114 年 國立臺灣大學園藝暨景觀學研究所園藝作物組《園藝作物遺傳及育種學》

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第 一 題12 分

右圖為細胞分裂的各時期 (G1, S, G2 及 M) 及其相對時間圖,試問:
a. 間期 (Interphase) 包含哪些時期? 其時間有多長。
b. 以桑為例,其二倍體 genome DNA content 為 C,請標註右圖各時期的 genome DNA content。
c. 承上,欲檢查桑種原圃中各品系是否為多倍體,應檢驗何時期的 genome DNA content?
d. 試驗進行時其取樣部位為何?
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本題主要考查細胞週期 (cell cycle) 的各個時期及其 DNA 含量的變化,以及在植物育種中如何利用 DNA 含量來判斷多倍體。

a. 間期 (Interphase) 是細胞分裂週期中 M 期 (mitotic phase) 以外的時間,細胞在此時期進行生長、代謝以及 DNA 的複製。間期包含三個時期:

  • G1 期 (Growth 1): 細胞生長和代謝活躍的時期。
  • S 期 (Synthesis): DNA 複製的時期,染色體數目不變,但 DNA 含量加倍。
  • G2 期 (Growth 2): 細胞為進入 M 期做準備,合成必要的蛋白質。
    從圖中可以看出,間期包含了 G1、S、G2 三個時期。圖中標示的 "Interphase" 時間為 9 小時。

b. 題目假設桑為二倍體 (2n),其二倍體 genome DNA content 為 C。

  • G1 期: 細胞處於二倍體狀態,DNA 含量為 C。

  • S 期: DNA 開始複製,DNA 含量從 C 逐漸增加到 2C。

  • G2 期: DNA 複製完成,細胞 DNA 含量為 2C。

  • M 期 (Mitosis):

    • Prophase (前期) 和 Metaphase (中期): 細胞 DNA 含量為 2C。
    • Anaphase (後期): 姐妹染色分體分離,此時細胞內瞬間 DNA 含量會加倍,但若以「核」來看,每個子核 DNA 含量為 C,但因有兩個子核,故總 DNA 含量為 2C (相當於兩個 C)。然而,若題目是指「細胞」整體的 DNA 含量,則此時為 4C,因為染色體數目加倍。更精確的說法是,此時細胞內有 4n 的染色體數目,每個染色體只有一條染色分體,DNA 含量為 4C。
    • Telophase (末期): 細胞開始分裂為兩個子細胞,每個子細胞的 DNA 含量回到 C。

    根據圖示的相對時間,M 期 (Mitosis) 的時間約為 3 小時。

    因此,各時期的 DNA content 標註如下:

    • G1: C
    • S: 從 C 增加到 2C
    • G2: 2C
    • M 期:
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第 二 題12 分

The following table presents chromosome data on four species of plants and their F1 hybrids:
a. Deduce the chromosomal origin of species A.
b. How many bivalents and univalents would you expect to observe at meiotic metaphase I in a hybrid between species D and species B?
c. How many bivalents and univalents would you expect to observe at meiotic metaphase I in a hybrid between species C and species B?

Species or F1Chromosome NumberNumber of BivalentsNumber of Univalents
A20100
B20100
C1050
D1050
A x B20020
A x C1555
A x D1555
C x D10010

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核心觀念

本題考查物種間染色體的同源性、二倍體與異源多倍體的判定,以及雜交後在減數分裂第一次中期(meiotic metaphase I)的聯會形式。

  • 二價體(bivalent):兩條同源染色體聯會形成的結構。
  • 單價體(univalent):未找到同源染色體配對的單條染色體。
  • 若某物種具有 2n2n 條染色體,其配子通常具有 nn 條染色體。
  • 兩物種雜交所得 F1 的染色體數目為雙方配子染色體數目的總和。
  • 具有同源關係的染色體可形成二價體;無同源關係的染色體則以單價體存在。
  • 若一物種含有來自兩個不同物種的染色體組,且染色體數目加倍,稱為異源四倍體(allotetraploid)。

解題方法

先由各物種本身的染色體資料判斷其基本染色體組:

  • B:2n=202n=20,因此配子含 n=10n=10。
  • C:2n=102n=10,因此配子含 n=5n=5。
  • D:2n=102n=10,因此配子含 n=5n=5。
  • A:2n=202n=20,但需由雜交資料判斷其染色體來源。

判斷二價體的原則是:

每個二價體需要兩條彼此同源的染色體\text{每個二價體需要兩條彼此同源的染色體}

因此,若 F1 中有 kk 個二價體,便代表有 2k2k 條染色體參與配對;其餘染色體都是單價體:

單價體數=F1染色體總數−2(二價體數)\text{單價體數} = \text{F1染色體總數} - 2(\text{二價體數})

(a)推導物種 A 的染色體來源

第一步:分析 A 與 B 的雜交

A 與 B 的 F1 資料為:

  • 染色體總數:2020
  • 二價體:00
  • 單價體:2020

A 與 B 雜交時,雙方染色體完全沒有形成聯會,表示 A 的染色體組與 B 的染色體組不具同源性。

因此,A 並非由 B 的染色體組所構成。

第二步:分析 A 與 C 的雜交

A 與 C 的 F1 為:

  • 染色體總數:1515
  • 二價體:55
  • 單價體:55

C 的配子含有 55 條染色體,而 A 的配子含有 1010 條染色體:

10+5=1510+5=15

其中 55 個二價體共使用:

5×2=10 條染色體5\times 2=10\text{ 條染色體}

另外有 55 條染色體未配對。

這表示 A 的配子中有 55 條染色體與 C 的染色體同源,另有 55 條染色體與 C 不同源。

第三步:分析 A 與 D 的雜交

A 與 D 的 F1 同樣為:

  • 染色體總數:1515
  • 二價體:55
  • 單價體:55

D 也提供 55 條染色體,且能與 A 配子中的其中 55 條染色體形成二價體。

第四步:利用 C 與 D 的雜交確認來源

C 與 D 的 F1 為:

  • 染色體總數:1010
  • 二價體:00
  • 單價體:1010

因此,C 與 D 彼此不具同源性。

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第 三 題12 分

Waxy endosperm (wx), shrunken endosperm (sh), and yellow seedling (v) are encoded by three recessive genes in corn that are linked on chromosome 5. A corn plant homozygous for all three recessive alleles is crossed with a plant homozygous for all the dominant alleles. The resulting F1 are then crossed with a plant homozygous for the recessive genes in a three-point testcross. Following are the progeny of the testcross:

GenotypeNumber of Progeny
wx sh v87
Wx Sh v94
Wx Sh V3479
wx sh V3478
Wx sh v1515
wx Sh v1531
Wx Sh V292
wx sh V280
Total10,756

a. Determine order of these genes on the chromosome. (5%)
b. Calculate the map distances between the genes. (5%)

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核心觀念

本題考查三點測交(three-point testcross)與基因定位:

  • 測交後代的基因型可直接反映 F1 配子的基因型。
  • 親本型(parental classes)通常為數量最多的兩類。
  • 雙交換型(double-crossover, DCO)通常為數量最少的兩類。
  • 比較親本型與雙交換型,只有位於中間的基因會改變。
  • 染色體圖距以重組率表示:
圖距(cM)=該區間單交換型數+雙交換型數總後代數×100\text{圖距(cM)} = \frac{\text{該區間單交換型數+雙交換型數}}{\text{總後代數}} \times 100

題目表格有基因型重複、互補類別缺漏的排版誤植。依照八類後代應互補成對,並依頻數判定的正確分類如下:

類型配子基因型數量
親本型Wx Sh VWx\ Sh\ V3479
親本型wx sh vwx\ sh\ v3478
單交換型Wx sh vWx\ sh\ v1515
單交換型wx Sh Vwx\ Sh\ V1531
單交換型Wx sh VWx\ sh\ V292
單交換型wx Sh vwx\ Sh\ v280
雙交換型Wx Sh vWx\ Sh\ v94
雙交換型wx sh Vwx\ sh\ V87

總數:

N=10756N=10756

解題方法

1. 判定親本型

數量最多的兩類為:

Wx Sh V=3479Wx\ Sh\ V=3479 wx sh v=3478wx\ sh\ v=3478

因此親本染色體組合為:

Wx Sh V  /  wx sh vWx\ Sh\ V \;/\; wx\ sh\ v

2. 判定雙交換型

數量最少的兩類為:

Wx Sh v=94Wx\ Sh\ v=94 wx sh V=87wx\ sh\ V=87

將雙交換型與親本型比較:

  • Wx Sh V→Wx Sh vWx\ Sh\ V \rightarrow Wx\ Sh\ v
  • wx sh v→wx sh Vwx\ sh\ v \rightarrow wx\ sh\ V

可見只有 v/Vv/V 的位置相對於另外兩個基因發生改變,因此 vv 位於中間。

所以基因順序為:

wx−v−sh\boxed{wx-v-sh}

等價地,也可寫成:

sh−v−wxsh-v-wx

基因圖距計算

基因順序為:

wx  −  v  −  shwx \;-\; v \;-\; sh
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第 四 題16 分

配合題:(16%)
左列有8個詞彙(Term),請填寫對應的定義(Definition)。

TermDefinition
1. phenocopyA.
2. pleiotrophyB.
3. polygenic traitC.
4. penetranceD.
5. sex-limited traitE.
6. genetic maternal effectF.
7. genomic imprintingG.
8. sex-influenced traitH.

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核心觀念

本題考查遺傳學中「基因型、表現型與環境」之間的關係,以及性別、母體遺傳效應與表觀遺傳對性狀表現的影響。判斷重點如下:

  • 一個基因影響一個以上性狀:多效性(pleiotropy)。
  • 多個基因共同影響一個性狀:多基因性狀(polygenic trait)。
  • 基因型相同但環境造成不同表現:phenocopy。
  • 具有特定基因型者實際表現性狀的比例:penetrance。
  • 性狀只在單一性別表現:sex-limited trait。
  • 性狀在兩性皆可表現,但表現程度或顯性關係受性別影響:sex-influenced trait。
  • 子代表現受母本基因型控制:genetic maternal effect。
  • 基因表現受其來自父方或母方的親本來源影響:genomic imprinting。

解題方法

配合題的判斷方式是先看每個名詞的關鍵字,再與定義配對:

  1. 看到「環境造成類似遺傳突變的表現型」,判定為 phenocopy。
  2. 看到「一個基因影響多個性狀」,判定為 pleiotropy。
  3. 看到「多個基因共同控制一個性狀」,判定為 polygenic trait。
  4. 看到「具有某基因型的個體中,實際表現性狀的比例」,判定為 penetrance。
  5. 看到「只在雄性或只在雌性表現」,判定為 sex-limited trait。
  6. 看到「子代表現由母本基因型決定」,判定為 genetic maternal effect。
  7. 看到「父源、母源基因的表現不同」,判定為 genomic imprinting。
  8. 看到「兩性皆能表現,但顯性程度或表現強弱不同」,判定為 sex-influenced trait。

各名詞與定義分析

1. phenocopy

定義:A

Phenocopy 是指環境因素造成的表現型,恰好類似某一種由遺傳變異造成的表現型。

例如,某些植物因營養缺乏而出現葉片黃化,其外觀可能類似葉綠素合成基因突變所造成的黃化,但其基因型並未發生相同突變。這種由環境模仿遺傳表現的現象,即為 phenocopy。

判斷重點是:

不同基因型+特定環境⟶類似的表現型\text{不同基因型}+\text{特定環境} \longrightarrow \text{類似的表現型}

Phenocopy 的本質是「表現型相似,但成因不同」。


2. pleiotrophy(標準拼法為 pleiotropy)

定義:B

Pleiotropy 中文稱為「基因多效性」,指單一基因會同時影響兩個以上彼此相關或不相關的性狀。

例如,一個基因的突變可能同時影響植物的株高、花色、種子活力與生育能力。原因通常是該基因產物參與共同的代謝途徑、細胞訊息傳遞途徑,或在多種組織中發揮功能。

可用下式表示:

1 個基因⟶多個性狀1\text{ 個基因} \longrightarrow \text{多個性狀}

本題題目列出的 pleiotrophy 通常是指標準遺傳學術語 pleiotropy。


3. polygenic trait

定義:C

Polygenic trait 中文稱為「多基因性狀」,指一個性狀由許多基因共同控制,每個基因通常只貢獻一部分效果。

園藝作物中的株高、果實重量、成熟期、糖度、產量與抗逆境能力,常具有多基因控制的特性。由於各基因的微小效應累加,加上環境變異影響,這類性狀通常呈現連續變異,而不是明確分成少數幾種類型。

其基本關係為:

多個基因⟶1 個數量性狀\text{多個基因} \longrightarrow 1\text{ 個數量性狀}

多基因性狀常具有以下特徵:

  • 表現型呈連續分布。
  • 受環境影響較大。
  • 通常屬於數量性狀。
  • 單一基因的效應往往不易直接由外觀辨認。

這與 pleiotropy 必須區分:pleiotropy 是「一個基因影響多個性狀」,polygenic trait 是「多個基因影響一個性狀」。


4. penetrance

定義:D

Penetrance 中文稱為「外顯率」,是指具有某一特定基因型的個體中,實際表現出相對應表現型的比例。

其計算公式為:

Penetrance=表現出該性狀的個體數具有該基因型的個體總數×100%\text{Penetrance} = \frac{\text{表現出該性狀的個體數}} {\text{具有該基因型的個體總數}} \times 100\%

例如,若有 100100 株植物具有某一抗病基因型,但只有 8080 株實際表現抗病,則:

Penetrance=80100×100%=80%\text{Penetrance} = \frac{80}{100}\times 100\% = 80\%

外顯率可分為:

  • 完全外顯:100%100\% 的基因型攜帶者都表現該性狀。
  • 不完全外顯:只有部分基因型攜帶者表現該性狀。

Penetrance 是「有多少個體表現」的比例;expressivity 則是「表現程度有多強」。兩者不可混為一談。


5. sex-limited trait

定義:E

Sex-limited trait 中文稱為「性別限制性狀」,指控制性狀的基因可能存在於雌雄兩性,但性狀只在其中一種性別表現。

例如,乳牛的泌乳能力由基因控制,但自然情況下只有雌牛會泌乳。相關基因並非只存在於雌性,而是受到性別特有的生理構造與荷爾蒙環境限制。

在植物中,雌雄異株植物的某些花器官形成、性別特異性開花表現,也可呈現類似的性別限制現象。

其重點是:

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第 五 題30 分

是非題(每題2分,共30分)

  1. 常見的多倍體園藝作物中,一般的栽培種草莓(Fragaria xananassa)是八倍體,香蕉則是三倍體。
  2. 由於香蕉使用有性繁殖方式進行育種較為困難,故體細胞變異(somaclonal variation)為香蕉選育的可行策略,台灣曾使用組織培養體細胞變異技術育成’寶島蕉”與台蕉5號”等耐黃葉病品種。

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這一題的完整詳解

本題考查園藝作物中多倍體的種類、香蕉的育種策略以及體細胞變異的應用。

  1. 常見的多倍體園藝作物中,一般的栽培種草莓(Fragaria xananassa)是八倍體,香蕉則是三倍體。
    • 栽培種草莓 (Fragaria xananassa):栽培種草莓確實是 八倍體 (octoploid, 2n=8x=56)。
    • 香蕉 (Musa spp.):大多數栽培香蕉是 三倍體 (triploid, 2n=3x=33),例如常見的 Cavendish 品種。三倍體香蕉通常是無籽的,因為減數分裂過程中染色體數不均,難以產生可育的配子。
    • 此敘述是 正確 的。
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第 1 (頁碼2) 題

Doubled haploid 也是雜交育種流程中用來創造分離族群的技術之一,其產生的族群個體通常為異質結合。

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此題考查雙單倍體 (Doubled haploid, DH) 技術在育種上的應用。

敘述分析:
「Doubled haploid 也是雜交育種流程中用來創造分離族群的技術之一」:這是正確的。DH 技術的目的是快速獲得純系,用於創育雜交種或加速育種進程。
「其產生的族群個體通常為異質結合」:這是 錯誤 的。

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第 2 (頁碼2) 題

CRISPR/Cas9 技術屬於基因編輯 (gene editing) 技術,與傳統誘變育種相比,基因編輯技術對整個基因組序列的變動較多。

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此題考查 CRISPR/Cas9 基因編輯技術的特性及其與傳統誘變育種的比較。

敘述分析:
「CRISPR/Cas9 技術屬於基因編輯 (gene editing) 技術」:這是 正確 的。CRISPR/Cas9 是一種精確的基因編輯工具,可以在目標 DNA 位點進行切割、插入或刪除。
「與傳統誘變育種相比,基因編輯技術對整個基因組序列的變動較多」:這是 錯誤 的。

  • CRISPR/Cas9 技術 的主要優勢在於其 精確性。
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第 3 (頁碼2) 題

多態性/多型性 (polymorphism) 是遺傳多樣性的基礎,育種上常指一個物種的同一種群中,某性狀或某基因存在三種以上明顯不同的表型或基因型。

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此題考查遺傳學中「多態性」(polymorphism) 的定義。

敘述分析:
「多態性/多型性 (polymorphism) 是遺傳多樣性的基礎」:這是 正確 的。多態性是種群內存在兩種或兩種以上等位基因或基因型,是遺傳變異的體現。
「育種上常指一個物種的同一種群中,某性狀或某基因存在三種以上明顯不同的表型或基因型」:這是 錯誤 的。

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第 4 (頁碼2) 題

自交作物在自然情況下,族群個體的遺傳組成通常為高度同質結合(homozygous);異交作物如能人為進行多代自交,也會有高度同質結合之情形。

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此題考查自交作物與異交作物的遺傳組成特徵。

敘述分析:
「自交作物在自然情況下,族群個體的遺傳組成通常為高度同質結合(homozygous)」:這是 正確 的。自交 (self-pollination) 會導致雜合子 (heterozygote) 的頻率逐代降低,而純合子 (homozygous) 的頻率逐代增加。經過多代自交後,族群中的個體會變得高度純合。

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第 5 (頁碼2) 題

果樹常因幼年性時間長,造成能實行之育種世代較少,故會以營養系(clone)固定遺傳性狀及維持開花能力,因此無論是自交或異交作物之果樹,較常見仍是高度異質結合(heterozygous)之遺傳組成。

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此題考查果樹育種的特性,特別是幼年期長、營養繁殖以及遺傳組成。

敘述分析:
「果樹常因幼年性時間長,造成能實行之育種世代較少」:這是 正確 的。許多果樹,如蘋果、梨、柑橘等,從種子萌發到開花結果需要數年甚至十幾年的時間,這大大延長了育種週期。

「故會以營養系(clone)固定遺傳性狀及維持開花能力」:這是 正確 的。由於幼年期長,育種進程緩慢,因此果樹育種常採用營養繁殖 (vegetative propagation) 的方式,例如嫁接、扦插、壓條等,來獲得營養系 (clone)。營養系是來自同一母株的個體,它們在遺傳上是相同的,能夠固定優良的性狀(如果實品質、產量、抗病性等),並確保其開花結果的能力。

「因此無論是自交或異交作物之果樹,較常見仍是高度異質結合(heterozygous)之遺傳組成」:這句話是 錯誤 的。

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第 6 (頁碼2) 題

譜系法 (pedigree selection) 通常在 F5 或 F6 世代開始選拔。

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此題考查譜系法 (pedigree selection) 在育種中的應用時機。

敘述分析:
「譜系法 (pedigree selection) 通常在 F5 或 F6 世代開始選拔」:這是 正確 的。

  • 譜系法 是一種選擇方法,育種家會追蹤每一株選優株的譜系,詳細記錄其親本、世代、性狀表現等資訊。
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第 7 (頁碼2) 題

核質互作雄不稔 (cytoplasmic genetic male sterility) 的三系法中, A line, B line 與 R line 皆是 near isogenic lines。

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此題考查細胞質雄性不稔 (CMS) 三系法中各品系的遺傳關係,特別是 near isogenic lines 的概念。

敘述分析:
「核質互作雄不稔 (cytoplasmic genetic male sterility) 的三系法中」:這是 CMS 的基本背景,正確。三系法包含母本 (A line, 雄不稔)、保持系 (B line, 正常雄性,與A line 基因型相同,但細胞質正常) 和恢復系 (R line, 雄性恢復基因,能恢復 A line 的正常雄性)。

「A line, B line 與 R line 皆是 near isogenic lines」:這是 錯誤 的。

  • Near isogenic lines (近等基因系):是指兩個品系之間,除了一個或少數幾個基因位點的等位基因不同外,其餘基因組幾乎是相同的。它們通常是通過連續回交 (backcrossing) 來構建的。
  • A line (母本,雄不稔):細胞質雄性不稔,細胞質基因不同於 B line。
  • B line (保持系):正常細胞質,與 A line 的核基因組相同。B line 的作用是保持 A line 的核基因型,並提供正常的細胞質。A line 和 B line 的主要區別在於細胞質。
  • R line (恢復系):與 A line 和 B line 在細胞質方面相同(通常是 A line 的細胞質),但其核基因組中含有能夠恢復雄性的基因 (restorer genes)。

比較 A, B, R lines:

  • A line vs B line: 主要區別在於細胞質(A 不稔,B 正常)。核基因組非常相似,僅在細胞質上不同。它們可以被視為 near isogenic,但差異在於細胞質基因。
  • A line vs R line: 兩者在細胞質上通常相同(都來自 A line 的細胞質),但 R line 的核基因組含有恢復基因,而 A line 沒有。因此,它們在核基因組的恢復基因位點上存在差異。
  • B line vs R line: B line 是正常細胞質,R line 具有 A line 的細胞質。如果 R line 是由 A line 的恢復基因導入到 A line 的細胞質中構建的,那麼 B line 和 R line 的細胞質就不同。
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第 8 (頁碼2) 題

譜系法 (pedigree selection) 通常在 F5 或 F6 世代開始選拔。

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此題考查譜系法 (pedigree selection) 在育種中的應用時機。

敘述分析:
「譜系法 (pedigree selection) 通常在 F5 或 F6 世代開始選拔」:這是 正確 的。

  • 譜系法 是一種選擇方法,育種家會追蹤每一株選優株的譜系,詳細記錄其親本、世代、性狀表現等資訊。
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第 9 (頁碼2) 題

核質互作雄不稔 (cytoplasmic genetic male sterility) 的三系法中, A line, B line 與 R line 皆是 near isogenic lines。

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此題考查細胞質雄性不稔 (CMS) 三系法中各品系的遺傳關係,特別是 near isogenic lines 的概念。

敘述分析:
「核質互作雄不稔 (cytoplasmic genetic male sterility) 的三系法中」:這是 CMS 的基本背景,正確。三系法包含母本 (A line, 雄不稔)、保持系 (B line, 正常雄性,與A line 基因型相同,但細胞質正常) 和恢復系 (R line, 雄性恢復基因,能恢復 A line 的正常雄性)。

「A line, B line 與 R line 皆是 near isogenic lines」:這是 錯誤 的。

  • Near isogenic lines (近等基因系):是指兩個品系之間,除了一個或少數幾個基因位點的等位基因不同外,其餘基因組幾乎是相同的。它們通常是通過連續回交 (backcrossing) 來構建的。
  • A line (母本,雄不稔):細胞質雄性不稔,細胞質基因不同於 B line。
  • B line (保持系):正常細胞質,與 A line 的核基因組相同。B line 的作用是保持 A line 的核基因型,並提供正常的細胞質。A line 和 B line 的主要區別在於細胞質。
  • R line (恢復系):與 A line 和 B line 在細胞質方面相同(通常是 A line 的細胞質),但其核基因組中含有能夠恢復雄性的基因 (restorer genes)。

比較 A, B, R lines:

  • A line vs B line: 主要區別在於細胞質(A 不稔,B 正常)。核基因組非常相似,僅在細胞質上不同。它們可以被視為 near isogenic,但差異在於細胞質基因。
  • A line vs R line: 兩者在細胞質上通常相同(都來自 A line 的細胞質),但 R line 的核基因組中含有恢復基因,而 A line 沒有。因此,它們在核基因組的恢復基因位點上存在差異。
  • B line vs R line: B line 是正常細胞質,R line 具有 A line 的細胞質。
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第 10 (頁碼2) 題

回交育種中,假使欲導入輪迴親 (recurrent parent) 的特殊性狀是隱性,回交後的世代不進行篩選,應自交一代後使子代中有同質隱性,才可進行篩選。但如果有分子標誌可以辨別該性狀顯隱性之等位基因 (alleles),則可用分子鑑定進行篩選,可省去自交一代再篩選之步驟。

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此題考查回交育種 (backcrossing) 中,導入隱性性狀時的篩選策略,以及分子標誌的應用。

敘述分析:
「回交育種中,假使欲導入輪迴親 (recurrent parent) 的特殊性狀是隱性,回交後的世代不進行篩選,應自交一代後使子代中有同質隱性,才可進行篩選。」

  • 回交育種的目的:是將一個或幾個目標基因 (來自供體親本) 導入到一個優良的輪迴親背景中,同時盡量保留輪迴親的優良性狀。
  • 目標性狀是隱性:假設我們要導入的隱性基因是 'aa'。輪迴親的基因型是 'AA' (假設其沒有此隱性基因,且該基因對輪迴親沒有負面影響)。供體親本含有目標隱性基因,例如 'aa'。
  • 回交過程:
    • 第一代雜交 (BC1):輪迴親 (AA) x 供體親本 (aa) -> F1 (Aa)。
    • 第一次回交 (BC1):F1 (Aa) x 輪迴親 (AA) -> 子代有 AA (50%) 和 Aa (50%)。
    • 不進行篩選:如果我們不篩選,那麼下一代(BC2)的親本將是 AA 和 Aa 的隨機組合。
    • 導入隱性基因 'aa':我們需要篩選出含有 'aa' 的植株。然而,在 BC1 的子代中,沒有 'aa'。在 BC2 的子代中,如果親本是 Aa x AA,則不會產生 aa。如果親本是 Aa x Aa,則會產生 aa。
    • 敘述的關鍵點:「應自交一代後使子代中有同質隱性,才可進行篩選。」
      • 在進行回交的過程中,我們需要不斷地將目標基因(在此是隱性基因 'aa')導入到輪迴親的基因組中。
      • 假設我們已經進行了幾次回交,獲得了含有目標基因的雜合子植株,例如基因型為 AA...Aa...AA。我們要篩選出 'aa'。
      • 如果我們有一個雜合子植株 (例如 Bb),要篩選出隱性純合子 (bb),最直接的方法是讓它自交 (Bb x Bb),這樣會產生 BB, Bb, bb 的後代,其中 bb 就是同質隱性。
      • 但是,在回交育種中,我們通常是將目標基因導入到輪迴親背景中。如果我們希望導入的隱性基因在輪迴親中是稀有的,那麼可能需要經過多次回交和篩選。
      • 敘述提到「回交後的世代不進行篩選」,然後「應自交一代後使子代中有同質隱性,才可進行篩選」。這意味著,在某一代回交後,我們得到了一些植株,它們可能帶有目標隱性基因,但由於輪迴親本身是顯性純合 (AA),我們無法直接觀察到隱性性狀。
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第 11 (頁碼2) 題

蕨類雜交中,antheridiogen 可決定配子體之性別,其中 antheridiogen 是類似 IAA 的植物賀爾蒙,如能適當的調節配子體性別比例,可提高雜交率。

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此題考查蕨類雜交育種中的 antheridiogen 及其作用。

敘述分析:
「蕨類雜交中,antheridiogen 可決定配子體之性別」:這是 正確 的。蕨類植物的生命週期包含世代交替,其中配子體 (gametophyte) 是獨立的生活史階段。許多蕨類植物的配子體會分泌 antheridiogen,這是一種信號分子,用於吸引和決定雄配子體的發育(產生 antheridia,即雄配子囊)。

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第 12 (頁碼2) 題

純系選種法 (Pure line selection) 因有利用到後裔的性狀進行選拔,遺傳力偏低之性狀仍有機會應用。

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此題考查純系選種法 (Pure line selection) 的適用性。

敘述分析:
「純系選種法 (Pure line selection) 因有利用到後裔的性狀進行選拔」:這是 正確 的。純系選種法是從一個雜合族群中,選拔出具有特定優良性狀的單株,然後將其自交,並對其後裔進行性狀評估和篩選。這個過程確實是基於對後裔性狀的觀察和選拔。

「遺傳力偏低之性狀仍有機會應用」:這是 錯誤 的。

  • 遺傳力 (Heritability):是指性狀的表型變異中,由遺傳因素(而非環境因素)所佔的比例。
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第 13 (頁碼2) 題

純系選種法 (Pure line selection) 在第一次選拔時便已挑出可固定性狀之純系,而混合選種法 (mass selection) 通常需要多次選拔循環,來選拔數個純系。

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此題考查純系選種法 (Pure line selection) 和混合選種法 (mass selection) 的比較。

敘述分析:
「純系選種法 (Pure line selection) 在第一次選拔時便已挑出可固定性狀之純系」:這是 錯誤 的。

  • 純系選種法:其核心是從一個雜合族群中,選拔出單株優良個體,然後將其自交,並對其後裔(單子後裔,single seed descent, SSD)進行性狀評估和篩選。這個過程需要 多代 的自交和篩選,才能逐步獲得穩定的純系。在第一次選拔時,挑選出的單株個體(F2 或 F3 世代)通常還是雜合的,其性狀尚未固定。
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第 14 (頁碼2) 題

純系選種法 (Pure line selection) 及混合選種法 (mass selection) 通常包含人為雜交的步驟,以創造有遺傳重組的起始族群。

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此題考查純系選種法 (Pure line selection) 和混合選種法 (mass selection) 是否包含人為雜交步驟。

敘述分析:
「純系選種法 (Pure line selection) 及混合選種法 (mass selection) 通常包含人為雜交的步驟,以創造有遺傳重組的起始族群。」:這是 錯誤 的。

  • 純系選種法:通常是從現有的雜合族群(例如,已經發生了自交或自然雜交的群體)中,選拔單株進行自交和後裔篩選。雖然它的來源可以是雜交後代,但純系選種法 本身 並不包含「人為雜交」作為其核心步驟。它的起始材料通常是已經存在的變異群體。
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第 15 (頁碼2) 題

混合集團法 (Bulk population) 與單子後裔法 (single seed descent) 在雜交後,通常自 F2 到 F4 世代都僅自交收子不進行選拔,其中 bulk population 進行混合採種,儘管這幾個世代族群雖無人擇,但因仍受環境影響,故會包含天擇的環境選拔效果。

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此題考查雜交育種中,Bulk population (混合集團法) 和 Single Seed Descent (SSD, 單子後裔法) 的處理方式,以及環境選擇的影響。

敘述分析:
「混合集團法 (Bulk population) 與單子後裔法 (single seed descent) 在雜交後,通常自 F2 到 F4 世代都僅自交收子不進行選拔」:

  • Bulk population (混合集團法):在 F2 到 F4 世代,將所有植株的種子混合在一起收集(bulk harvest),然後將這些混合的種子用於下一代的種植。在收集種子時,不進行單株的選擇。
  • Single Seed Descent (SSD, 單子後裔法):從 F2 世代開始,每一株植株只收一顆種子,用這顆種子種植下一代的單株。同樣,在收集種子時,不進行表型選擇。
  • 因此,這句話是 正確 的。
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第 1 (頁碼2) 題6 分

請解釋新品種審查之 DUS criteria。

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本題考查植物新品種權保護中的 DUS 測試標準。DUS 是 Distinctness (可區別性), Uniformity (一致性), Stability (穩定性) 的縮寫,是國際上用於評定植物新品種是否具備新穎性、可專屬性 (exclusivity) 的重要標準。

DUS Criteria 的解釋:

  • D - Distinctness (可區別性):

    • 新品種必須與所有已知的、在申請新品種權時已經公開的品種有顯著區別。
    • 這種區別可以通過一個或多個明確的、可觀察的性狀來判斷。
    • 例如,新品種的花色、果實大小、成熟期、抗病性等性狀,必須與現有品種有明顯差異。
    • 區別性必須是清晰、可測量的,並且是遺傳決定的。
  • U - Uniformity (一致性):

    • 新品種的個體在繁殖過程中,其重要性狀的表現必須高度一致。
    • 這意味著,如果新品種是通過無性繁殖(如組織培養、嫁接)獲得的,那麼所有個體在關鍵性狀上應表現相同。
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第 2 (頁碼2) 題14 分

育種重要性狀之遺傳模型評估。(共14分)
假定某園藝作物其花色遺傳的模型為:

基因型表型
W_R_白花
W_rr白花
wwR_粉花
wwrr紅花

a. 請問 W 基因與 R 基因是否有顯性基因上位性 (dominant epistasis) 之情形?如有,何者為上位基因,為什麼?如無,為何沒有上位性? (1分+3分)
b. 請以卡方適合度檢定 (x² test of goodness-of-fit) 計算觀測性狀比與預期性狀比之卡方值,須寫出卡方檢定公式與計算過程 (6分)。
c. 已知 P<0.05 且自由度 (df)=1 時,卡方值為 3.84;當 df=2 時,卡方值為 5.99;當 df=3 時,卡方值為 7.81。依據上述卡方臨界值,請問是否該接受此遺傳模型觀察值與期望值是相合之假說?為什麼? (4分)

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本題考查花色遺傳的遺傳模型判斷、顯性上位性 (dominant epistasis) 的概念,以及卡方適合度檢定 (chi-square test of goodness-of-fit) 的應用。

a. 顯性上位性 (Dominant Epistasis) 的判斷

  • 顯性上位性 (Dominant Epistasis):指某一個基因的顯性等位基因會抑制或掩蓋另一個基因的表達。

  • 判斷依據:在雙基因控制的性狀中,如果出現 9:3:4 或 12:3:1 的表型分離比,則可能存在顯性上位性。

    • 9:3:4 表示:9 顯性 A, 顯性 B (或 A_B_);3 顯性 A, 隱性 b (A_bb);4 隱性 a, 顯性 B 或隱性 a, 隱性 b (aaB_ + aabb)。
    • 12:3:1 表示:12 顯性 A, 顯性 B 或 顯性 A, 隱性 b (A_B_ + A_bb);3 顯性 a, 顯性 B (aaB_);1 隱性 a, 隱性 b (aabb)。
  • 分析題目給定的遺傳模型:

    • 基因型 W_R_ 表現為白花。
    • 基因型 W_rr 表現為白花。
    • 基因型 wwR_ 表現為粉花。
    • 基因型 wwrr 表現為紅花。
  • 推論基因功能:

    • 觀察 W_R_ 和 W_rr 的基因型,它們都包含顯性 W 等位基因,並且都表現為白花。這表明 W 基因的顯性等位基因 W 對花色有決定性作用,使其呈現白色。
    • 當 W 基因是隱性 (ww) 時,花色才由 R 基因決定。
      • wwR_ 表現為粉花。
      • wwrr 表現為紅花。
    • 這表明 R 基因在 W 基因隱性時起作用,R_ 表現為粉花,rr 表現為紅花。
  • 判斷上位性:

    • 顯性基因 W 能夠決定花色為白色,而無視 R 基因的狀態(無論 R 是 R_ 還是 rr)。
    • 這符合顯性上位性的定義:W 基因的顯性等位基因 W 對 R 基因的表達具有上位性 (epistasis),決定了花色為白色。
    • 因此,W 基因是上位基因 (epistatic gene),R 基因是下位基因 (hypostatic gene)。
  • 預期的分離比:

    • 如果親本是 WwRr x WwRr,則:
      • W_ 基因型 (白花) 的比例為 9/16 + 3/16 = 12/16。
      • ww 基因型 (粉花或紅花) 的比例為 3/16 + 1/16 = 4/16。
      • 在 ww 基因型中,R_ (粉花) 佔 3/4,rr (紅花) 佔 1/4。
      • 因此,預期的表型分離比為:白花 (W_) : 粉花 (wwR_) : 紅花 (wwrr) = 12 : 3 : 1。
  • 回答問題:

    • 是否有顯性基因上位性? 是。
    • 何者為上位基因? W 基因。
    • 為什麼? 因為 W 基因的顯性等位基因 W 可以抑制 R 基因的表達,使得所有含有 W_ 基因型的個體都表現為白色花,而 R 基因的影響(粉花或紅花)僅在 ww 基因型中才能體現。

b. 卡方適合度檢定 (chi-square test of goodness-of-fit)

  • 卡方檢定公式:
    χ2=∑i=1k(Oi−Ei)2Ei\chi^2 = \sum_{i=1}^{k} \frac{(O_i - E_i)^2}{E_i}
    其中:

    • OiO_i 是第 i 組的觀察值 (observed count)。
    • EiE_i 是第 i 組的期望值 (expected count)。
    • kk 是組別的數量。
  • 計算步驟:

    1. 確定預期分離比和總數:
      根據 a. 的推論,預期的表型分離比為 12 (白花) : 3 (粉花) : 1 (紅花)。
      總比例份數 = 12 + 3 + 1 = 16。
      總觀察值 (Total observed progeny) = 10,756 (來自考古題三的總數,這裡假設題目是延續使用此總數,若無則依據題目實際提供總數。題目二沒有提供總數,所以這裡使用考古題三的總數 10756 作為範例。如果題目二沒有提供總數,則此處計算無法進行,需以題目實際資訊為準。 假設題目二也提供類似的數據,例如總數為 N。在此我們假設總數為 N,並計算期望值比例。)
      實際題目二沒有提供總數,且也沒有提供觀察值。因此,無法計算卡方值。
      請注意:此題目的 b 部分,如果沒有提供觀察值 (observed counts) 和總數,則無法進行計算。
      假設題目提供了一組觀察值,例如:白花 8000, 粉花 2000, 紅花 756,總計 10756。
      • 白花 (W_) 觀察值 O1=8000O_1 = 8000
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