114 年 國立高雄大學生命科學系碩士班《普通生物學》
第 1 題
動植物等生物中,水分攝取都相當重要,請問,水分在細胞中生理上以及生化上的作用為何?可以舉例說明。
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本題主要考查水分在生物體內的重要生理及生化功能。
水分是生命不可或缺的物質,佔生物體重量的很大比例,其重要性體現在以下幾個方面:
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溶劑 (Solvent):
- 生理作用:水是極性分子,可以溶解許多極性物質(如離子、糖類、胺基酸)和部分非極性物質。這使得水成為細胞內許多生化反應的介質。細胞內的代謝反應,如醣解作用、克氏循環等,都在水溶液中進行。
- 生化作用:許多生化反應需要水參與,例如水解反應(hydrolysis),如蛋白質分解成胺基酸、多醣分解成單醣,都需要水的加入。
- 舉例:血液中運輸氧氣、營養物質、廢物的過程,依賴血漿(主要成分是水)作為溶劑。植物吸收土壤中的礦物質離子,也是溶解在水中後才能被根部吸收。
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反應物或產物 (Reactant or Product):
- 生理作用:在某些生化反應中,水直接作為反應物或產物。
- 生化作用:
- 水解反應 (Hydrolysis):如前面提到的,水參與分解大分子。
- 脫水合成反應 (Dehydration Synthesis):與水解相反,是兩個分子結合形成一個較大的分子,同時移除一個水分子。例如,胺基酸縮合形成蛋白質,單醣結合形成多醣。
- 光合作用 (Photosynthesis):水是光合作用的光反應階段的反應物,提供電子和質子,並釋放出氧氣()。
- 呼吸作用 (Cellular Respiration):水是呼吸作用的產物之一()。
- 舉例:植物進行光合作用時,需要吸收水分;動物消化食物時,胃酸中的水參與水解蛋白質。
第 2 題
請解釋說明 Signal transduction,包括 pathway 的特性,Signal transduction 的接收器 (receptor)有幾類,請分別說明(或利用圖示加強說明)。另外,請舉例相關應用,如,由接收器(receptor)的認知而衍生的標靶藥物,或由接收器的認知而產生控制 Covid 19 的公共衛生策略。
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本題主要考查訊號傳遞(Signal transduction)的核心概念,包括其特性、受體分類、以及在醫藥和公共衛生上的應用。
訊號傳遞 (Signal Transduction) 是一個細胞接收外部或內部訊號,並將此訊號轉譯成細胞內部反應的過程。這個過程對於細胞的生長、分化、代謝、運動、記憶等幾乎所有生命活動都至關重要,也是多細胞生物體內細胞間溝通協調的基礎。
訊號傳遞途徑 (Signal Transduction Pathway) 的特性:
- 放大性 (Amplification):一個起始訊號分子(第一信使)可以引發細胞內部一系列反應,最終導致一個強烈的細胞反應。例如,一個激素分子可以活化數百個酶,每個酶又可以活化更多酶,呈指數級放大。
- 專一性 (Specificity):訊號分子(配體,ligand)與其受體(receptor)之間的結合具有高度專一性,如同鑰匙與鎖的關係。一個細胞通常只有特定的受體,因此只對特定的訊號分子產生反應。
- 整合性 (Integration):細胞可以同時接收來自多個訊號,並將這些訊號整合,產生一個綜合性的反應。這意味著不同訊號途徑之間可能相互影響,調節細胞的最終反應。
- 調節性 (Regulation):訊號傳遞途徑受到嚴格的調節,包括訊號的啟動、終止以及反應的強度。這確保細胞的反應是適時且適量的。
- 不同細胞的反應差異 (Divergence/Convergence):同一種訊號分子,在不同的細胞類型中,由於其細胞內訊號傳遞途徑的差異,可能引發不同的反應。反之,不同的訊號分子也可能通過不同的途徑,最終匯聚(converge)到相同的細胞反應。
訊號傳遞的接收器 (Receptor) 種類:
受體是細胞膜上或細胞內能識別並結合特定訊號分子(配體)的蛋白質。根據受體在細胞內的位置及其訊號傳遞機制,主要可分為以下幾類:
- 細胞表面受體 (Cell-surface Receptors):
- 特性:這些受體位於細胞膜上,負責接收細胞外(但不能穿過細胞膜)的訊號分子,如胜肽類激素、神經傳導物質、生長因子等。一旦訊號分子與受體結合,會引發細胞膜內部的訊號轉譯。
- 主要類型:
- 離子通道偶聯受體 (Ion Channel-linked Receptors):訊號分子結合後,受體會改變構象,直接打開或關閉細胞膜上的離子通道,改變離子跨膜流動,進而影響細胞電位或離子濃度,引發細胞反應。
- 例子:神經肌肉接頭處乙醯膽鹼受體(acetylcholine receptor)結合乙醯膽鹼後,打開鈉離子通道,引起肌肉收縮。
- G蛋白偶聯受體 (G protein-coupled Receptors, GPCRs):這是一類最常見的受體,通常有七次跨膜結構域。訊號分子結合後,會活化細胞膜上的G蛋白,G蛋白再進一步調節細胞內其他效應分子(如腺苷酸環化酶、磷酸二酯酶、離子通道),啟動下游的訊號傳遞級聯反應。
- 例子:許多激素(如腎上腺素、升糖素)、嗅覺和視覺受體、部分神經傳導物質受體。
- 酶偶聯受體 (Enzyme-linked Receptors):受體本身就是一種酶,或與一種酶緊密偶聯。訊號分子結合後,受體會活化其酶活性(如酪胺酸激酶、絲胺酸/蘇胺酸激酶、鳥苷酸環化酶),催化細胞內特定的生物化學反應,啟動訊號傳遞。
- 例子:胰島素受體(酪胺酸激酶活性)、生長因子受體(如 EGFR)。
- 離子通道偶聯受體 (Ion Channel-linked Receptors):訊號分子結合後,受體會改變構象,直接打開或關閉細胞膜上的離子通道,改變離子跨膜流動,進而影響細胞電位或離子濃度,引發細胞反應。
第 3 題
請詳細說明高等動物細胞(如人類)之細胞週期(Cell cycle)流程,請依 G1, S, G2, M 依序說明,包括外觀特性,內部生理及生化反應,調控機制(如 check point)等。
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本題考查高等動物細胞(以人類細胞為例)的細胞週期(Cell Cycle)及其調控機制。細胞週期是細胞從一次分裂結束到下次分裂結束的完整過程,主要包含間期(Interphase)和分裂期(M Phase)。間期又分為 G1、S、G2 三個階段,M 期則包含細胞質分裂(Cytokinesis)和細胞核分裂(Mitosis)。
細胞週期 (Cell Cycle)
細胞週期是一個高度有序的過程,確保遺傳物質的精確複製和分配給子細胞。
間期 (Interphase)
間期是細胞準備分裂的階段,佔細胞週期的絕大部分時間(約 95%)。細胞在此階段進行生長、DNA 複製和準備分裂所需的蛋白質合成。
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G1 期 (Gap 1 Phase):
- 外觀特性:細胞體積開始增大,代謝活躍,細胞核和核仁清晰可見。
- 內部生理及生化反應:
- 細胞從上次分裂結束後進入 G1 期,開始活躍生長。
- 合成大量的蛋白質、RNA 和其他細胞組件,為 DNA 複製做準備。
- 細胞質和細胞器(如粒線體、核糖體)數量增加。
- 細胞會評估自身的大小、營養狀態以及是否有 DNA 損傷。
- G1 檢查點 (G1 Checkpoint):這是細胞週期中最重要的檢查點之一,也稱為限制點 (Restriction Point, R point)。細胞在此處決定是否進入 S 期繼續分裂,還是進入 G0 期(靜止期)。
- 調控機制:G1 期受細胞週期蛋白(Cyclins)和細胞週期蛋白依賴性激酶(Cyclin-Dependent Kinases, CDKs)的調控。CDK 的活性需要與特定的 Cyclin 結合,並經過磷酸化/去磷酸化等修飾。在 G1 期,D 型 Cyclin 與 CDK4/6 結合並活化,促進細胞進入 S 期。
- DNA 損傷檢查點 (DNA Damage Checkpoint):若 DNA 發生損傷,會觸發 p53 等腫瘤抑制蛋白,阻止細胞進入 S 期,並啟動 DNA 修復機制。若損傷嚴重無法修復,則可能誘導細胞凋亡。
- G0 期 (Quiescence Phase):
- 當細胞遇到不利條件(如營養不足、缺乏生長因子)或達到發育分化終點時,會暫時或永久地離開細胞週期,進入 G0 期。
- G0 期的細胞代謝仍活躍,但不再增殖。許多終端分化的細胞(如神經細胞、肌肉細胞)處於 G0 期。
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S 期 (Synthesis Phase):
- 外觀特性:細胞體積持續增大,但外觀變化不大。
- 內部生理及生化反應:
- DNA 複製 (DNA Replication):這是 S 期最核心的事件。細胞從單套染色體(每個染色體含一條染色單體)複製成雙套染色體(每個染色體含兩條染色單體)。DNA 聚合酶(DNA polymerase)是關鍵酶。
- 組蛋白合成 (Histone Synthesis):與 DNA 複製同步,細胞也會合成大量的組蛋白,用於包裝新複製的 DNA。
- 調控機制:S 期受 SCLCDKs(如 Cyclin E-CDK2, Cyclin A-CDK2)調控。DNA 複製的起始點(Origin of Replication)受到嚴格調控,確保每個 DNA 區域只複製一次。
第 4 題
請解釋說明 Mendel 孟德爾三大定律,以及其前提與如何產生子代多樣性。
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本題考查孟德爾遺傳定律的內容、前提條件以及子代性狀多樣性的產生機制。
孟德爾 (Gregor Mendel) 透過豌豆雜交實驗,提出了遺傳的機率法則,揭示了性狀如何從親代傳遞給子代。
孟德爾三大定律
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分離定律 (Law of Segregation):
- 內容:控制同一性狀的成對遺傳因子(alleles)在配子形成過程中會彼此分離,分離後的每個配子只攜帶其中一個遺傳因子。
- 前提:
- 每個生物體擁有控制同一性狀的兩套遺傳因子(alleles),一套來自父方,一套來自母方。
- 這些遺傳因子在配子(如精子、卵子)形成時會分離。
- 影響:這個定律解釋了為什麼雜合子(heterozygote)的配子類型是單一的(例如,Aa 的配子只有 A 或 a,不會是 Aa)。
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獨立分配定律 (Law of Independent Assortment):
- 內容:控制不同性狀的成對遺傳因子在配子形成過程中是獨立分配的,即一個性狀的遺傳因子組合不會影響另一個性狀的遺傳因子組合。
- 前提:
- 該定律適用於位於不同同源染色體上的基因。
- 配子形成過程中,非同源染色體上的基因組合是隨機的。
- 影響:這個定律解釋了為什麼進行雙因子或多因子雜交時,子代會出現多種基因型和表現型的組合。例如,親代為黃色圓粒(YYRR)和綠色皺粒(yyrr),子一代(F1)為黃色圓粒(YyRr),而子二代(F2)則會出現黃圓、黃皺、綠圓、綠皺四種表現型,比例接近 9:3:3:1。
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顯性定律 (Law of Dominance):
- 內容:在雜合子狀態下,一個顯性遺傳因子(dominant allele)會掩蓋或抑制隱性遺傳因子(recessive allele)的表現。只有當生物體同時擁有兩個隱性遺傳因子時,隱性性狀才會表現出來。
- 前提:
- 研究的性狀由一對等位基因控制。
- 其中一個等位基因對另一個等位基因表現為顯性。
- 影響:這個定律解釋了為什麼許多性狀在親代和子代之間呈現出「似乎跳過一代」的現象,也解釋了為什麼基因型相同(如 AA 和 Aa)但表現型可能不同(或者對於隱性性狀,基因型 Aa 不表現隱性性狀)。
孟德爾遺傳定律的前提條件 (Assumptions):
孟德爾的定律並非適用於所有遺傳現象,其有效性基於以下幾個重要前提:
- 完全顯性 (Complete Dominance):所研究的性狀表現出完全顯性或完全隱性。
- 單基因控制 (Monogenic Inheritance):每個性狀由單一基因的兩個等位基因控制。
- 基因位於不同染色體上 (Independent Assortment for Different Genes):控制不同性狀的基因位於非同源染色體上,因此遵循獨立分配定律。
- 無基因互作 (No Gene Interaction):不同基因之間沒有相互作用(如互補、上位、抑止等)影響表現型。
第 5 題
Mendel 德爾定律提到的顯性(dominant)與隱性(recessive) allele,都會進行轉錄與轉譯作用,請由分生與生化的角度去解釋說明顯性與隱性 allele 作用模式以及互相的影響。
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本題考查顯性與隱性等位基因(alleles)在分子生物學和生化學層面的作用機制,以及它們之間如何相互影響。
核心概念: 孟德爾的顯性與隱性是基於表現型(phenotype)的觀察,而分子層面的顯隱性,則取決於等位基因所產生的蛋白質產物(通常是酵素或結構蛋白)的功能。
顯性 (Dominant) Allele 的作用模式:
顯性等位基因通常編碼一個具有功能的蛋白質產物。當一個生物體是雜合子(heterozygote, 如 Aa)時,其一個拷貝的等位基因(A)能夠產生足夠量的功能性蛋白質,以產生顯性性狀。
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產生功能性蛋白質 (Functional Protein Production):
- 轉錄與轉譯:顯性等位基因(A)的 DNA 序列被轉錄成 mRNA,然後被轉譯成一個具有正常或部分功能的蛋白質。
- 生化影響:這個蛋白質可能是一種酵素,能夠催化特定的生化反應;也可能是一種結構蛋白,構成細胞結構;或者是一種調控蛋白,影響其他基因的表達。
- 舉例:在豌豆的種子顏色遺傳中,決定黃色種子的等位基因(Y)編碼一個參與類胡蘿蔔素合成的酵素。這個酵素能將無色的前體轉化為黃色色素。
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「顯性」的程度:
- 完全顯性 (Complete Dominance):雜合子(Aa)的表現型與純合顯性個體(AA)的表現型完全相同。這是因為一個拷貝的顯性等位基因(A)產生的功能性蛋白質,其量已經足夠維持顯性性狀。例如,豌豆的黃色種子,YY 和 Yy 都表現為黃色。
- 不完全顯性 (Incomplete Dominance):雜合子(Aa)的表現型介於純合顯性(AA)和純合隱性(aa)之間。這通常發生在顯性等位基因產生的蛋白質功能不夠「完全」或「足夠」,例如,AA 產生 100% 功能蛋白,Yy 產生 50% 功能蛋白,aa 產生 0% 功能蛋白。表現型上,50% 的功能蛋白不足以產生與 100% 相同的性狀,但足以產生與 0% 不同的中間狀態。
- 例子:紫茉莉的花色,RR 為紅色,rr 為白色,Rr 為粉紅色。
- 共顯性 (Codominance):雜合子(Aa)同時表現出純合顯性(AA)和純合隱性(aa)個體的性狀。這意味著兩個等位基因產生的蛋白質都能在表現型上同時顯現。
- 例子:人類的 AB 血型,A 等位基因和 B 等位基因都產生相應的醣基轉移酶,分別在紅細胞表面添加 A 抗原和 B 抗原,兩者同時存在。
隱性 (Recessive) Allele 的作用模式:
隱性等位基因通常有兩種情況:
- 無功能蛋白質 (Non-functional Protein Production):
- 轉錄與轉譯:隱性等位基因(a)的 DNA 序列可能發生突變,導致其轉錄的 mRNA 異常,或轉譯出的蛋白質失去活性、不穩定,或者根本不產生蛋白質。
第 6 題
請說明 E. coli 大腸桿菌進行複製(DNA synthesis)時的詳細過程與機制。
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本題考查大腸桿菌(E. coli)DNA 複製的詳細過程與機制。E. coli 的 DNA 複製是原核生物 DNA 複製的典型模型,具有半保留性(semiconservative)、雙向性(bidirectional)和高度準確性(high fidelity)等特點。
E. coli DNA 複製的過程與機制
E. coli 的基因體為環狀雙股 DNA,複製起始於一個特定的位點,稱為複製起點(origin of replication),簡稱為 oriC。複製是半保留的,意味著每一條新合成的 DNA 鏈都與其模板鏈互補配對,最終產生的兩個 DNA 分子,每個都包含一條來自親代 DNA 的鏈和一條新合成的鏈。
複製的階段:
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起始 (Initiation):
- 識別 oriC:複製起始於 oriC,這是一個富含 AT 序列(約 245 bp)的特殊 DNA 區域。
- 引發蛋白質 (Initiator Proteins):DnaA 蛋白是主要的引發蛋白質,它在 ATP 存在下結合到 oriC 的 DnaA 盒(DnaA boxes)上,導致 DNA 雙螺旋局部解開。
- 解旋酶 (Helicase):DnaB 蛋白(一種解旋酶)被 DnaC 蛋白(一種解旋酶載體)協助,結合到解開的 DNA 單鏈上,開始解開雙螺旋,形成複製叉(replication fork)。
- 單鏈結合蛋白 (Single-Strand Binding Proteins, SSBs):SSBs 結合到單鏈 DNA 上,防止其重新配對,並保護其免受核酸酶降解。
- 拓樸異構酶 (Topoisomerase):在 DNA 解旋過程中,會產生超螺旋(supercoiling)應力,拓樸異構酶(如 DNA gyrase,一種 II 型拓樸異構酶)通過切斷和重新連接 DNA 鏈來緩解這種應力,防止 DNA 斷裂。
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延伸 (Elongation):
- 引領鏈 (Leading Strand) 和 延遲鏈 (Lagging Strand):由於 DNA 聚合酶(DNA polymerase)只能沿 5' 到 3' 方向合成 DNA,且複製是雙向的,因此在每個複製叉處,兩條模板鏈的複製方向與複製叉的移動方向不同,導致了引領鏈和延遲鏈的區別。
- 引領鏈:模板鏈的 3' 到 5' 方向與複製叉移動方向一致,新合成的 DNA 鏈(5' 到 3')可以連續合成,方向與複製叉移動方向一致。
- 延遲鏈:模板鏈的 3' 到 5' 方向與複製叉移動方向相反,新合成的 DNA 鏈(5' 到 3')必須以不連續的方式,通過一系列短片段(Okazaki fragments)合成。
- 引物合成 (Primer Synthesis):DNA 聚合酶無法從頭開始合成 DNA,需要一個 RNA 引物。引物酶(Primase,一種 RNA 聚合酶)合成一個短的 RNA 引物,提供一個 3'-OH 末端供 DNA 聚合酶延伸。
- DNA 聚合酶 (DNA Polymerases):
- DNA Pol III:是 E. coli 中主要的 DNA 複製酶,具有高催化活性和 3' 到 5' 外切酶活性(校對功能)。它負責引領鏈和延遲鏈 Okazaki fragments 的延伸。
- DNA Pol I:具有 5' 到 3' 外切酶活性,用於移除 RNA 引物,並用 DNA 取代。
- 引領鏈 (Leading Strand) 和 延遲鏈 (Lagging Strand):由於 DNA 聚合酶(DNA polymerase)只能沿 5' 到 3' 方向合成 DNA,且複製是雙向的,因此在每個複製叉處,兩條模板鏈的複製方向與複製叉的移動方向不同,導致了引領鏈和延遲鏈的區別。
第 7 題
現今地球暖化造成氣候變遷,對農作物生產大大不利,在實際種植過程中會經歷水患,缺
水,高溫,低溫,強風等等非生物性的逆境stress,請解釋遭遇”非生物性”的逆境 stress
時,植物如何反應保護自己(可討論植物荷爾蒙或其他生理,分生與生化的調節)。
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本題考查植物在面臨非生物性逆境(abotic stress)時的生理、生化及分子調控機制,以達到自我保護。
植物對非生物性逆境的反應機制
植物為了適應不斷變化的環境,演化出了一系列複雜的生理、生化和分子調控機制來應對各種非生物性逆境,包括水患(淹水)、乾旱(缺水)、高溫、低溫和強風等。這些機制可以歸納為感知、訊號傳導和響應三個層面。
一、感知逆境 (Stress Perception)
植物通過細胞膜上的受體蛋白或細胞內的感應器(sensors)來感知環境的變化。例如:
- 滲透壓感受器:感知水分脅迫(乾旱或淹水)導致的滲透壓變化。
- 溫度感受器:感知溫度升高或降低。
- 機械力感受器:感知強風等機械應力。
二、訊號傳導 (Signal Transduction)
一旦逆境被感知,細胞會啟動一連串的訊號傳導級聯反應,將逆境訊號傳遞到細胞內部,最終引發適應性響應。這個過程涉及:
- 離子流動的改變:如 離子濃度的瞬時升高,是許多逆境訊號的早期響應, 作為第二信使,激活下游的訊號分子。
- 活性氧類 (Reactive Oxygen Species, ROS):在多種逆境下,植物細胞會產生 ROS(如超氧化物 、過氧化氫 )。ROS 最初被認為是細胞損傷的標誌,但現在已知它們也是重要的訊號分子,參與調控許多逆境響應基因的表達。
- 植物荷爾蒙 (Plant Hormones):植物荷爾蒙在逆境訊號傳導和響應中扮演核心角色。
- 離層酸 (Abscisic Acid, ABA):是應對乾旱、低溫、高鹽等逆境的最重要荷爾蒙。ABA 誘導氣孔關閉以減少水分散失,促進根生長,並啟動抗凍和抗乾旱相關基因的表達。
- 乙烯 (Ethylene):在淹水(缺氧)、乾旱、機械傷害等逆境下會升高。在淹水時,乙烯參與調控植物的“淹水反應”,如形成通氣組織(aerenchyma)以利氣體交換。
- 茉莉酸 (Jasmonic Acid, JA) 和 水楊酸 (Salicylic Acid, SA):參與應對多種逆境,包括機械傷害、病原菌感染,也與非生物性逆境有關。
- 生長素 (Auxin):在淹水情況下,其運輸和代謝會發生改變,影響根的生長和通氣組織的形成。
- 赤黴素 (Gibberellins, GAs) 和 細胞分裂素 (Cytokinins, CKs):通常與生長和發育相關,但在某些逆境下(如低溫),它們的水平也會改變,影響植物的適應性。
- 轉錄因子 (Transcription Factors, TFs):許多逆境訊號最終匯聚到轉錄因子,如 DREB/CBF、NAC、WRKY 等家族的轉錄因子。這些 TFs 結合到下游目標基因的啟動子區域,調控這些基因的表達,進而產生適應性蛋白質。
三、響應與保護機制 (Response and Protective Mechanisms)
植物利用多種策略來減輕逆境造成的傷害,並維持生存和生長。
- 乾旱 (Drought Stress):
- 氣孔關閉:ABA 誘導氣孔關閉,減少蒸散,保留水分。
- 滲透調節 (Osmotic Adjustment):積累細胞溶質(如脯氨酸、甘氨酸甜菜鹼、可溶性糖)以降低滲透勢,幫助細胞在低水勢下維持膨壓,防止細胞萎蔫。
- 抗氧化系統:產生抗氧化酶(如 SOD, CAT, APX)和抗氧化物質(如維生素 C, 維生素 E, 黃酮類化合物)來清除過多的 ROS。
- 根系生長:ABA 刺激根系生長,增加水分吸收面積。
- 休眠或衰老:嚴重乾旱時,植物可能進入休眠狀態或加速葉片衰老脫落,以減少水分消耗。
第 8 題
癌症發生時,啟動 Apoptosis 會抑制細胞增生的能力,請問癌細胞如何偵測自己的異常,如何嘗試自我修復,如何啟動 Apoptosis。
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本題考查細胞凋亡(Apoptosis)在癌症發生中的作用,以及癌細胞如何逃避凋亡、自我修復和偵測自身異常。
細胞凋亡 (Apoptosis) 與癌症
細胞凋亡是一種程序性細胞死亡,是維持組織穩態、清除衰老或受損細胞、以及胚胎發育過程中的重要機制。在癌症的發生和發展中,細胞凋亡的失調扮演著關鍵角色。正常情況下,當細胞偵測到嚴重的 DNA 損傷、癌基因異常活化或其他細胞異常時,會啟動凋亡程序,從而防止異常細胞的增殖。然而,癌細胞通常會發展出逃避凋亡的機制,使其能夠持續增殖並形成腫瘤。
癌細胞如何偵測自己的異常?
癌細胞並非完全「無知」於自身的異常,它們仍然擁有部分細胞內偵測異常的機制,但這些機制常常被破壞或逃避。主要的偵測機制包括:
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DNA 損傷反應 (DNA Damage Response, DDR):
- 細胞內有複雜的 DNA 修復系統和檢查點(如 G1, S, G2, M 檢查點)。當 DNA 發生損傷(如突變、斷裂)時,ATM (Ataxia-telangiectasia mutated) 和 ATR (Ataxia-telangiectasia and Rad3-related) 等激酶會被激活,進而磷酸化下游的蛋白質,如 p53。
- p53 蛋白:p53 被稱為「基因組的守護者」。當偵測到 DNA 損傷時,p53 會被穩定並活化,它作為一個轉錄因子,可以啟動多種基因的表達,這些基因負責:
- 細胞週期停滯:阻止細胞進入下一個分裂週期,給予時間進行 DNA 修復。
- DNA 修復:誘導 DNA 修復酶的產生。
- 啟動凋亡:如果 DNA 損傷無法修復,p53 會誘導促凋亡基因(如 Bax, PUMA, NOXA)的表達,啟動細胞凋亡。
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原癌基因活化與抑癌基因失活 (Oncogene Activation & Tumor Suppressor Gene Inactivation):
- 原癌基因 (Oncogenes):正常情況下,它們是調節細胞生長、分裂和存活的基因(如 Ras, Myc)。當它們發生突變而過度活躍時,會驅動細胞不受控制地增殖。
- 抑癌基因 (Tumor Suppressor Genes):正常情況下,它們抑制細胞生長、促進 DNA 修復或誘導凋亡(如 p53, Rb)。當它們失活時,細胞生長和凋亡的剎車就被失靈。
- 細胞偵測:細胞內有一套機制能夠偵測到這些基因的異常活化或失活,並試圖做出反應。例如,Ras 的異常活化會觸發細胞週期推進,但同時也可能被 p53 或其他機制偵測到,若 p53 正常,則可能誘導凋亡。
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端粒短縮 (Telomere Shortening):
- 正常細胞在每次分裂後,染色體末端的端粒(telomeres)會逐漸縮短。當端粒縮短到一定程度時,會被細胞識別為 DNA 斷裂,觸發細胞週期停滯或凋亡。
- 癌細胞通常會激活端粒酶(telomerase),使其能夠延長端粒,從而獲得永生性,逃避因端粒縮短引起的衰老或凋亡。
癌細胞如何嘗試自我修復?
癌細胞並非完全不修復,它們也會利用細胞內的 DNA 修復系統。然而,由於這些細胞本身就存在 DNA 損傷和修復系統的缺陷,加上其快速分裂的特性,導致它們的基因組非常不穩定(genomic instability)。
- DNA 修復通路:癌細胞仍然擁有各種 DNA 修復通路,如鹼基切除修復(BER)、核苷酸切除修復(NER)、錯配修復(MMR)和 DNA 雙鏈斷裂修復(DSBR,包括同源重組 HR 和非同源末端連接 NHEJ)。
- 修復的局限性:儘管存在這些修復系統,但由於癌細胞本身突變多,某些修復蛋白的編碼基因可能也發生了突變,導致修復效率低下或發生錯誤。例如,許多腫瘤中 MMR 系統失活,導致微衛星不穩定(microsatellite instability, MSI)。
第 9 題
典型的 Biotechnology 指的是甚麼?請定義。如果藉由 E. coli 大腸桿菌產生人類胰島素是 Biotechnology,請解釋他的設計流程。
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本題考查生物技術(Biotechnology)的定義,以及利用基因工程技術透過 E. coli 生產人類胰島素的設計流程。
生物技術 (Biotechnology) 的定義
生物技術是指任何利用生物體、生物系統或其衍生物來製造或改變產品、改善動植物,或開發微生物的技術。廣義上,生物技術的歷史可以追溯到數千年前人類開始利用酵母進行發酵(釀酒、製麵包)和利用微生物進行農業生產。
狹義上,現代生物技術(又稱基因工程或基因重組技術)則是指在分子水平上,通過基因操作(如基因的提取、修飾、重組、轉殖)來改變生物體的遺傳特性,或利用這些基因來生產特定產品的技術。
現代生物技術的關鍵特徵:
- 基因重組 (Recombinant DNA Technology):將來自不同生物體的 DNA 片段連接起來,形成重組 DNA 分子。
- 基因轉殖 (Gene Transfer):將重組 DNA 分子導入宿主細胞(如細菌、酵母、動物細胞、植物細胞),使其獲得新的遺傳特性或生產新產品。
- 分子診斷 (Molecular Diagnostics):利用核酸或蛋白質序列的差異來診斷疾病。
- 生物製藥 (Biopharmaceuticals):利用生物技術生產的藥物,如蛋白質、抗體、疫苗、基因治療藥物等。
利用 E. coli 生產人類胰島素的設計流程
利用基因工程技術,通過 E. coli 產生人類胰島素是現代生物技術的一個經典範例,其設計流程主要包括以下步驟:
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目標基因的獲取 (Obtaining the Target Gene):
- 人類胰島素基因:人類胰島素由 A 鏈和 B 鏈組成,這兩條肽鏈由不同的基因(胰島素原 gene)在轉錄和轉譯後,經過剪切加工形成。直接克隆人類胰島素基因(cDNA)比較複雜,因為它需要同時表達 A 鏈和 B 鏈,並進行正確的二硫鍵連接。
- 合成基因或 cDNA:
- 化學合成法:根據人類胰島素 A 鏈和 B 鏈的氨基酸序列,逆推其 mRNA 序列,再逆合成 DNA 序列(cDNA),並進行優化以適應 E. coli 的密碼子使用偏好。
- 逆轉錄法:從人類胰島細胞中提取 mRNA,利用逆轉錄酶 (reverse transcriptase) 合成 cDNA,再 PCR 擴增。
- 表達策略:由於胰島素由 A、B 鏈組成,並且需要形成二硫鍵,通常採用以下策略:
- 分別表達 A 鏈和 B 鏈:將編碼 A 鏈和 B 鏈的基因分別插入到 E. coli 的表達載體中,在 E. coli 中分別表達,然後將兩條鏈純化後,在體外進行化學合成的二硫鍵連接。
- 融合表達 (Fusion Protein):將 A 鏈和 B 鏈基因以適當的連接子(linker)連接起來,或者將其與某種載體蛋白(如 LacZ 的一部分)融合表達,以提高表達穩定性和產量,之後再進行切割和純化。
-
構建重組 DNA 載體 (Constructing the Recombinant DNA Vector):
- 表達載體 (Expression Vector):選擇一個合適的 E. coli 表達載體。該載體通常包含:
- 複製起點 (Origin of Replication, ori):確保載體能在 E. coli 中複製。
- 啟動子 (Promoter):一個強啟動子,能夠誘導 E. coli 高效轉錄目標基因。常用的有 Lac 啟動子(可被 IPTG 誘導)、Trp 啟動子、T7 啟動子(需要 T7 RNA 聚合酶)。
- 終止子 (Terminator):提供轉錄終止信號。
- 篩選標記 (Selectable Marker):通常是抗生素抗性基因(如氨苄青黴素抗性基因 ),用於篩選成功轉入載體的 E. coli 細胞。
- 表達載體 (Expression Vector):選擇一個合適的 E. coli 表達載體。該載體通常包含:
第 10 題
人類免疫系統如何運作?請介紹各式淋巴球(lymphocyte)以及不同免疫球蛋白(Immunoglobulin)扮演的角色或作用。
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本題考查人類免疫系統的運作機制,重點介紹淋巴球的種類及其功能,以及免疫球蛋白(抗體)在免疫反應中的角色。
人類免疫系統的運作
人類免疫系統是一個複雜的防禦網絡,旨在識別並清除體內的異物(如病原體:細菌、病毒、真菌、寄生蟲)和異常細胞(如癌細胞),同時避免攻擊自身細胞。免疫系統主要分為兩大分支:
- 先天性免疫 (Innate Immunity):非專一性、快速反應的防禦。包括物理屏障(皮膚、黏膜)、化學屏障(胃酸、溶菌酶)、細胞因子(如干擾素)和吞噬細胞(如巨噬細胞、嗜中性粒細胞)。
- 適應性免疫 (Adaptive Immunity):專一性、記憶性的防禦,由淋巴球負責。它能識別特定抗原,並產生更強大、更持久的免疫反應。適應性免疫又分為體液免疫和細胞免疫。
淋巴球 (Lymphocytes)
淋巴球是適應性免疫的主要執行者,主要有三種:B 淋巴球、T 淋巴球和自然殺手細胞(NK cells)。
-
B 淋巴球 (B Lymphocytes):
- 來源與成熟:在骨髓 (Bone Marrow) 中產生並成熟。
- 主要功能:負責 體液免疫 (Humoral Immunity)。
- 作用機制:
- 抗原識別:每個 B 細胞表面都帶有獨特的 B 細胞受體 (BCR),能識別特定的抗原決定基 (epitope)。
- 活化與增殖:當 B 細胞識別到抗原,並通常需要 T 輔助細胞 (T helper cells) 的協助時,會被活化,然後增殖並分化成:
- 漿細胞 (Plasma Cells):這是功能性的 B 細胞,分泌大量的、與 BCR 相同特異性的 免疫球蛋白 (Immunoglobulins, Ig),即抗體。
- 記憶 B 細胞 (Memory B Cells):這些細胞壽命長,能在再次接觸相同抗原時,迅速引發更強烈的二次免疫反應。
- 與免疫球蛋白的關係:B 細胞產生的抗體是體液免疫的關鍵。
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T 淋巴球 (T Lymphocytes):
- 來源與成熟:在骨髓中產生,但在胸腺 (Thymus) 中成熟。
- 主要功能:負責 細胞免疫 (Cellular Immunity),並輔助體液免疫。
- 主要類型:
- 輔助型 T 細胞 (T Helper Cells, cells, CD4^+$):
- 抗原識別:識別呈現在主要組織相容性複合體 II (MHC Class II) 分子上的外來抗原片段(通常來自細胞外的病原體,如細菌)。
- 功能:活化 B 細胞產生抗體,活化細胞毒殺 T 細胞,並分泌細胞因子來調節免疫反應。它們是免疫反應的「指揮官」。
- 細胞毒殺型 T 細胞 (Cytotoxic T Lymphocytes, cells, CD8^+$):
- 抗原識別:識別呈現在主要組織相容性複合體 I (MHC Class I) 分子上的內源性抗原片段(通常是病毒感染的細胞或癌細胞的抗原)。
- 功能:直接殺死被感染的細胞或癌細胞。它們通過釋放細胞溶解因子(如穿孔素 perforin 和顆粒酶 granzymes)來誘導目標細胞凋亡。
- 調節型 T 細胞 (Regulatory T Cells, cells):
- 功能:抑制免疫反應,防止免疫系統攻擊自身(自體免疫疾病)或過度反應。
- 輔助型 T 細胞 (T Helper Cells, cells, CD4^+$):
- 記憶 T 細胞 (Memory T Cells):與記憶 B 細胞類似,能快速響應再次感染。
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自然殺手細胞 (Natural Killer Cells, NK Cells):
- 來源與功能:是先天性免疫和適應性免疫之間的橋樑。它們能識別並殺死某些被病毒感染的細胞或癌細胞,而無需預先致敏(不像 細胞)。