112 年 國立臺灣大學植物病理與微生物學系碩士班甲組《植物病理學》
第 1 題
請寫出下列10個病原菌(學名)所引起的植物病害名稱(中文名稱或英文名稱皆可)。
(1) Synchytrium endobioticum
(2) Phytophthora infestans
(3) Plasmodiophora brassicae
(4) Plasmopara viticola
(5) Taphrina deformans
(6) Ustilago maydis
(7) Hemileia vastatrix
(8) Candidatus Liberibacter asiaticus
(9) Erwinia amylovora
(10) Bursaphelenchus xylophilus
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本題主要在考驗學生對重要植物病原菌學名的熟悉度,以及其所引起之代表性病害名稱的認知。這類題目是植物病理學的基礎知識,需要記憶。
- Synchytrium endobioticum: 此菌引起馬鈴薯瘡痂病 (Potato wart)。
- Phytophthora infestans: 此菌引起馬鈴薯晚疫病 (Late blight of potato)。
- Plasmodiophora brassicae: 此菌引起十字花科蔬菜的ㄡㄚ病 (Clubroot of crucifers)。
- Plasmopara viticola: 此菌引起葡萄霜黴病 (Downy mildew of grape)。
- Taphrina deformans: 此菌引起桃樹的瘡痂病或褐紋病 (Peach leaf curl)。
- Ustilago maydis: 此菌引起玉米黑粉病 (Corn smut)。
- Hemileia vastatrix: 此菌引起咖啡的葉鏽病 (Coffee leaf rust)。
第 2 題5 分
引起植物葉片產生黃化的可能病因有哪些?
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植物葉片黃化 (chlorosis) 是植物受到逆境或病害影響時常見的症狀之一,其發生原因多樣,與葉綠素的合成、分解或功能受損有關。以下列出幾種可能導致植物葉片黃化的病因:
- 營養缺乏: 葉片無法合成足夠的葉綠素,常見於缺乏氮 (N)、鎂 (Mg)、鐵 (Fe) 等元素。例如,缺氮通常導致老葉先黃化,缺鎂則在老葉葉脈間黃化;缺鐵則常在嫩葉葉脈間黃化。
- 病原菌感染:
- 病毒病: 許多病毒感染會干擾植物代謝,導致葉綠素合成受阻或加速分解,產生嵌紋、黃化、斑駁等症狀。
- 細菌性病害: 部分細菌感染,如萎凋病、黃單胞病等,會影響植物水分運輸或產生毒素,間接導致葉片黃化。
- 真菌性病害: 某些真菌,如引起白粉病、露菌病、鏽病等,雖然主要症狀不同,但嚴重感染時也可能導致葉片黃化。
第 3 題
二、鐮孢菌 Fusarium 菌種與菌株的分類地位有許多特殊的考量。比如Fusarium oxysporum 在屬名與種名之外,另使用 species complex、formae specialis (f. sp.)、race等單位以做區分。
- 請問 species complex的分類依據是什麼?(4分)除 Fusarium oxysporum species complex (FOSC)之外,請舉一例植物病原菌的 species complex。(1分)
- 請問 formae specialis (f. sp.)的分類依據是什麼?(4分)請舉一例 Fusarium oxysporum f. sp.。(1分)
- 請問 race 的分類依據是什麼?(4分)除 Fusarium外,請舉一列常用race分類的植物病原菌。(1分)
- Fusarium oxysporum 的植物宿主偏好性取決於該菌株是否帶有影響宿主偏好性的致病因子。請問現今研究發現這些致病因子通常位於基因體的哪些位置?(2分)這些致病因子可能透過什麼機制改變,進而使得菌株的宿主偏好性改變?(3分)
- 除了傳統的菌株分類單位之外,近年來學者提出 Pangenome的想法。請問 Pangenome 的分類概念是什麼?(2分)請問 open pangenome 和 closed pangenome 的生物學意義是什麼?(3分)
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本題主要探討真菌,特別是 Fusarium 屬的分類系統,以及近年來基因體學發展對病原菌分類和演化的新觀點。
題組共用題幹
鐮孢菌 (Fusarium) 屬的分類,特別是 Fusarium oxysporum,是一個複雜的例子,其中除了屬名和種名外,還引入了 species complex、formae specialis (f. sp.) 和 race 等不同層級的分類單位,以更精確地描述菌株之間的差異及其與宿主的關係。
1. Species complex 的分類依據是什麼?(4分)除 Fusarium oxysporum species complex (FOSC)之外,請舉一例植物病原菌的 species complex。(1分)
- 分類依據: Species complex 的分類主要依據是形態學、生理學、生化學、分子生物學 (如 ITS 序列、rDNA 基因、蛋白質編碼基因等) 以及致病性等綜合證據。然而,在某些情況下,即使菌株之間在形態或生理上差異不大,但由於在分子水平上存在明顯的遺傳分歧,或者在致病譜上表現出顯著差異,它們可能被歸類為一個 species complex。這個分類單位代表了一群形態相似但可能在遺傳上尚未完全分化,或僅僅因為致病譜不同而需要區分的菌株群體。
- 範例: 除了 Fusarium oxysporum species complex (FOSC) 外,另一個常見的例子是 Colletotrichum gloeosporioides species complex,它包含了許多與植物病害相關的菌株,在形態上難以區分,但其遺傳背景和宿主範圍可能差異很大。
【答案】Species complex 的分類依據是形態學、生理學、生化學、分子生物學及致病性等綜合證據;Colletotrichum gloeosporioides species complex。
2. 請問 formae specialis (f. sp.) 的分類依據是什麼?(4分)請舉一例 Fusarium oxysporum f. sp.。(1分)
- 分類依據: Forma specialis (f. sp.) 是用來區分同一種菌中,對特定植物類群或特定植物種類具有專一性感染能力的菌株群。其分類依據主要是宿主專一性。也就是說,即使這些菌株在形態學、生理學或分子生物學上差異不大,但它們能感染的植物種類不同,就會被劃分為不同的 forma specialis。
- 範例: Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici,這是引起番茄萎凋病 (Tomato wilt) 的專一性型。
【答案】Formae specialis (f. sp.) 的分類依據是宿主專一性;Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici。
3. 請問 race 的分類依據是什麼?(4分)除 Fusarium外,請舉一列常用race分類的植物病原菌。(1分)
- 分類依據: Race 是比 forma specialis 更精細的分類層級,用於區分同一 forma specialis 中,對同一種植物的不同品種或品系具有不同致病性的菌株群。其分類依據是對特定植物品種的致病性差異。簡單來說,能克服不同抗病品種的菌株,就被劃分為不同的 race。
- 範例: 除了 Fusarium 外,許多重要的植物病原菌都會使用 race 的分類,例如:
- Puccinia striiformis (小麥條銹病菌)
- Phytophthora infestans (馬鈴薯晚疫病菌)
第 4 題20 分
三、請回答下列問題:
- 請描述毒素(toxins)如何幫助病原菌感染植物,請以三種以上由病原菌產生的毒素為例說明之。(10分)
- 請解釋下列植物病理學名詞:(15分,每小題3分)
(1) Pathogen-associated molecular patterns
(2) Type III secretion system
(3) Oxidative burst in plant defense
(4) Gummosis
(5) Cross-kingdom RNAi
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本大題包含兩部分,第一部分考驗學生對病原菌毒素在植物病害發生中作用的理解,第二部分則涵蓋了植物病理學中的重要名詞解釋,涉及植物免疫、病原菌效應機制、植物防禦反應以及病害症狀。
1. 請描述毒素(toxins)如何幫助病原菌感染植物,請以三種以上由病原菌產生的毒素為例說明之。(10分)
毒素 (toxins) 是由病原菌產生的代謝產物,它們能夠影響植物細胞的生理功能,降低植物的抗病力,或直接造成組織損傷,從而幫助病原菌建立感染。毒素在植物病害發生中的作用機制多樣,主要包括:
- 破壞細胞膜的完整性: 導致細胞內容物外洩,細胞死亡,為病原菌提供營養。
- 抑制關鍵酶的活性: 干擾植物的代謝途徑,如光合作用、呼吸作用。
- 干擾植物激素平衡: 影響植物的生長發育,使植物更容易被感染。
- 誘導植物產生過敏反應 (Hypersensitive response, HR): 雖然 HR 是植物的防禦機制,但某些毒素可以誘導 HR,導致感染部位周圍組織壞死,從而限制病原菌的擴散。
三種以上的毒素範例說明:
-
Altemaria alternata Toxin (AAL toxin):
- 病原菌: Alternaria alternata f. sp. lycopersici。
- 作用機制: AAL 毒素是一種細胞毒素,它會干擾植物的細胞膜離子通道,特別是鉀離子 (K+) 的運輸,導致細胞膜滲透性改變,鉀離子大量外流。這會引發細胞離子失衡,進而導致細胞死亡。此外,AAL 毒素還能誘導植物產生活性氧 (ROS),進一步加劇細胞損傷。它也會影響植物的生長素 (auxin) 代謝,造成植物生長異常。
- 幫助感染: 通過破壞細胞膜和誘導細胞死亡,AAL 毒素為病原菌創造了有利的營養環境,並削弱了植物的組織結構,有利於病原菌的入侵和擴散。
-
Phaseolotoxin:
- 病原菌: Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola (菜豆تاجها桿菌,菜豆白絹病菌)。
- 作用機制: Phaseolotoxin 是一種鳥氨酸氨甲醯基轉移酶 (ornithine carbamoyltransferase, OCTase) 的抑制劑。OCTase 是尿素循環中的一個關鍵酶,對於植物合成某些胺基酸 (如精氨酸) 和維持氮平衡至關重要。Phaseolotoxin 抑制 OCTase 後,導致鳥氨酸積累,並抑制精氨酸的合成。這會干擾植物的代謝,影響蛋白質合成,並可能導致葉片出現綠脈黃化 (veinal chlorosis) 的症狀。
- 幫助感染: 抑制植物的正常代謝,削弱植物的生長和抗性,為病原菌的定殖和擴散提供便利。
-
Tabtoxinine-β-lactam (ToxA):
- 病原菌: Pseudomonas syringae pv. tabaci (煙草黃單胞桿菌,煙草黃斑病菌)。
- 作用機制: ToxA 是一種毒素,它會不可逆地結合並抑制植物的穀氨醯胺合成酶 (glutamine synthetase, GS)。GS 酶是植物吸收和同化氨 (NH4+) 的關鍵酶,對於蛋白質合成和維持氮平衡至關重要。GS 被抑制後,氨在葉片中積累,導致細胞膜受損,葉片出現黃化,嚴重時形成壞疽。
- 幫助感染: 通過破壞葉片組織和功能,ToxA 誘導的黃化和壞疽,為病原菌提供營養,並限制植物的進一步防禦反應。
【答案】毒素透過破壞細胞膜、抑制關鍵酶、干擾植物激素、誘導過敏反應等方式幫助病原菌感染;範例毒素及其作用機制包括 AAL toxin (破壞細胞膜、誘導 ROS)、Phaseolotoxin (抑制 OCTase、干擾胺基酸合成) 和 Tabtoxinine-β-lactam (抑制 GS、導致氨積累)。
第 5 題12 分
四、
- 請說明下列三種化學藥劑的作用機制為何?並寫出該藥劑可以使用於哪一種番茄病害(請由番茄細菌性斑點病、炭疽病、疫病等三種病害中選填)。(12分)
(1)曼普胺
(2)待克利
(3)嘉賜銅 - CRISPR Cas9 及分子標誌輔助選拔是現代常用的作物抗病育種技術,請分別說明兩種技術的原理和進行流程為何?(10分)並比較其優缺點。(3分)
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好的,這題主要考驗學生對植物保護化學藥劑作用機制的理解,以及現代分子育種技術在抗病育種上的應用。
四、
1. 三種化學藥劑的作用機制與應用病害
本題要求說明三種化學藥劑的作用機制,並將其應用於指定的番茄病害(番茄細菌性斑點病、炭疽病、疫病)。
(1) 曼普胺 (Mancozeb)
- 作用機制: 曼普胺是一種多位點作用的保護性殺菌劑,屬於有機鋅類殺菌劑。其作用機制是透過釋放出二價鋅離子(Zn)和二硫代氨基甲酸鹽(dithiocarbamate)離子。這些離子能夠與病原真菌細胞內的許多關鍵酶(特別是含硫的酶,如參與呼吸作用和能量代謝的酶)上的硫氫基(-SH)發生反應,形成穩定的硫化物鍵,從而抑制酶的活性,干擾真菌的呼吸作用、能量產生和細胞分裂,達到殺菌效果。由於其作用位點多,不易產生抗藥性。
- 適用病害: 曼普胺對多種真菌病害具有廣泛的防治效果,包括白粉病、露菌病、晚疫病、炭疽病等。在番茄病害中,它對疫病(由 Phytophthora infestans 引起)和炭疽病(由 Colletotrichum spp. 引起)均有良好的防治效果。
(2) 待克利 (Tebuconazole)
- 作用機制: 待克利屬於三唑類(Triazole)殺菌劑,是一種系統性殺菌劑。其作用機制是抑制病原真菌細胞膜合成中的一個關鍵步驟,即抑制羊毛甾醇 14α-去甲基化酶(lanosterol 14α-demethylase),這是一種細胞色素 P450 依賴性酶。該酶負責將羊毛甾醇轉化為麥角固醇(ergosterol)。麥角固醇是真菌細胞膜的重要組成成分,缺乏麥角固醇會導致細胞膜結構和功能異常,影響細胞膜的通透性,最終抑制真菌的生長和繁殖。
- 適用病害: 待克利對多種真菌病害有效,特別是白粉病、鏽病、葉斑病等。在番茄病害中,它對由真菌引起的葉斑病(如早疫病、瘡痂病)有較好的防治效果,但對疫病(卵菌)和細菌性斑點病無效。在提供的選項中,炭疽病(由真菌引起)是待克利可適用的病害。
(3) 嘉賜銅 (Kasugamycin)
- 作用機制: 嘉賜銅是一種氨基糖苷類抗生素,具有保護和治療作用。其作用機制是抑制病原細菌的蛋白質合成。它能與細菌核糖體 30S 和 50S 的亞單位結合,干擾 mRNA 的讀碼過程,導致合成錯誤的蛋白質,或阻止肽鏈的延長,從而抑制細菌的生長和繁殖。嘉賜銅對某些真菌病害也有一定的抑制作用,但其主要用途是防治細菌性病害。
- 適用病害: 嘉賜銅主要用於防治細菌性病害,如稻瘟病(細菌性)、軟腐病、青枯病等。在番茄病害中,它對番茄細菌性斑點病(由 Xanthomonas spp. 引起)具有顯著的防治效果。
總結:
- 曼普胺:抑制多種酶活性,適用於番茄疫病和炭疽病。
- 待克利:抑制麥角固醇合成,適用於番茄炭疽病。
- 嘉賜銅:抑制細菌蛋白質合成,適用於番茄細菌性斑點病。
【答案】
(1) 曼普胺:作用機制為釋放 Zn 和 dithiocarbamate 離子,與病原真菌細胞內含硫的酶結合,抑制呼吸作用及能量代謝。適用於番茄疫病或炭疽病。
(2) 待克利:作用機制為抑制羊毛甾醇 14α-去甲基化酶,阻礙真菌細胞膜上麥角固醇的合成,影響細胞膜功能。適用於番茄炭疽病。
(3) 嘉賜銅:作用機制為抑制細菌核糖體蛋白質合成,干擾 mRNA 讀碼。適用於番茄細菌性斑點病。
2. CRISPR Cas9 與分子標誌輔助選拔技術
本題要求說明 CRISPR Cas9 和分子標誌輔助選拔這兩種現代作物抗病育種技術的原理、流程、優缺點。
(a) CRISPR Cas9 技術
- 原理: CRISPR Cas9 是一種基因編輯技術,其核心是一個 Cas9 核酸酶和一個引導 RNA (guide RNA, gRNA)。gRNA 包含兩個部分:一個是與目標 DNA 序列互補的識別序列,另一個是與 Cas9 蛋白結合的支架序列。gRNA 會引導 Cas9 蛋白識別並結合到基因組中與 gRNA 識別序列互補的特定 DNA 位置。一旦結合,Cas9 蛋白就會在目標 DNA 位點產生雙鏈斷裂 (double-strand break, DSB)。細胞在修復這個斷裂時,可以利用內源性的修復途徑(如非同源末端連接, NHEJ 或同源重組修復, HDR)。如果提供了外源的 DNA 修復模板,就可以在目標位點精確地插入、刪除或替換 DNA 序列,從而實現基因的精確編輯。在抗病育種中,可以利用此技術敲除(knock out)或修飾與抗病性相關的基因,或導入抗病基因。
- 進行流程:
- 目標基因選擇與設計 gRNA: 確定需要編輯的抗病相關基因(例如,一個易感性基因,或一個調控抗病反應的基因),並設計能夠特異性結合該基因目標位點的 gRNA 序列。