109 年 國立成功大學微生物及免疫學研究所甲組《免疫學》

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第 1 題

Please read the abstract and answer the following questions:

Bile acids are abundant in the mammalian gut, where they undergo bacteria-mediated transformation to generate a large
pool of bioactive molecules. Although bile acids are known to affect host metabolism, cancer progression and innate
immunity, it is unknown whether they affect adaptive immune cells such as T helper cells that express IL-17a (TH17
cells) or regulatory T cells (Treg cells). Here we screen a library of bile acid metabolites and identify two distinct
derivatives of lithocholic acid (LCA), 3-oxoLCA and isoalloLCA, as T cell regulators in mice. 3-OxoLCA inhibited the
differentiation of TH17 cells by directly binding to the key transcription factor retinoid-related orphan receptor-yt
(RORyt) and isoalloLCA increased the differentiation of Treg cells through the production of mitochondrial reactive
oxygen species (mitoROS), which led to increased expression of FOXP3. The isoalloLCA-mediated enhancement of
Treg cell differentiation required an intronic Foxp3 enhancer, the conserved noncoding sequence (CNS) 3; this represents
a mode of action distinct from that of previously identified metabolites that increase Treg cell differentiation, which
require CNS1. The administration of 3-oxoLCA and isoalloLCA to mice reduced TH17 cell differentiation and increased
Treg cell differentiation, respectively, in the intestinal lamina propria. Our data suggest mechanisms through which bile
acid metabolites control host immune responses, by directly modulating the balance of TH17 and Treg cells. (Nature.
2019 Dec;576(7785):143-148.)

a. Please briefly describe what you know about TH17 cells and Treg cells. (10%)
b. Please briefly describe key transcription factors responsible for differentiation of TH1, TH2, TH17 and Treg cells. (8%)
c. Please briefly describe what you know about intestinal lamina propria. (7%)
d. Please briefly discuss the distinctive features of mucosal immune system (10%)
e. In your opinion, what are the contributions of this research? (10%)

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這一題的完整詳解

這題主要在探討腸道菌群代謝物(膽汁酸衍生物)對適應性免疫細胞(TH17 和 Treg 細胞)的影響,以及其在調節免疫反應中的作用。

(a) TH17 細胞與 Treg 細胞的描述

  • TH17 細胞 (T helper 17 cells):

    • 是一類輔助型 T 細胞 (T helper cells),以分泌細胞激素 IL-17a 為主要特徵。
    • 在抵抗細胞外病原體(特別是細菌和真菌)感染中扮演關鍵角色。
    • 過度活化或失調與多種自體免疫疾病(如類風濕性關節炎、多發性硬化症、乾癬等)的發生發展有關。
    • 其分化主要受 TGF-β\beta、IL-6、IL-21、IL-23 等細胞因子誘導。
    • 關鍵轉錄因子是 RORγ\gammat (Retinoic acid receptor-related orphan receptor gamma t)。
  • Treg 細胞 (Regulatory T cells):

    • 是一類免疫調節細胞,主要功能是抑制過度的免疫反應,維持免疫耐受,防止自體免疫疾病的發生。
    • 其標誌性細胞表面分子為 CD25 (IL-2 受體 α\alpha 鏈),細胞內標誌性轉錄因子是 FOXP3 (Forkhead box P3)。
    • Treg 細胞通過多種機制發揮免疫抑制作用,包括分泌免疫抑制性細胞因子(如 IL-10、TGF-β\beta)、直接與抗原呈遞細胞 (APC) 互動、消耗 IL-2 等。
    • 分化機制多樣,包括中樞性 Treg (nTreg),在胸腺中發育;外周性 Treg (iTreg),在外周免疫器官中,在特定環境下(如腸道)由 naive T 細胞分化而來。
    • 文章中提到,isoalloLCA 透過增加 mitoROS,進而增加 FOXP3 表達,促進 Treg 分化,且此過程需要 intronic Foxp3 enhancer (CNS3)。

【答案】TH17 細胞是分泌 IL-17a 的輔助 T 細胞,主要抵抗細胞外病原體,與自體免疫疾病有關;Treg 細胞是免疫調節細胞,標誌為 CD25 和 FOXP3,主要維持免疫耐受,抑制過度免疫反應。

(b) TH1, TH2, TH17 及 Treg 細胞分化的關鍵轉錄因子

  • TH1 細胞:主要由 STAT4 和 T-bet (T-box expressed in T cells) 調控。T-bet 是驅動 TH1 分化的關鍵轉錄因子。
  • TH2 細胞:主要由 STAT6 和 GATA3 調控。GATA3 是驅動 TH2 分化的關鍵轉錄因子。
  • TH17 細胞:主要由 STAT3 和 RORγ\gammat (Retinoic acid receptor-related orphan receptor gamma t) 調控。RORγ\gammat 是驅動 TH17 分化的關鍵轉錄因子。
  • Treg 細胞:關鍵轉錄因子是 FOXP3 (Forkhead box P3)。FOXP3 的表達是 Treg 細胞功能和分化的必要條件。

【答案】TH1 細胞:T-bet;TH2 細胞:GATA3;TH17 細胞:RORγ\gammat;Treg 細胞:FOXP3。

(c) 腸道黏膜固有層 (intestinal lamina propria) 的描述

  • 腸道黏膜固有層是位於上皮細胞層下方,緊鄰腸腔的一層結締組織。
  • 它是腸道免疫系統的重要組成部分,富含各種免疫細胞,包括 T 細胞、B 細胞、漿細胞、樹突狀細胞
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第 2 題

The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2019 was just awarded jointly to William G. Kaelin Jr, Sir Peter J.
Ratcliffe and Gregg L. Semenza for their important findings of how cells sense and adapt to oxygen availability.
a. Please briefly describe about this important finding. (10%)
b. Interestingly, increase of oxygen consumption is important for microbicidal activity of phagocytes. Please discuss
what you know about this process. (20%)

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這題主要探討 2019 年諾貝爾生理學或醫學獎的核心發現,即細胞如何感知氧氣並對其作出反應,以及這個機制在吞噬細胞殺滅微生物中的作用。

(a) 2019 年諾貝爾獎重要發現的描述

2019 年的諾貝爾生理學或醫學獎授予 William G. Kaelin Jr, Sir Peter J. Ratcliffe 和 Gregg L. Semenza,以表彰他們發現了細胞如何感知氧氣並適應氧氣可用性的機制。

核心發現包括:

  1. 氧氣感應機制:

    • HIF (Hypoxia-Inducible Factor) 的調控:該研究揭示了 HIF 蛋白家族是細胞感知氧氣的核心。HIF 是一個異二聚體轉錄因子,由一個 HIF-α\alpha 亞基和一個 HIF-β\beta 亞基組成。
    • VHL 蛋白和脯氨醯羥化酶 (PHDs):在正常氧氣濃度 (normoxia) 下,細胞內的脯氨醯羥化酶 (PHDs) 會利用氧氣作為輔因子,將 HIF-α\alpha 亞基上的特定脯氨酸殘基羥基化。
    • VHL 蛋白介導的降解:被羥基化的 HIF-α\alpha 亞基會被 VHL (Von Hippel-Lindau) 腫瘤抑制蛋白識別,並通過泛素-蛋白酶體途徑降解。
    • 缺氧誘導的 HIF 穩定:在低氧 (hypoxia) 條件下,PHDs 的活性降低,HIF-α\alpha 亞基不再被有效羥基化,從而逃避免受 VHL 蛋白的降解。穩定的 HIF-α\alpha 亞基隨後會與 HIF-β\beta 亞基結合,形成有活性的 HIF 複合物。
  2. 氧氣適應機制:

    • 基因表達調控:活性的 HIF 複合物會進入細胞核,結合到細胞內多個基因的啟動子區域,調節這些基因的表達。
    • 生理響應:HIF 誘導的基因產物能幫助細胞適應低氧環境,例如:
      • 促進血管新生 (angiogenesis),增加氧氣供應(如通過 VEGF 的表達)。
      • 促進紅細胞生成 (erythropoiesis),增加血液攜氧能力(如通過促紅細胞生成素 EPO 的表達)。
      • 改變代謝途徑,從有氧代謝轉向無氧代謝,以在缺氧時維持能量供應。

總之,這項發現闡明了一個從氧氣感應到基因表達調控的完整通路,解釋了細胞和生物體如何應對氧氣水平的變化,這對於生理學、病理學(特別是癌症和缺血性疾病)具有極其重要的意義。

【答案】2019 年諾貝爾獎發現了細胞感知氧氣的機制,主要通過 HIF 蛋白家族。在正常氧氣下,HIF-α\alpha 被 PHDs 羥基化後由 VHL 蛋白降解;在缺氧時,HIF-α\alpha 穩定並與 HIF-β\beta 結合,形成 HIF 轉錄因子,誘導一系列基因表達,幫助細胞適應缺氧。

(b) 吞噬細胞殺滅微生物過程中氧氣消耗的重要性

吞噬細胞(如巨噬細胞、中性粒細胞)是先天免疫系統的重要組成部分,它們通過吞噬作用 (phagocytosis) 清除病原體。在殺滅微生物的過程中,氧氣的消耗(特別是透過「呼吸爆發」)至關重要。這個過程主要與「呼吸爆發」(respiratory burst) 或「氧化爆發」(oxidative burst) 有關。

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第 3 題

What are the potential requirements for development of autoimmune disease? (10%)

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自體免疫疾病的發生是多種因素相互作用的複雜結果,通常需要以下幾個關鍵要素的結合:

  1. 遺傳易感性 (Genetic Predisposition):

    • 某些基因型會增加個體患自體免疫疾病的風險。最經典的例子是人類白血球抗原 (HLA) 基因。HLA 分子參與抗原呈遞,特定的 HLA 等位基因可能更有效地結合並呈遞自身抗原給 T 細胞,從而引發自身免疫反應。
    • 除了 HLA,其他基因(如細胞因子基因、免疫調節分子基因、信號傳導分子基因等)的變異也可能影響免疫系統的調節,增加自體免疫的風險。
  2. 環境觸發因素 (Environmental Triggers):

    • 感染 (Infections):許多自體免疫疾病的發作與感染有關。病原體可能通過幾種方式觸發自身免疫:
      • 分子模擬 (Molecular Mimicry):病原體的抗原與自身抗原結構相似,免疫系統對病原體的反應交叉攻擊自身組織。
      • 旁觀者激活 (Bystander Activation):感染引起的局部炎症和組織損傷會釋放大量自身抗原,並激活免疫細胞,即使這些免疫細胞最初並非針對自身抗原,也可能被誘導發生自身免疫。
      • 改變自身抗原 (Epitope Spreading):感染可能導致自身抗原的結構改變或暴露,引起更廣泛的自身免疫反應。
      • 改變自身抗原的表觀遺傳學修飾。
    • 毒素和化學物質 (Toxins and Chemicals):某些環境毒素(如矽塵、溶劑、藥物)可能損害組織,暴露自身抗原,或直接影響免疫細胞功能,誘發自體免疫。
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第 4 題

Please discuss how cancer cells may escape from immunosurveillance. (15%)

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腫瘤免疫逃逸 (Tumor Immune Evasion) 是腫瘤細胞為了在宿主體內生存和發展而發展出的一系列策略。腫瘤免疫監控 (Tumor Immuno-surveillance) 指的是免疫系統識別並清除早期腫瘤細胞的能力。腫瘤細胞通過多種機制逃脫免疫監視,主要可以歸納為以下幾類:

  1. 腫瘤抗原的表達或性質改變 (Alteration of Tumor Antigen Expression):

    • 抗原丟失 (Antigen Loss):腫瘤細胞可能通過突變或表觀遺傳學改變,停止表達識別它們的腫瘤特異性抗原 (TSA) 或腫瘤相關抗原 (TAA),從而「隱藏」自己。
    • 抗原呈遞缺陷 (Defects in Antigen Presentation):腫瘤細胞可能下調或丟失主要組織相容性複合體 (MHC) 分子(特別是 MHC Class I),導致細胞毒性 T 細胞 (CTL) 無法識別和殺傷腫瘤細胞。
    • 抗原表位逃逸 (Epitope Escape):腫瘤細胞可能只表達部分腫瘤抗原的表位,或者這些表位可能被免疫系統識別為「自身」,從而產生免疫耐受。
  2. 免疫抑制微環境的建立 (Establishment of an Immunosuppressive Tumor Microenvironment, TME):

    • 免疫抑制性細胞因子分泌:腫瘤細胞及其微環境中的細胞(如腫瘤相關巨噬細胞 TAMs, 腫瘤相關中性粒細胞 TANs)可以分泌免疫抑制性細胞因子,如 TGF-β\beta、IL-10、VEGF 等,這些細胞因子會抑制 T 細胞的活化和功能,促進免疫抑制性細胞(如 Treg 細胞、MDSCs)的募集和功能。
    • 免疫抑制性細胞的招募與激活:
      • 調節性 T 細胞 (Treg):富集於腫瘤微環境,通過抑制 CTL 和其他抗腫瘤免疫細胞來發揮作用。
      • 骨髓源性抑制細胞 (MDSCs):能夠抑制 T 細胞、NK 細胞和 DC 的功能。
      • 腫瘤相關巨噬細胞 (TAMs):腫瘤微環境中的 TAMs 通常表現為 M2 表型,具有免疫抑制和促進腫瘤生長、血管生成、轉移的作用。
    • 代謝重塑:腫瘤細胞和免疫細胞在微環境中競爭營養物質(如葡萄糖、氨基酸),改變微環境的代謝狀態,從而抑制免疫細胞的功能。例如,腫瘤細胞消耗大量葡萄糖,導致 T 細胞缺乏能量。
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