): 通常指利用氧氣作為最終電子受體,將底物氧化,自身被還原為水的酶。例如,細胞色素 c 氧化酶。它與 H2O2\text{H}_2\text{O}_2 的直接轉化關係不大,除非是某些特殊的氧化酶。

  3. 氧合酶 (Oxygenase): 將氧氣分子(O2\text{O}_2)的一個或兩個氧原子併入底物的酶。例如,單加氧酶(monooxygenase)和雙加氧酶(dioxygenase)。它們不直接將 H2O2\text{H}_2\text{O}_2 轉化為水。

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第 10 題

  1. Which of the following metabolic pathways is not the possible fate of oxaloacetate (OAA)?
    (A) OAA ↔\leftrightarrow phosphoenolpyruvate
    (B) OAA ↔\leftrightarrow pyruvate
    (C) OAA ↔\leftrightarrow aspartate
    (D) OAA ↔\leftrightarrow glutamate
    (E) OAA ↔\leftrightarrow malate

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本題測試學生對三羧酸循環(TCA cycle)中間產物草醯乙酸(oxaloacetate, OAA)的代謝去向的理解。

草醯乙酸(OAA)的代謝去向:
草醯乙酸是三羧酸循環中的一個關鍵中間產物,它有幾個主要的代謝途徑:

  1. 與乙醯輔酶A縮合,進入三羧酸循環:
    OAA + Acetyl-CoA → Citrate (此為 TCA 循環的起始反應)

  2. 轉化為磷烯醇丙酮酸(PEP):
    OAA 經過草醯乙酸羧化酶(pyruvate carboxylase)和磷烯醇丙酮酸羧激酶(PEP carboxykinase)的作用,可以轉化為磷烯醇丙酮酸(PEP)。這是糖質新生(gluconeogenesis)的關鍵步驟。
    OAA ↔\leftrightarrow PEP (此反應是雙向的,但在糖質新生中是 OAA → PEP)

  3. 轉化為丙酮酸(Pyruvate):
    OAA 可以通過磷烯醇丙酮酸羧激酶(PEP carboxykinase)先轉化為 PEP,然後 PEP 再轉化為丙酮酸。反之,丙酮酸也可以通過丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase)轉化為 OAA。
    OAA ↔\leftrightarrow PEP ↔\leftrightarrow Pyruvate
    因此,OAA 可以轉化為丙酮酸。

  4. 轉化為天冬胺酸(Aspartate):
    OAA 可以通過轉胺酶(transaminase,也稱為 aminotransferase)催化,與穀氨酸(glutamate)反應,生成天冬胺酸(aspartate)和 α\alpha-酮戊二酸(α\alpha-ketoglutarate)。
    OAA + Glutamate ↔\leftrightarrow Aspartate + α\alpha-ketoglutarate

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第 11 題

  1. Which of the following enzymes does not catalyze CO2\text{CO}_2 production?
    (1) isocitrate dehydrogenase
    (2) α\alpha- ketoglutarate dehydrogenase
    (3) succinate dehydrogenase
    (4) pyruvate dehydrogenase
    (5) malate dehydrogenase
    (A) only 2
    (B) only 5
    (C) 1 and 3
    (D) 3 and 5
    (E) 2 and 4

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這一題的完整詳解

本題測試學生對三羧酸循環(TCA cycle)及丙酮酸代謝過程中,哪些酶催化反應會產生 CO2\text{CO}_2 的知識。

各酶催化反應分析:

  1. 異檸檬酸脫氫酶 (Isocitrate dehydrogenase): 催化異檸檬酸(isocitrate)氧化脫羧,生成 α\alpha-酮戊二酸(α\alpha-ketoglutarate)。此反應產生 CO2\text{CO}_2。
    Isocitrate + NAD+\text{NAD}^{+} → α\alpha-ketoglutarate + NADH\text{NADH} + CO2\text{CO}_2

  2. α\alpha-酮戊二酸脫氫酶複合物 (α\alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex): 催化 α\alpha-酮戊二酸氧化脫羧,生成琥珀醯輔酶A(succinyl-CoA)。此反應產生 CO2\text{CO}_2。
    α\alpha-ketoglutarate + NAD+\text{NAD}^{+} + CoA → Succinyl-CoA + NADH\text{NADH} + CO2\text{CO}_2

  3. 琥珀酸脫氫酶 (Succinate dehydrogenase): 催化琥珀酸(succinate)氧化為富馬酸(fumarate)。此反應是 TCA 循環中唯一一個直接連接到電子傳遞鏈的步驟(FAD 接受電子),但它不產生 CO2\text{CO}_2。

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第 12 題

  1. ____ decreases both oxygen consumption and ATP synthesis, but ____ increases oxygen consumption while decreasing ATP synthesis.
    (A) Rotenone, 2,4-dinitrophenol
    (B) Oligomycin, 2,4-dinitrophenol
    (C) 2,4-Dinitrophenol, Oligomycin
    (D) Oligomycin A, rotenone
    (E) 2,4-Dinitrophenol, rotenone

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這一題的完整詳解

本題測試學生對電子傳遞鏈抑制劑和解偶聯劑(uncouplers)如何影響氧氣消耗和 ATP 合成的理解。

各物質的作用分析:

  • Oligomycin (寡黴素): 是一種 ATP 合成酶(ATP synthase)的抑制劑。它結合在 ATP 合成酶的 F0\text{F}_0 亞基上,阻止質子(H+\text{H}^{+})通過 ATP 合成酶流回基質。

    • 影響: 阻止質子流動,直接抑制 ATP 的合成。由於質子無法通過 ATP 合成酶流回,它們會在膜間隙積聚,形成更大的質子梯度。這會反過來阻礙電子傳遞鏈繼續氧化還原,導致電子傳遞鏈的速率下降,從而降低氧氣消耗。
    • 結論: Oligomycin 降低氧氣消耗,並降低 ATP 合成。
  • Rotenone (魚藤酮): 是一種電子傳遞鏈複合物 I(NADH\text{NADH} 脫氫酶)的抑制劑。

    • 影響: 阻斷來自 NADH\text{NADH} 的電子進入電子傳遞鏈,從而抑制整個電子傳遞鏈的活動。這會導致質子梯度無法建立,ATP 合成停止。同時,由於電子傳遞被阻斷,氧氣消耗也會降低。
    • 結論: Rotenone 降低氧氣消耗,並降低 ATP 合成。
  • 2,4-Dinitrophenol (2,4-二硝基苯酚, DNP): 是一種典型的解偶聯劑(uncoupler)。它是一種親脂性小分子,能夠將質子從膜間隙帶回基質,繞過 ATP 合成酶。

    • 影響: 儘管電子傳遞鏈仍在運行(因為質子可以通過 DNP 流回),但質子梯度產生的能量不再用於 ATP 合成,而是以熱能的形式散失。這會導致 ATP 合成降低,但電子傳遞鏈為了維持質子流動而加速運行,從而增加氧氣消耗。
    • 結論: 2,4-Dinitrophenol 增加氧氣消耗,並降低 ATP 合成。

題目要求:

  • 第一個空格:____ decreases both oxygen consumption and ATP synthesis.

    • 符合這個描述的是 Oligomycin 或 Rotenone。
  • 第二個空格:____ increases oxygen consumption while decreasing ATP synthesis.

    • 符合這個描述的是 2,4-Dinitrophenol。

匹配選項:
我們需要找到一個選項,其中第一個物質是 Oligomycin 或 Rotenone,第二個物質是 2,4-Dinitrophenol。

  • (A) Rotenone, 2,4-dinitrophenol:Rotenone 降低氧耗,DNP 增加氧耗。符合。
  • (B) Oligomycin, 2,4-dinitrophenol:Oligomycin 降低氧耗,DNP 增加氧耗。符合。
  • (C) 2,4-Dinitrophenol, Oligomycin:DNP 增加氧耗,Oligomycin 降低氧耗。不符合。
  • (D) Oligomycin A, rotenone:Oligomycin 降低氧耗,Rotenone 降低氧耗。不符合。
  • (E) 2,4-Dinitrophenol, rotenone:DNP 增加氧耗,Rotenone 降低氧耗。不符合。

現在我們有兩個可能的答案:(A) 和 (B)。
題目要求:
第一個空格:____ decreases both oxygen consumption and ATP synthesis.

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第 13 題

  1. After a meal or rest, phosphoprotein phosphatase 1 can ____ phosphorylase a, ____ phosphorylase kinase, and ____ glycogen synthase.
    (A) active, active, active
    (B) inactive, inactive, inactive
    (C) inactive, active, active
    (D) inactive, inactive, active
    (E) active, inactive, active

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這一題的完整詳解

本題測試學生對肝醣代謝調控的理解,特別是磷酸化和去磷酸化在調控醣原合成酶(glycogen synthase)和醣原磷酸化酶(glycogen phosphorylase)活性中的作用。

關鍵酶與調控機制:

  • 磷酸化酶 a (Phosphorylase a): 這是醣原分解(glycogenolysis)的活性形式。
  • 磷酸化酶激酶 (Phosphorylase kinase): 磷酸化並激活磷酸化酶 a。
  • 磷酸化酶 b (Phosphorylase b): 這是磷酸化酶的非活性形式。
  • 醣原合成酶 (Glycogen synthase): 這是肝醣合成(glycogenesis)的關鍵酶。它的活性形式是去磷酸化的形式,而非活性形式是磷酸化的形式。
  • 磷酸蛋白質磷酸酶 1 (Protein phosphatase 1, PP1): 是一種重要的去磷酸化酶,能夠移除蛋白質上的磷酸基團,從而改變其活性。

餐後或休息狀態的生理情況:
餐後或休息狀態,血糖水平較高,身體處於儲存能量的狀態,主要促進肝醣的合成。這意味著:

  • 肝醣分解(glycogenolysis)應被抑制。
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第 14 題

  1. When the cells require both NADPH and ribose 5-phosphate, the fate of glucose 6-phosphate (G6P) is:
    (A) G6P→\rightarrow ribulose 5-phosphate (R5P).
    (B) G6P→\rightarrow R5P →\rightarrow fructose 6-phosphate (F6P)+ glyceraldehyde 3-phosphate (G3P)→\rightarrow G6P.
    (C) G6P→\rightarrow F6P + G3P.
    (D) G6P→\rightarrow R5P →\rightarrow F6P+ G3P→\rightarrow pyruvate.

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本題測試學生對葡萄糖-6-磷酸(G6P)通過戊糖磷酸途徑(Pentose Phosphate Pathway, PPP)的代謝去向,以同時產生 NADPH 和核糖-5-磷酸(ribose 5-phosphate, R5P)的理解。

戊糖磷酸途徑(PPP)的兩個主要階段:

  1. 氧化階段 (Oxidative phase):

    • 此階段將葡萄糖-6-磷酸(G6P)氧化,產生 NADPH 和核酮糖-5-磷酸(ribulose 5-phosphate, R5P)。
    • 反應步驟:
      • G6P → 6-phosphoglucono-δ\delta-lactone (由 G6P 脫氫酶催化,產生 1 分子 NADPH)
      • 6-phosphoglucono-δ\delta-lactone → 6-phosphogluconate
      • 6-phosphogluconate → Ribulose 5-phosphate (Ru5P) (由 6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶催化,產生 1 分子 NADPH)
    • 總結: 1 分子 G6P 在氧化階段經過兩步氧化反應,生成 2 分子 NADPH 和 1 分子 R5P。
  2. 非氧化階段 (Non-oxidative phase):

    • 此階段將 R5P 轉化為其他醣類磷酸酯,如果糖-6-磷酸(F6P)和甘油醛-3-磷酸(G3P),這些物質可以再進入醣解途徑或糖質新生途徑。
    • R5P 可以通過異構酶轉化為 R5P 本身,或者通過差向異構酶轉化為木酮糖-5-磷酸(Xu5P)。
    • R5P 和 Xu5P 經過一系列的轉酮酶(transketolase)和轉醛酶(transaldolase)催化反應,可以生成 F6P 和 G3P。
    • 重要的一點是: 如果細胞同時需要 NADPH 和 R5P,PPP 的氧化階段會優先進行,以產生足夠的 NADPH 和 R5P。R5P 可以直接使用,或者進一步轉化。

題目情境:
細胞同時需要 NADPH 和 ribose 5-phosphate (R5P)。

分析選項:

(A) G6P→\rightarrow ribulose 5-phosphate (R5P).
* 這只描述了 PPP 的一個產物 R5P,但沒有提及 NADPH 的生成。PPP 的氧化階段會同時產生 R5P 和 NADPH。這個選項不完整。

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第 15 題

  1. Which of the following statements about ketone bodies is incorrect?
    (A) Ketone bodies are formed from acetyl CoA when fat breakdown predominates.
    (B) The major site of production of acetoacetate and 3-hydroxybutyrate is liver.
    (C) In the mitochondria, 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA (HMG-CoA) is acted by HMG-CoA lyase to yield acetoacetate plus acetyl-CoA.
    (D) High ketone bodies levels will rise the blood pH.
    (E) To consume a healthy dose of odd-chain fatty acids is a ketogenic- advised diet.

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本題測試學生對酮體(ketone bodies)生成、代謝、生理影響以及與飲食關係的理解。

酮體簡介:
酮體(acetoacetate, β\beta-hydroxybutyrate, and acetone)是肝臟在脂肪酸大量分解時產生的代謝產物,可以作為腦、心臟等組織的替代能量來源,尤其在飢餓、糖尿病酮症酸中毒等情況下。

各選項分析:

(A) 酮體形成與脂肪分解: 當身體處於飢餓狀態或長時間運動時,脂肪分解(lipolysis)會加劇,釋放出大量脂肪酸。脂肪酸在肝臟進行 β\beta-氧化,產生大量的乙醯輔酶A(acetyl-CoA)。如果乙醯輔酶A的生成速度超過三羧酸循環(TCA cycle)的處理能力(例如,草醯乙酸(OAA)不足,因為 OAA 被用於糖質新生),乙醯輔酶A就會進入酮體合成途徑。因此,當脂肪分解佔優勢時,酮體會從乙醯輔酶A生成。此敘述為真。

(B) 酮體的主要生成部位: 酮體的合成主要在肝臟進行。肝臟中的丙酮酸羧化酶活性高,可以將丙酮酸轉化為 OAA,維持 TCA 循環的運行,從而有足夠的乙醯輔酶A進入酮體合成。而其他組織(如腦、心肌)則能利用酮體作為能量來源,但不能合成酮體。因此,肝臟是酮體(乙醯乙酸和 β\beta-羥基丁酸)的主要生產部位。此敘述為真。

(C) HMG-CoA 的代謝: 在酮體合成的過程中,乙醯輔酶A 經過一系列反應生成 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA (HMG-CoA)。HMG-CoA 隨後被 HMG-CoA 裂解酶(HMG-CoA lyase)催化,裂解為乙醯輔酶A 和乙醯乙酸(acetoacetate)。這個反應發生在肝臟線粒體基質中。此敘述為真。

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第 II 題10 分

II. Please match the symptoms if the deficiency of the following noncoenzyme vitamins (10 points).

  1. Vitamin A
  2. Vitamin C
  3. Vitamin D
  4. Vitamin E
  5. Vitamin K

[ ] rickets and skeletal deformities.
[ ] night blindness, cornea damage.
[ ] subdermal hemorrhaging
[ ] inhibition sperm production, fragile erythrocytes for humans.
[ ] scurvy

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核心觀念

本題考查脂溶性與水溶性非輔酶維生素缺乏時的典型症狀:

  • 維生素 A:維持視紫質、視覺及上皮組織完整。
  • 維生素 C:參與膠原蛋白合成,維持血管與結締組織。
  • 維生素 D:促進腸道吸收鈣、磷,維持骨骼礦化。
  • 維生素 E:抗氧化,保護細胞膜與紅血球。
  • 維生素 K:參與凝血因子活化,維持正常凝血功能。

解題方法

依照每個症狀所涉及的主要生理功能判斷:

  1. 骨骼礦化異常 → 維生素 D
  2. 視覺與角膜病變 → 維生素 A
  3. 凝血異常、皮下出血 → 維生素 K
  4. 精子生成受抑制、紅血球脆弱 → 維生素 E
  5. 壞血病 → 維生素 C

因此,題目各症狀的配對順序為:

3→1,2→2,5→3,4→4,2→53 \rightarrow 1,\quad 2 \rightarrow 2,\quad 5 \rightarrow 3,\quad 4 \rightarrow 4,\quad 2 \rightarrow 5

其中箭頭左側代表維生素編號,右側代表題目症狀的排列順序。

選項分析

1. Vitamin A

維生素 A 的活性形式之一為 retinal,參與視網膜視紫質的形成。缺乏時,暗處視覺能力下降,形成夜盲症;嚴重時會造成結膜、角膜乾燥與角膜損傷。

因此:

  • night blindness, cornea damage → Vitamin A

2. Vitamin C

維生素 C 是膠原蛋白合成的重要輔助因子,參與脯胺酸與離胺酸殘基的羥化。膠原蛋白異常會導致牙齦出血、傷口癒合不良與微血管脆弱,典型疾病為壞血病(scurvy)。

因此:

  • scurvy → Vitamin C

3. Vitamin D

維生素 D 促進腸道對鈣與磷的吸收,並協助骨骼正常礦化。兒童缺乏時,骨骼鈣化不良,會造成**佝僂病(rickets)**與骨骼變形。

因此:

  • rickets and skeletal deformities → Vitamin D

4. Vitamin E

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第 III 題10 分

III. Explain the following terms (10 points) and draw the amino acids structure (3~6, 20 points)

  1. Saponification (4 points)
  2. Please compare the definition of oxidase and oxygenases. (6 points)
  3. Asparagine
  4. Histidine
  5. Lysine
  6. Cysteine

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這一題的完整詳解

此題包含兩部分:解釋術語和繪製胺基酸結構。

第一部分:解釋術語 (10 points)

  1. 皂化反應 (Saponification) (4 points):
    皂化反應是指酯類(特別是脂肪或油,即三酸甘油酯)在強鹼(如氫氧化鈉 NaOH\text{NaOH} 或氫氧化鉀 KOH\text{KOH})的存在下進行水解,生成羧酸鹽(肥皂)和醇(甘油)。
    化學反應式:
    Triglyceride + 3 NaOH\text{NaOH} → 3 Sodium salts of fatty acids (Soap) + Glycerol
    此反應是製備肥皂的基本原理。

  2. 比較氧化酶 (oxidase) 和氧合酶 (oxygenase) 的定義 (6 points):

    • 氧化酶 (Oxidase): 這類酶通常催化底物的氧化反應,其中氧氣(O2\text{O}_2)或某種含氧分子作為最終電子受體,並最終被還原成水(H2O\text{H}_2\text{O})。氧化酶本身不將氧原子併入底物。例如,細胞色素 c 氧化酶(cytochrome c oxidase)將氧還原為水。
    • 氧合酶 (Oxygenase): 這類酶則將氧分子(O2\text{O}_2)的一個或兩個氧原子直接併入底物的過程。
      • 單加氧酶 (Monooxygenase): 將 O2\text{O}_2 的一個氧原子併入底物,另一個氧原子還原成水。
        RH+O2+NAD(P)H+H+→ROH+H2O+NAD(P)+\text{RH} + \text{O}_2 + \text{NAD(P)H} + \text{H}^{+} \rightarrow \text{ROH} + \text{H}_2\text{O} + \text{NAD(P)}^{+}
      • 雙加氧酶 (Dioxygenase): 將 O2\text{O}_2 的兩個氧原子都併入底物。
        RH+O2+NAD(P)H→RO2H+NAD(P)+\text{RH} + \text{O}_2 + \text{NAD(P)H} \rightarrow \text{RO}_2\text{H} + \text{NAD(P)}^{+}
        總結比較: 氧化酶是將電子傳遞給氧氣並最終生成水,而氧合酶則是將氧原子直接引入底物分子。

第二部分:繪製胺基酸結構 (3~6, 20 points)

需要繪製以下四種胺基酸的結構:天冬醯胺(Asparagine)、組胺酸(Histidine)、離胺酸(Lysine)、半胱胺酸(Cysteine)。繪製胺基酸結構時,需包含胺基(-NH2_2)、羧基(-COOH)和側鏈(R group)。在生理 pH 下,胺基通常是質子化的(-NH3+_3^{+}),羧基通常是去質子化的(-COO−^{-})。

  1. 天冬醯胺 (Asparagine, Asn, N):
    • 基本結構:α\alpha-胺基(-NH3+_3^{+})、α\alpha-羧基(-COO−^{-})、一個氫原子(H)。
    • 側鏈 (R group):−CH2−CO−NH2-\text{CH}_2-\text{CO}-\text{NH}_2 ( −CH2−CONH2-\text{CH}_2-\text{CONH}_2 )
    • 結構圖(生理 pH):
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第 IV 題15 分

IV. Please answer the following question (15 points)

  1. Please indicate the active site of enzyme common features

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這一題的完整詳解

本題要求說明酶的活性位點(active site)的共同特徵。

酶活性位點的共同特徵:

酶的活性位點是酶分子上一個或幾個特定區域,是底物結合並發生催化反應的地方。其共同特徵包括:

  1. 特定性 (Specificity): 活性位點具有高度的空間結構特異性,能夠精確識別並結合特定的底物分子或一類結構相似的底物。這種特異性是由活性位點內胺基酸殘基的排列、電荷分佈、疏水性/親水性以及空間構象決定的。
  2. 三維結構 (Three-dimensional structure): 活性位點是由酶蛋白的空間摺疊形成的,通常是一個凹陷或口袋狀的結構。這個三維結構是底物能夠有效結合和反應的關鍵。
  3. 非極性與極性區域 (Nonpolar and polar regions): 活性位點內通常同時存在極性和非極性(疏水性)的胺基酸殘基。非極性殘基有助於結合疏水性底物或底物的疏水區域,而極性殘基(如帶電殘基或能形成氫鍵的殘基)則參與與底物的離子鍵、氫鍵作用,以及催化反應的進行。
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