111 年 國立中央大學環境工程研究所甲組《環境化學及環境微生物學》

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第 1 題25 分

地下水受含氯有機溶劑污染時可藉由生物復育的方式達到整治功效。以三氯乙烯(TCE)為例,目前已知的生物復育工法包括「好氧」與「厭氧」兩種方式,但兩種方式所倚賴的關鍵微生物族群截然不同。請從微生物細胞能量學的角度,分別說明微生物如何進行三氯乙烯(TCE)的好氧與厭氧降解作用。

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本題主要考查環境微生物學中,關於有機污染物(以三氯乙烯 TCE 為例)在好氧與厭氧條件下的生物降解機制,並要求從微生物細胞能量學的角度進行闡述。

核心觀念:

  • 好氧降解: 微生物利用氧氣作為最終電子接受者,將有機物氧化釋放能量。
  • 厭氧降解: 微生物在無氧環境下,利用其他無機物(如硝酸鹽、硫酸鹽、鐵離子、二氧化碳等)作為最終電子接受者,將有機物氧化釋放能量。
  • 細胞能量學: 微生物進行代謝反應以獲取 ATP(三磷酸腺苷),ATP 是細胞進行各種生命活動的直接能量來源。降解有機物的過程,本質上是將有機物中的化學能轉化為 ATP 的過程。

解題思路:
需分別闡述 TCE 在好氧與厭氧環境下的降解途徑,並連結到微生物如何從中獲取能量。

(a) 好氧降解 (Aerobic Degradation)

在好氧條件下,許多微生物可以利用氧氣作為最終電子接受者,將 TCE 進行氧化降解。這個過程通常需要特定的酶系統,例如單加氧酶 (monooxygenase) 或雙加氧酶 (dioxygenase),它們能夠催化 TCE 的氧化反應。

  1. 反應機制: 好氧菌利用氧氣(O2O_2)作為電子接受體,將 TCE 氧化。典型的反應途徑是通過加氧酶的作用,在 TCE 分子上引入羥基,形成不穩定的中間產物,進而水解、開環,最終分解為二氧化碳(CO2CO_2)和水(H2OH_2O)。
  2. 能量獲取: 整個氧化過程釋放的能量,一部分被用於合成 ATP,以支持微生物的生長和代謝活動。TCE 被視為電子供體(電子來自 TCE 的碳原子),氧氣是最終電子接受體。電子通過一系列電子傳遞鏈傳遞,最終與氧氣結合生成水,並在過程中產生質子梯度,驅動 ATP 合成。
  3. 細胞能量學連結: 微生物通過氧化 TCE 獲得能量,這個能量的轉化效率(即從 TCE 中提取多少能量用於 ATP 合成)決定了該微生物對 TCE 的降解能力和生長速率。好氧降解通常比厭氧降解能釋放更多的能量,因此在有氧條件下,微生物的生長和降解效率可能更高。

(b) 厭氧降解 (Anaerobic Degradation)

在厭氧條件下,TCE 的降解途徑與好氧條件下顯著不同,通常採用還原脫氯 (reductive dechlorination) 的方式進行。

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第 2 題25 分

微生物在氮的生物地球化學循環扮演舉足輕重的角色。請說明並比較兩類生物性的硝酸鹽還原作用的同與異:硝酸鹽異化還原為氨氮作用(dissimilatory nitrate reduction to ammonia, DNRA)與脫硝作用(denitrification)。

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本題主要考查環境微生物學中氮循環的關鍵過程,特別是兩種硝酸鹽(NO3−NO_3^-)的還原途徑:硝酸鹽異化還原為氨氮(DNRA)和脫硝作用(Denitrification)。

核心觀念:

  • 硝酸鹽(Nitrate): 氮循環中的一種含氧化態氮形式,通常作為氧化劑。
  • 異化作用 (Dissimilatory): 微生物利用某種物質作為能量來源或電子接受者,但該物質的最終產物不被併入微生物的細胞組分中。
  • 同化作用 (Assimilatory): 微生物將某種物質作為細胞生長和合成的原料,最終產物會併入細胞組分中。
  • 電子接受者: 在呼吸作用中,接受電子並被還原的物質。
  • 電子供體: 在呼吸作用中,提供電子的物質,通常是有機物或無機物。

解題思路:
需要分別定義 DNRA 和 Denitrification,然後從反應物、產物、電子供體、能量獲取、環境條件、以及在氮循環中的作用等角度進行比較。

(a) 硝酸鹽異化還原為氨氮 (Dissimilatory Nitrate Reduction to Ammonia, DNRA)

  1. 定義: DNRA 是一種微生物過程,其中硝酸鹽(NO3−NO_3^-)被還原為氨氮(NH3NH_3 或 NH4+NH_4^+),作為一種能量獲取的代謝途徑。硝酸鹽在此過程中作為最終電子接受者。
  2. 反應式(簡化):
    NO3−→e−NO2−→e−NO→e−N2O→e−N2NO_3^- \xrightarrow{e^-} NO_2^- \xrightarrow{e^-} NO \xrightarrow{e^-} N_2O \xrightarrow{e^-} N_2 (Denitrification 途徑)
    NO3−→e−NO2−→e−NH2OH→e−NH3NO_3^- \xrightarrow{e^-} NO_2^- \xrightarrow{e^-} NH_2OH \xrightarrow{e^-} NH_3 (DNRA 途徑)
    一個典型的 DNRA 反應式(以有機物為電子供體,如乙酸鹽):
    2NO3−+5CH3COOH+4H+→2NH4++5CO2+4H2O2NO_3^- + 5CH_3COOH + 4H^+ \rightarrow 2NH_4^+ + 5CO_2 + 4H_2O
    (注意:實際的反應步驟可能更複雜,涉及亞硝酸鹽、亞硝酸根等中間產物,但最終產物是氨氮)
  3. 電子供體: 通常是有機物(如乙酸、葡萄糖、乳酸)或無機物(如 H2H_2、H2SH_2S)。
  4. 能量獲取: 微生物通過將硝酸鹽還原為氨氮,從電子供體中獲取能量,用於 ATP 的合成。
  5. 環境條件: DNRA 通常發生在缺氧或低氧的環境中,且有機物濃度較高、硫化物濃度較低時,與脫硝作用競爭電子供體。
  6. 在氮循環中的作用: DNRA 將硝酸鹽轉化為氨氮,這是一個將硝酸鹽(一種易被植物吸收的形態)轉化為氨氮(另一種植物可吸收的形態,但也可能被進一步硝化或揮發)的過程。它會使氮素保留在水體或土壤系統中,而不是以氣態氮(N2N_2)的形式逸出。

(b) 脫硝作用 (Denitrification)

  1. 定義: 脫硝作用是指一系列的微生物過程,其中硝酸鹽(NO3−NO_3^-)被逐步還原,最終產物是氣態氮(N2N_2)。硝酸鹽在此過程中也作為最終電子接受者。
  2. 反應式(簡化):
    NO3−→NO2−→NO→N2O→N2NO_3^- \rightarrow NO_2^- \rightarrow NO \rightarrow N_2O \rightarrow N_2
    一個典型的脫硝反應式(以有機物為電子供體,如乙酸鹽):
    2NO3−+5CH3COOH→N2+5CO2+3H2O+2OH−2NO_3^- + 5CH_3COOH \rightarrow N_2 + 5CO_2 + 3H_2O + 2OH^-
    (注意:這裡的 OH−OH^- 是為了平衡電荷,實際反應可能與 pH 相關)
  3. 電子供體: 與 DNRA 類似,通常是有機物(如乙酸、葡萄糖、乳酸)或無機物(如 H2H_2、H2SH_2S)。
  4. 能量獲取: 微生物通過將硝酸鹽逐步還原為氣態氮,從電子供體中獲取能量,用於 ATP 的合成。
  5. 環境條件: 脫硝作用也發生在缺氧或低氧環境中。它與好氧呼吸作用(以 O2O_2 為最終電子接受者)競爭有機物。
  6. 在氮循環中的作用: 脫硝作用是氮循環中唯一能將溶解態的氮素(硝酸鹽)轉化為氣態氮(N2N_2)的過程,從而將氮素從生物圈中移除,達到“脫氮”的效果。

(c) 比較 (Comparison)

| 特徵 | 硝酸鹽異化還原為氨氮 (DNRA) | 脫硝作用 (Denitri

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第 3 題25 分

某郊外無外來污染點源且自來水未及地區的地下水,剛取出時發現含有高濃度的砷(~20 ppb)。經調查後得知是因當地某些住戶的化糞池洩漏,使得該地含水層的厭氧微生物受誘發刺激而代謝活躍,進而使得砷從含水層固相移至水溶液相。地質調查與水質分析的結果顯示,該含水層的緩衝力主要來自於碳酸鹽系統,且剛自40米深處抽出的地下水pH值為6,鹼度約為6×10-4 eq/L。請根據上述的資訊,預測此地下水剛抽出時,主要的砷物種為何(五價或是三價),以及經一段時間與周界的大氣達平衡後,其pH值與鹼度的變化又各將會如何(升高或降低)?請詳細說明您的答案。

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本題考查環境化學中,關於砷(Arsenic, As)在地下水中的物種分佈、pH 影響以及碳酸鹽緩衝系統的特性,並結合微生物活動對砷形態的影響。

核心觀念:

  • 砷的氧化態: 砷在環境中常見的氧化態為 +3(三價,如 H3AsO3H_3AsO_3)和 +5(五價,如 H3AsO4H_3AsO_4)。
  • pH 對砷物種的影響: 砷的形態(酸、鹼、中性)取決於其氧化態以及水的 pH 值。
  • 碳酸鹽緩衝系統: CO2CO_2、H2CO3H_2CO_3、HCO3−HCO_3^-、CO32−CO_3^{2-} 之間的平衡,能抵抗 pH 的劇烈變化。
  • 微生物活動與砷: 厭氧微生物的代謝活動可能影響砷的氧化還原狀態,並促進其溶解。
  • 溶解度與 pH: 某些砷化合物的溶解度隨 pH 變化。

解題思路:

  1. 判斷砷的初始物種: 根據地下水的 pH 值、厭氧環境、微生物活動,判斷砷是以 +3 或 +5 價態為主。
  2. 預測 pH 和鹼度變化: 考慮地下水與大氣接觸後,二氧化碳的溶解及其與碳酸鹽系統的交互作用,預測 pH 和鹼度的變化。

(a) 預測地下水剛抽出時的砷物種

  1. 環境條件:

    • 厭氧環境: 化糞池洩漏導致厭氧微生物活躍,這通常意味著還原性較強的環境。
    • 微生物刺激: 微生物活躍促進砷從固相進入水相。
    • pH = 6: 這是弱酸性條件。
    • 總鹼度: 6×10−46 \times 10^{-4} eq/L,相對較低,但來自碳酸鹽系統。
  2. 砷的氧化還原電位:

    • 在還原性環境(厭氧)下,As(+3) 相較於 As(+5) 更穩定。
    • 雖然微生物活動可能涉及砷的氧化還原,但厭氧環境本身傾向於維持較低的氧化還原電位,有利於 As(+3) 的存在。
  3. pH 對砷物種的影響:

    • 五價砷 (As(+5)): 砷酸 (H3AsO4H_3AsO_4) 是弱酸。其 pKa1 約為 2.2,pKa2 約為 6.7,pKa3 約為 11.6。
      • pH < 2.2: H3AsO4H_3AsO_4 (中性)
      • 2.2 < pH < 6.7: H2AsO4−H_2AsO_4^- (一價陰離子)
      • 6.7 < pH < 11.6: HAsO42−HAsO_4^{2-} (二價陰離子)
      • pH > 11.6: AsO43−AsO_4^{3-} (三價陰離子)
    • 三價砷 (As(+3)): 亞砷酸 (H3AsO3H_3AsO_3) 也是弱酸。其 pKa1 約為 9.2。
      • pH < 9.2: H3AsO3H_3AsO_3 (中性)
      • pH > 9.2: H2AsO3−H_2AsO_3^- (一價陰離子)
  4. 綜合判斷:

    • 地下水 pH 為 6。
    • 在 pH=6 時,對於五價砷,主要形態是 H2AsO4−H_2AsO_4^-。
    • 在 pH=6 時,對於三價砷,主要形態是 H3AsO3H_3AsO_3。
    • 考慮到厭氧環境和微生物的還原作用,三價砷 (As(+3)) 在此條件下更可能佔據主導地位,因為 As(+3) 在還原性條件下更為穩定,且 pH=6 遠低於其 pKa,使其主要以中性分子 H3AsO3H_3AsO_3 形式存在。五價砷在此 pH 下雖以 H2AsO4−H_2AsO_4^- 形式存在,但其在還原性環境下的穩定性相對較差。
    • 此外,一些文獻指出,在低 pH 和還原條件下,砷酸鹽(As(+5))可以被還原為亞砷酸鹽(As(+3))。

    預測: 剛抽出時,主要的砷物種是三價砷 (H3AsO3H_3AsO_3)。

(b) 預測與大氣平衡後的 pH 值與鹼度變化

  1. 與大氣平衡的過程:

    • 地下水與大氣接觸後,大氣中的二氧化碳 (CO2CO_2) 會溶解到水中。
    • 溶解的 CO2CO_2 與水反應生成碳酸 (H2CO3H_2CO_3)。
    • 碳酸系統的平衡:CO2(aq)+H2O⇌H2CO3⇌H++HCO3−⇌2H++CO32−CO_2(aq) + H_2O \rightleftharpoons H_2CO_3 \rightleftharpoons H^+ + HCO_3^- \rightleftharpoons 2H^+ + CO_3^{2-}
  2. pH 變化:

    • 地下水 pH=6,鹼度低。
    • 大氣中的 CO2CO_2 分壓約為 4×10−44 \times 10^{-4} atm。
    • 當地下水與大氣接觸時,由於水中溶解的 CO2CO_2 分壓通常低於大氣分壓,會從大氣向水中溶解 CO2CO_2。
    • CO2CO_2 溶解後,會形成碳酸,並解離出 H+H^+。
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第 4 題25 分

人造奈米元素銀顆粒(silver nanoparticles, AgNPs)因其優異的殺菌效果,已廣泛應用在諸如服飾、醫療、甚至玩具等產業。然而,奈米元素銀顆粒的微生物毒性主要來自於一價銀離子 Ag(I),而非零價銀顆粒 Ag(0)(s),這也代表著奈米銀氧化成銀離子是其殺菌的關鍵步驟。在好氧狀態下,奈米元素銀確實極易轉換成銀離子,但如要判斷奈米銀在脫硝狀態下的殺菌效果(即殺菌程度與效率),請問是否可藉由下表的銀與脫硝時所產生的含氮物種彼此間的氧化還原反應的“標準”自由能變化(△G°)來預測?請詳細說明您的答案。

Redox Reactions
Ag(0)(s) + 1/5 NO3- + 6/5 H+ = Ag(I) + 1/10 N2(aq) + 3/5 H2O
Ag(0)(s) + 1/3 NO2- + 4/3 H+ = Ag(I) + 1/6 N2(aq) + 2/3 H2O
Ag(0)(s) + 1/2 NO(aq) + H+ = Ag(I) + 1/4 N2(aq) + 1/2 H2O
Ag(0)(s) + 1/2 N2O(aq) + H+= Ag(I) + 1/2 N2(aq) + 1/2 H2O

AGº (kJ mol-1)
-41.22
66.25
88.2
87.57

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本題考查環境微生物學與環境化學的結合,涉及奈米銀(AgNPs)的殺菌機制、氧化還原反應以及熱力學參數(標準自由能變化 ΔG∘\Delta G^\circ)在預測反應方向和潛在能量釋放中的應用。

核心觀念:

  • 奈米銀的殺菌機制: 主要通過釋放銀離子(Ag(I))來實現,Ag(0) 需要氧化為 Ag(I)。
  • 氧化還原反應: 涉及電子轉移的反應。Ag(0) 被氧化成 Ag(I),而其他物質(如脫硝過程中的氮氧化物)被還原。
  • 標準自由能變化 (ΔG∘\Delta G^\circ): 熱力學參數,用於判斷反應在標準條件下的自發性。
    • ΔG∘<0\Delta G^\circ < 0:反應是自發的(有利於向產物方向進行)。
    • ΔG∘>0\Delta G^\circ > 0:反應是非自發的(不利於向產物方向進行)。
  • 吉布斯自由能與標準電位關係: ΔG∘=−nFE∘\Delta G^\circ = -nFE^\circ,其中 nn 是轉移的電子數,FF 是法拉第常數,E∘E^\circ 是標準電位差。ΔG∘<0\Delta G^\circ < 0 對應 E∘>0E^\circ > 0。
  • 反應的能量釋放: ΔG∘\Delta G^\circ 的絕對值越大,代表反應釋放的能量越多(如果 ΔG∘<0\Delta G^\circ < 0),或反應需要輸入的能量越多(如果 ΔG∘>0\Delta G^\circ > 0)。

解題思路:

  1. 確認 AgNPs 的殺菌機制: 殺菌效果依賴於 Ag(0) 氧化為 Ag(I)。
  2. 分析脫硝過程中的氮物種: 脫硝過程涉及 NO3−→NO2−→NO→N2O→N2NO_3^- \rightarrow NO_2^- \rightarrow NO \rightarrow N_2O \rightarrow N_2 的還原。
  3. 利用 ΔG∘\Delta G^\circ 預測反應的自發性: 檢視表中給出的 Ag(0) 與不同氮氧化物反應的 ΔG∘\Delta G^\circ 值。
  4. 連結 ΔG∘\Delta G^\circ 與殺菌效果: 討論 ΔG∘\Delta G^\circ 的值如何反映 Ag(0) 氧化為 Ag(I) 的潛在能量釋放,進而推斷殺菌的程度與效率。

(a) 奈米銀在脫硝狀態下的殺菌效果預測

答案: 是的,可以藉由表格中的標準自由能變化 (ΔG∘\Delta G^\circ) 來預測奈米銀在脫硝狀態下的殺菌效果。

說明:

  1. 殺菌機制與 Ag(0) 氧化:
    題目已明確指出,奈米銀的殺菌活性主要來自於釋放的銀離子 Ag(I),而非零價銀顆粒 Ag(0)。因此,Ag(0) 必須被氧化成 Ag(I) 才能產生殺菌作用。這個氧化過程需要一個電子接受者。在脫硝的環境中,脫硝過程產生的各種氮氧化物(如 NO3−,NO2−,NO,N2ONO_3^-, NO_2^-, NO, N_2O)可以作為潛在的電子接受者,與 Ag(0) 發生氧化還原反應。

  2. ΔG∘\Delta G^\circ 的意義:
    標準自由能變化 (ΔG∘\Delta G^\circ) 的符號和大小可以告訴我們反應在標準狀態下是否自發,以及反應釋放或吸收能量的程度。

    • 負值 (ΔG∘<0\Delta G^\circ < 0): 表示反應是自發的,有利於向產物方向進行。 ΔG∘\Delta G^\circ 的絕對值越大,表示反應越自發,釋放的能量越多。
    • 正值 (ΔG∘>0\Delta G^\circ > 0): 表示反應是非自發的,需要外部能量輸入才能進行。
  3. 分析表格中的反應:
    表格中列出了 Ag(0) 與脫硝過程中可能出現的幾種氮氧化物(NO3−,NO2−,NO,N2ONO_3^-, NO_2^-, NO, N_2O)的反應,以及對應的 ΔG∘\Delta G^\circ 值。這些反應的共同特徵是 Ag(0) 被氧化成 Ag(I),而氮氧化物被還原成 N2N_2。

    • 反應 1:Ag(0) + NO3−NO_3^- →\rightarrow Ag(I) + N2N_2
      ΔG∘=−41.22\Delta G^\circ = -41.22 kJ/mol。
      此反應為自發反應 (ΔG∘<0\Delta G^\circ < 0)。這意味著在標準條件下,Ag(0) 可以與硝酸鹽反應,生成銀離子 Ag(I) 和氮氣 N2N_2。這個反應釋放出能量。
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